More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0002 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 
379 aa  768    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  28.88 
 
 
378 aa  156  7e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  28.61 
 
 
378 aa  155  9e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  28.61 
 
 
378 aa  151  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.24 
 
 
369 aa  149  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  28.01 
 
 
374 aa  148  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.3 
 
 
367 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3032  DNA polymerase III, beta subunit  28.2 
 
 
366 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  27.51 
 
 
390 aa  140  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  27.58 
 
 
393 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  27.58 
 
 
393 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.8 
 
 
378 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0002  DNA polymerase III subunit beta  27.85 
 
 
372 aa  139  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  25.67 
 
 
367 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.93 
 
 
365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.6 
 
 
374 aa  136  5e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0686  DNA polymerase III, beta subunit  26.43 
 
 
366 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0347365  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3543  DNA polymerase III subunit beta  27.13 
 
 
372 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  27.86 
 
 
382 aa  135  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0662  DNA polymerase III, beta subunit  26.16 
 
 
366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000326321  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.39 
 
 
369 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.59 
 
 
367 aa  133  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000744787  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  25.53 
 
 
379 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  25.53 
 
 
379 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.53 
 
 
379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.53 
 
 
379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.15 
 
 
365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  25.51 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0019  DNA polymerase III, beta subunit  25.43 
 
 
378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.84 
 
 
373 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0861969  hitchhiker  0.000000929484 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2554  DNA polymerase III subunit beta  28.86 
 
 
368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376427  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.17 
 
 
378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.86 
 
 
368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0846842  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.86 
 
 
368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.481367  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.53 
 
 
379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3240  DNA polymerase III subunit beta  28.61 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.551286  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4118  DNA polymerase III, beta subunit  24.56 
 
 
368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.000107371  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  25.53 
 
 
379 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.53 
 
 
379 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0102  DNA polymerase III subunit beta  28.32 
 
 
367 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.78 
 
 
367 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.186277  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.57 
 
 
368 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0232451  hitchhiker  0.0000583688 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.57 
 
 
368 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.011531  normal  0.38726 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3183  DNA polymerase III subunit beta  28.57 
 
 
368 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00267181  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.57 
 
 
368 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0645593  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0002  DNA polymerase III subunit beta  28.32 
 
 
367 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.18752  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.32 
 
 
367 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.645907  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2236  DNA polymerase III subunit beta  28.32 
 
 
367 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0300  DNA polymerase III subunit beta  28.32 
 
 
367 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0088  DNA polymerase III subunit beta  28.32 
 
 
367 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2849  DNA polymerase III subunit beta  28.32 
 
 
367 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  25.39 
 
 
381 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.54 
 
 
375 aa  129  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  25.39 
 
 
381 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  26.03 
 
 
394 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.07 
 
 
368 aa  129  9.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0963742  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.65 
 
 
373 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0823829  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.52 
 
 
377 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.87 
 
 
381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  28.57 
 
 
365 aa  129  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  0.0000599685 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.52 
 
 
377 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3705  DNA polymerase III subunit beta  26.72 
 
 
372 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0432616 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3047  DNA polymerase III subunit beta  27.85 
 
 
371 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.579013  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.72 
 
 
387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.53 
 
 
372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.65 
 
 
378 aa  127  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1513  DNA polymerase III, beta subunit  25.48 
 
 
381 aa  127  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000166783  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.44 
 
 
373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  25.27 
 
 
377 aa  127  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.49 
 
 
372 aa  127  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201968  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.49 
 
 
367 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  27.11 
 
 
377 aa  125  9e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.2 
 
 
372 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.87 
 
 
381 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  26.52 
 
 
385 aa  124  3e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.62 
 
 
372 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00413752  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0231  DNA polymerase III, beta subunit  21.96 
 
 
367 aa  123  4e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000874025  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  23.82 
 
 
377 aa  123  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00003  DNA polymerase III, beta subunit  24.33 
 
 
366 aa  124  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000112219  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.51 
 
 
372 aa  123  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.474691  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.82 
 
 
368 aa  123  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0185617  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4145  DNA polymerase III, beta subunit  24.12 
 
 
368 aa  123  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.258487 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2834  DNA polymerase III subunit beta  25.93 
 
 
372 aa  123  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2506  DNA polymerase III subunit beta  24.53 
 
 
366 aa  122  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000126636  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.12 
 
 
368 aa  122  8e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.13 
 
 
372 aa  122  9e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.205747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2239  DNA polymerase III subunit beta  26.39 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0102545  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.87 
 
 
372 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0535  DNA polymerase III, beta subunit  23.97 
 
 
366 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.36 
 
 
380 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.49 
 
 
367 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243689  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4461  DNA polymerase III subunit beta  27.49 
 
 
367 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0591962  normal  0.0989887 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.6 
 
 
372 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.73 
 
 
372 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0730917  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.14 
 
 
388 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2688  DNA polymerase III, beta subunit  26.42 
 
 
369 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0188688  hitchhiker  0.00114167 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0007  DNA-directed DNA polymerase  25.87 
 
 
366 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000118658  unclonable  0.000000000121971 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0011  DNA polymerase III subunit beta  28.41 
 
 
367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.12322  hitchhiker  0.00002839 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.91 
 
 
367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.41 
 
 
367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.123405  normal  0.0743731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>