246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0053 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0053  periplasmic binding protein  100 
 
 		 298 aa  585  1e-166  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0555  periplasmic binding protein  32.55 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2132  periplasmic binding protein  32.4 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334395 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2313  periplasmic binding protein  30.24 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1499  periplasmic binding protein  35.21 
 
 		 382 aa  85.9  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1713  periplasmic binding protein  31.44 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.917384  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0038  periplasmic binding protein  27.49 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000039007  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  31.34 
 
 		 483 aa  83.2  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  27.37 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  38.24 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  26.67 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3106  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compount-binding protein, putative  28.81 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  26.24 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1923  periplasmic binding protein  30.04 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0798  periplasmic binding protein  28.41 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  28.68 
 
 		 351 aa  75.5  0.0000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  29.41 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1460  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.77673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  27.7 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2443  periplasmic binding protein  29.62 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000910512  normal  0.674129 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  26.59 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2169  periplasmic binding protein  29.84 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000287241  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0038  periplasmic binding protein  23.29 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000608499  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  34.87 
 
 		 478 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  26.37 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  23.53 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  26.62 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2234  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  23.53 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.281475  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  28.62 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  25.47 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1896  periplasmic binding protein  25.42 
 
 		 316 aa  67  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000791854  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  25.48 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  25.37 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  23.4 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0266  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  23.89 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3079  periplasmic binding protein  37.27 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498127  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  21.99 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  24.09 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  31.43 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  31.1 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1578  putative vitamin B12 transport protein  29.92 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  27.08 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2416  periplasmic binding protein  25.72 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0647  periplasmic binding protein  32.69 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0138  periplasmic binding protein  26.62 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  24.91 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0632  periplasmic binding protein  32.69 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0274  periplasmic binding protein  25.42 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.880805  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2782  periplasmic binding protein  28.63 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.21111  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2757  periplasmic binding protein  25.17 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  31.25 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  35.34 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  32.37 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  24.91 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  25.71 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  28.09 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  23.24 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  23.24 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2207  periplasmic binding protein  26.94 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00190614  normal  0.612299 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1187  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  23.6 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  27.05 
 
 		 688 aa  59.3  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0840  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  27.65 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154461  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5751  periplasmic binding protein  30.04 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48327  hitchhiker  0.000000000101276 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  27.21 
 
 		 689 aa  58.2  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2664  periplasmic binding protein  34.29 
 
 		 303 aa  57  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  24.72 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  28.49 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  24.03 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1321  periplasmic binding protein  31.21 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77394  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1231  periplasmic binding protein  27.01 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.432846 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1632  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  26.87 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0693  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  26.87 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.387352  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5781  ABC Fe3+siderophore/cobalamin transporter, periplasmic ligand binding protein  26.5 
 
 		 304 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2320  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  26.87 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169217  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2967  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  26.87 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956046  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  28.77 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0090  periplasmic binding protein  27.93 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.479217  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0373  periplasmic binding protein  37.5 
 
 		 723 aa  56.6  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.390993 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0661  periplasmic binding protein  26.22 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3024  periplasmic binding protein  28.74 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2550  periplasmic binding protein  30.92 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1041  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  26.87 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111406  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1196  putaive vitamin B12 transport protein  26.87 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2621  periplasmic binding protein  43.37 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1596  periplasmic binding protein  30.07 
 
 		 339 aa  55.8  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3615  periplasmic binding protein  31.3 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3574  periplasmic binding protein  30.77 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136612 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3729  periplasmic binding protein  29.15 
 
 		 312 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685211  hitchhiker  0.00414028 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1839  periplasmic binding protein  26.5 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.052226  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2455  periplasmic binding protein  26.5 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2450  periplasmic binding protein  26.5 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.962038  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3666  periplasmic binding protein  32.33 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.4902  normal  0.035512 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0218  periplasmic binding protein  33.82 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.311188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1001  periplasmic binding protein  32.43 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  24.56 
 
 		 374 aa  54.3  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0231  periplasmic binding protein  36.46 
 
 		 723 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.999715  normal  0.640564 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1035  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  26.49 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439367  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3733  periplasmic binding protein  26.12 
 
 		 321 aa  53.9  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  27.54 
 
 		 333 aa  53.9  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3547  periplasmic binding protein  29.73 
 
 		 304 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>