More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0034 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0034  PfkB domain protein  100 
 
 		 308 aa  622  1e-177  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0204225  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  35.45 
 
 		 295 aa  159  4e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  33.44 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  30.65 
 
 		 309 aa  153  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  28.05 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  32.91 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  27.03 
 
 		 306 aa  132  7.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  29.19 
 
 		 301 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  25.97 
 
 		 304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  28.52 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  27.74 
 
 		 290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  28.24 
 
 		 307 aa  127  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  27.21 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  30.72 
 
 		 302 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  32.07 
 
 		 310 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6387  ribokinase  32.58 
 
 		 309 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  28.95 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  35.76 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7361  ribokinase  32.29 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  27.22 
 
 		 345 aa  123  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  30.99 
 
 		 293 aa  122  7e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  28.81 
 
 		 308 aa  122  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  28.81 
 
 		 308 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  28.81 
 
 		 308 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  32.37 
 
 		 305 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  24.75 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  24.75 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  28.67 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  26.32 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1048  ribokinase  30.92 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  29.97 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  28.01 
 
 		 305 aa  119  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  30.1 
 
 		 297 aa  119  6e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  31.68 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  24.92 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  26.8 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  25.66 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  29.8 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  29.28 
 
 		 307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  28.43 
 
 		 312 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  29.9 
 
 		 297 aa  116  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  28.09 
 
 		 306 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4158  ribokinase  33.89 
 
 		 301 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0695289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4447  ribokinase  33 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  28.94 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  28.67 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  29.32 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  31.33 
 
 		 304 aa  113  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  29.74 
 
 		 308 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  29.51 
 
 		 310 aa  112  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0252  ribokinase  30.56 
 
 		 307 aa  112  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  27.09 
 
 		 310 aa  112  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0259  ribokinase  31.1 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00211116  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  28.01 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  28 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  28.52 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  30.32 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  28.57 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  28.34 
 
 		 305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1888  PfkB  31.23 
 
 		 323 aa  109  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.389987  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  29.49 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  26.38 
 
 		 307 aa  109  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  29.39 
 
 		 313 aa  108  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  26.76 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  29.18 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  30.56 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  28.95 
 
 		 309 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  28.95 
 
 		 309 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  28.95 
 
 		 314 aa  106  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  28.95 
 
 		 314 aa  106  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  28.95 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  28.95 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  28.95 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1119  ribokinase  28.71 
 
 		 302 aa  106  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970785  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  28.29 
 
 		 309 aa  106  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4200  ribokinase  31.15 
 
 		 326 aa  106  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  28.52 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  26.58 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  28.95 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  27.95 
 
 		 298 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0349  putative ribokinase  27.39 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  29.77 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  28.19 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  28.04 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  28.52 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  27.85 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  28.19 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  28.72 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  28.71 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  28.52 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  28.2 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  28.47 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  28.38 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  29.43 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  28.2 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  28.2 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  27.3 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  28.2 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  28.72 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  31.1 
 
 		 319 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>