More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0009 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
544 aa  1124  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  90.07 
 
 
544 aa  1008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  43.05 
 
 
520 aa  416  1e-115  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  36.97 
 
 
534 aa  322  1e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  36.48 
 
 
535 aa  307  4e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  35.69 
 
 
524 aa  291  2e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  36.12 
 
 
540 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  33.09 
 
 
545 aa  280  5e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  35.92 
 
 
540 aa  280  7e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  34.06 
 
 
532 aa  279  1e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.84044e-11  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  35.92 
 
 
540 aa  276  8e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  35.73 
 
 
538 aa  274  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  34.5 
 
 
520 aa  273  7e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  33.66 
 
 
531 aa  263  9e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  33.15 
 
 
526 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4041  extracellular solute-binding protein family 5  33.27 
 
 
543 aa  259  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457031  normal  0.172562 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0699  extracellular solute-binding protein family 5  33.59 
 
 
590 aa  259  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  32.97 
 
 
526 aa  257  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  32.97 
 
 
526 aa  257  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  32.97 
 
 
526 aa  257  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  32.97 
 
 
526 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  33.15 
 
 
541 aa  256  7e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  6.66118e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  33.33 
 
 
535 aa  255  1e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  33.15 
 
 
535 aa  253  8e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  33.46 
 
 
538 aa  253  8e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  33.85 
 
 
532 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3535  extracellular solute-binding protein family 5  33.99 
 
 
544 aa  251  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269906  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  32.78 
 
 
535 aa  251  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  34.17 
 
 
521 aa  250  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  34.17 
 
 
521 aa  249  6e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  34.17 
 
 
521 aa  249  6e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  34.17 
 
 
521 aa  249  6e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  34.17 
 
 
521 aa  249  6e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  32.77 
 
 
535 aa  249  8e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  32.04 
 
 
535 aa  249  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  32.04 
 
 
535 aa  249  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  32.04 
 
 
535 aa  249  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  32.04 
 
 
535 aa  249  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  32.04 
 
 
535 aa  249  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  32.04 
 
 
535 aa  249  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  32.04 
 
 
535 aa  249  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  32.04 
 
 
535 aa  248  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  32.96 
 
 
535 aa  248  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6676  extracellular solute-binding protein family 5  36.83 
 
 
539 aa  248  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479975  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  32.31 
 
 
509 aa  247  5e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  31.78 
 
 
528 aa  246  6e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  3.82125e-05  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  32.96 
 
 
535 aa  246  7e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  32.42 
 
 
535 aa  246  8e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  32.42 
 
 
535 aa  246  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  32.42 
 
 
535 aa  246  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  32.85 
 
 
530 aa  245  2e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  32 
 
 
538 aa  243  5e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  33.72 
 
 
535 aa  241  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  32.37 
 
 
531 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  33.59 
 
 
502 aa  240  6e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3091  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.07 
 
 
528 aa  239  7e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2283  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.07 
 
 
528 aa  239  7e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2005  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  32.07 
 
 
528 aa  239  7e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0091  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  32.07 
 
 
528 aa  239  7e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0584  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  32.07 
 
 
528 aa  239  7e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.542939  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0422  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.07 
 
 
528 aa  239  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.537378  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0402  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  32.07 
 
 
528 aa  239  9e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882442  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2816  extracellular solute-binding protein  32.87 
 
 
545 aa  239  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.54552  normal  0.0589435 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2972  extracellular solute-binding protein  32.64 
 
 
531 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  32.25 
 
 
538 aa  238  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  31.78 
 
 
531 aa  237  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  31.93 
 
 
531 aa  238  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4250  peptide ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.57 
 
 
528 aa  236  1e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.146199 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0183  extracellular solute-binding protein  30.95 
 
 
532 aa  234  2e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  32.3 
 
 
506 aa  234  2e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  31.51 
 
 
532 aa  235  2e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  31.73 
 
 
531 aa  235  2e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  32.19 
 
 
594 aa  234  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  30.53 
 
 
505 aa  234  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0399  extracellular solute-binding protein family 5  32.69 
 
 
546 aa  234  4e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3498  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  30.76 
 
 
586 aa  233  7e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.690705 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  30.95 
 
 
520 aa  233  8e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0468  extracellular solute-binding protein family 5  31.51 
 
 
528 aa  233  8e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3754  extracellular solute-binding protein family 5  31.93 
 
 
542 aa  233  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.884226 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0381  extracellular solute-binding protein  32.23 
 
 
531 aa  233  9e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.265556 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2938  extracellular solute-binding protein  32.02 
 
 
531 aa  233  9e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3755  extracellular solute-binding protein family 5  31.24 
 
 
547 aa  232  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09061  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, peptide-binding protein  29.82 
 
 
538 aa  232  2e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.593779  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  33.14 
 
 
526 aa  232  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6266  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  31.82 
 
 
531 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.857663  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2923  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 
534 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48060  extracellular solute-binding protein  29.78 
 
 
525 aa  231  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  31.36 
 
 
531 aa  231  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2309  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 
534 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  32.86 
 
 
505 aa  231  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  32.01 
 
 
523 aa  230  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  31.81 
 
 
544 aa  229  7e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  32.6 
 
 
537 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0182  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  31.74 
 
 
542 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  31.94 
 
 
538 aa  228  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  31.88 
 
 
541 aa  227  4e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  34 
 
 
528 aa  227  5e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  32.57 
 
 
541 aa  226  6e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  31.9 
 
 
521 aa  226  7e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  31.47 
 
 
520 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>