10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_R0015 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_R0015  tRNA-Met  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488541  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0015  tRNA-Met  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000205808  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0005  tRNA-Met  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00185715  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0022  tRNA-Met  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000777036  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0011  tRNA-Thr  90 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000646692  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0029  tRNA-Met  85.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0028  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0046  tRNA-Cys  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.262416  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0037  tRNA-Thr  85.48 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000315288  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0046  tRNA-Cys  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>