299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_R0024 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_R0024  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000092316  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0024  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000167821  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0036  tRNA-Arg  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.269516  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0011  tRNA-Arg  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0065  tRNA-Arg  90.67 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.68192e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0033  tRNA-Arg  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0022  tRNA-Arg  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000850812  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0022  tRNA-Arg  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000177446  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0007  tRNA-Arg  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.688543  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0001  tRNA-Arg  96.08 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000193558  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0037  tRNA-Arg  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000022611  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0018  tRNA-Arg  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  0.24905 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0023  tRNA-Arg  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000416946  unclonable  9.7747e-19 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0038  tRNA-Arg  89.04 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.495611  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0023  tRNA-Arg  88.16 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0598975  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0004  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0057  tRNA-Arg  88 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00400024  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0033  tRNA-Arg  88.31 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000397698  normal  0.298215 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0018  tRNA-Arg  88.31 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000528633  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0098  tRNA-Arg  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237653  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt24  tRNA-Arg  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt24  tRNA-Arg  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0009  tRNA-Arg  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0045  tRNA-Arg  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000178577  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0049  tRNA-Arg  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0041  tRNA-Arg  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0106412  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0044  tRNA-Arg  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0069  tRNA-Arg  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0196822  normal  0.911508 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0037  tRNA-Arg  88.16 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0035  tRNA-Arg  87.5 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0037  tRNA-Arg  86.84 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0624  tRNA-Arg  89.83 
 
 
79 bp  69.9  0.00000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00406719  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0041  tRNA-Arg  86.67 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.225323  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0059  tRNA-Arg  86.67 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60210  tRNA-Arg  86.49 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0006  tRNA-Arg  87.84 
 
 
73 bp  67.9  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0483173  normal  0.730879 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0063  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540821  normal  0.0441285 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R55  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0023  tRNA-Arg  86.3 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0040  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.138426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3506  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0022  tRNA-Arg  88.52 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0059  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413322 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0017  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.915469  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0039  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.247045  normal  0.262143 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0055  tRNA-Arg  86.76 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000183529  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t45  tRNA-Arg  85.33 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0584269  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0053  tRNA-Arg  88.14 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376557  hitchhiker  8.69297e-22 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA31  tRNA-Arg  85.33 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.977486  normal  0.953507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0007  tRNA-Arg  88.89 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.818817  hitchhiker  0.0000144488 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t50  tRNA-Arg  85.71 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294768  normal  0.033693 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0043  tRNA-Arg  86.49 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0685094  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0005  tRNA-Arg  86.49 
 
 
73 bp  60  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41340  tRNA-Arg  85.71 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.383585 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  92.68 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000884624  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  92.68 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0012  tRNA-Trp  87.69 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000299257  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  92.68 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.581803  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0037  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0048  tRNA-Arg  86.89 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00527947  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0049  tRNA-Arg  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02200  tRNA-Arg  86.3 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0023  tRNA-Arg  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2137  tRNA-Arg  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00960478  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0003  tRNA-Arg  86.3 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna45  tRNA-Arg  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0065  tRNA-Arg  92.68 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0034  tRNA-Arg  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620516  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0056  tRNA-Arg  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000119061  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2040  tRNA-Arg  92.68 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000158642  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0048  tRNA-Arg  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06510  tRNA-Arg  87.72 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000338303  normal  0.349036 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_R0070  tRNA-Arg  87.72 
 
 
78 bp  58  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143256  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0022  tRNA-Arg  86.3 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193997 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0040  tRNA-Arg  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0238659  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0054  tRNA-Arg  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.403688  hitchhiker  0.000271304 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0029  tRNA-Arg  86.15 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.763657  normal  0.753454 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0048  tRNA-Arg  86.15 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0014  tRNA-Arg  86.89 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0054104  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0003  tRNA-Arg  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0025  tRNA-Arg  84.93 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0020  tRNA-Arg  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0945602  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1761  tRNA-Arg  92.68 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0012  tRNA-Trp  87.69 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000390892  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1468  tRNA-Arg  92.68 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2212  tRNA-Arg  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.249062  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0009  tRNA-Arg  92.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00246508  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0010  tRNA-Arg  90.91 
 
 
74 bp  56  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.552541  hitchhiker  0.000550393 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0059  tRNA-Arg  86.11 
 
 
76 bp  56  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.673271  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0121  tRNA-Trp  100 
 
 
77 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000153016  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  84.51 
 
 
77 bp  54  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t097  tRNA-Trp  100 
 
 
77 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000384434  normal  0.0126807 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t013  tRNA-Trp  100 
 
 
77 bp  54  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0034  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  54  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.904479  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0038  tRNA-Arg  92.31 
 
 
77 bp  54  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111435  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0031  tRNA-Trp  100 
 
 
77 bp  54  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0032  tRNA-Trp  100 
 
 
77 bp  54  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.648314  normal  0.932016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0113  tRNA-Trp  100 
 
 
77 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0422602  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0101  tRNA-Trp  100 
 
 
77 bp  54  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.0160972 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0106  tRNA-Trp  100 
 
 
77 bp  54  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.375874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>