More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1733 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02157  DNA gyrase subunit A  44.96 
 
 		 875 aa  691    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1428  DNA gyrase, A subunit  44.84 
 
 		 875 aa  689    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000222135  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0461  DNA gyrase subunit A  43.73 
 
 		 833 aa  667    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  45.38 
 
 		 809 aa  719    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0004  DNA gyrase, A subunit  44.57 
 
 		 857 aa  712    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1767  DNA gyrase subunit A  41.87 
 
 		 923 aa  676    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.159029  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_002950  PG1386  DNA gyrase, A subunit  45.44 
 
 		 859 aa  713    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000518586 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0295  DNA gyrase, A subunit  44.29 
 
 		 815 aa  668    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000104169  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  45.94 
 
 		 893 aa  713    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1421  DNA gyrase, A subunit  43.97 
 
 		 860 aa  698    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.633923  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0901  DNA gyrase subunit A  42.89 
 
 		 885 aa  671    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.018045  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  47.66 
 
 		 823 aa  732    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2331  DNA gyrase, A subunit  41.78 
 
 		 908 aa  641    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.627723  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1171  DNA gyrase subunit A  43.44 
 
 		 862 aa  644    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0960  DNA gyrase subunit A  45.49 
 
 		 819 aa  678    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00632258  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3119  DNA gyrase subunit A  42.41 
 
 		 914 aa  645    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2411  DNA gyrase, A subunit  43.99 
 
 		 919 aa  670    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1745  DNA gyrase, subunit A  41.32 
 
 		 928 aa  654    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.6885  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  47.66 
 
 		 823 aa  732    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  47.66 
 
 		 823 aa  732    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  47.53 
 
 		 823 aa  734    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0435  DNA gyrase subunit A  42.02 
 
 		 866 aa  661    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361933  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1372  DNA gyrase, subunit A, type II topoisomerase  43.17 
 
 		 863 aa  682    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1368  DNA gyrase, subunit A, type II topoisomerase  43.29 
 
 		 863 aa  684    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3647  DNA gyrase subunit A  41.55 
 
 		 925 aa  657    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1543  DNA gyrase subunit A  40.3 
 
 		 930 aa  653    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.255758 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1230  DNA gyrase subunit A  41.92 
 
 		 879 aa  666    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0017603  normal  0.486018 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0007  DNA gyrase subunit A  43.62 
 
 		 848 aa  647    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2578  DNA gyrase subunit A  42.02 
 
 		 888 aa  661    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2578  DNA gyrase subunit A  43.27 
 
 		 883 aa  676    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2804  DNA gyrase subunit A  45.75 
 
 		 949 aa  688    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371561  hitchhiker  0.000745999 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0948  DNA gyrase subunit A  42.23 
 
 		 849 aa  658    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.309422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4464  DNA gyrase subunit A  41.68 
 
 		 872 aa  670    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.32353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3000  DNA gyrase subunit A  42.02 
 
 		 866 aa  661    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0171  DNA gyrase, subunit A  44.34 
 
 		 846 aa  671    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101835  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4078  DNA gyrase subunit A  43.15 
 
 		 887 aa  671    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0373422  normal  0.530642 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  45.17 
 
 		 835 aa  696    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4153  DNA gyrase subunit A  42.02 
 
 		 867 aa  656    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0098  DNA gyrase, subunit A  46.52 
 
 		 815 aa  703    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.333525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0088  DNA gyrase, subunit A  45.31 
 
 		 828 aa  698    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0005  DNA gyrase subunit A  44.16 
 
 		 857 aa  701    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000593628  normal  0.429362 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0004  DNA gyrase subunit A  46.91 
 
 		 811 aa  704    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882068  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1191  DNA gyrase, A subunit  44.82 
 
 		 871 aa  700    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  47.66 
 
 		 823 aa  732    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0640  DNA gyrase subunit A  45.71 
 
 		 827 aa  656    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00358145  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1074  DNA gyrase subunit A  41.42 
 
 		 863 aa  652    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0254  DNA gyrase subunit A  42.93 
 
 		 856 aa  669    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2189  DNA gyrase subunit A  43.38 
 
 		 893 aa  684    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  46.05 
 
 		 814 aa  689    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1632  DNA gyrase subunit A  42.26 
 
 		 866 aa  664    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4346  DNA gyrase subunit A  43.7 
 
 		 907 aa  655    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0531  DNA gyrase subunit A  42.09 
 
 		 869 aa  663    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.897683  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2876  DNA gyrase subunit A  40.47 
 
 		 925 aa  637    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.987294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1046  DNA gyrase subunit A  43.56 
 
 		 862 aa  646    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0155494  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1571  DNA gyrase subunit A  42.36 
 
 		 880 aa  645    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612234  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1688  DNA gyrase subunit A  43.55 
 
 		 864 aa  672    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.352233  normal  0.651217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1795  DNA gyrase subunit A  41.7 
 
 		 880 aa  649    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.979791  unclonable  0.00000642236 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0974  DNA gyrase subunit A  41.97 
 
 		 882 aa  651    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1948  DNA gyrase, A subunit  43.77 
 
 		 908 aa  670    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000559672  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  43.82 
 
 		 830 aa  683    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2168  DNA gyrase subunit A  42.13 
 
 		 907 aa  670    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2464  DNA gyrase subunit A  42.82 
 
 		 888 aa  658    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413363 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1724  DNA gyrase, A subunit  40.4 
 
 		 928 aa  654    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0733273  normal  0.707795 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0713  DNA gyrase subunit A  42.49 
 
 		 897 aa  666    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0387  DNA gyrase, A subunit  43.86 
 
 		 847 aa  674    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4772  DNA gyrase subunit A  43.13 
 
 		 865 aa  684    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427862  decreased coverage  0.00451801 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1016  DNA gyrase, A subunit  45.63 
 
 		 809 aa  647    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.0000125895  unclonable  0.0000000378482 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0561  DNA gyrase subunit A  42.02 
 
 		 867 aa  658    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3573  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  46 
 
 		 852 aa  705    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2470  DNA gyrase, A subunit  44.08 
 
 		 897 aa  679    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931023  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1682  DNA gyrase subunit A  45.38 
 
 		 865 aa  699    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  47.93 
 
 		 839 aa  726    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  47.93 
 
 		 839 aa  724    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1163  DNA gyrase subunit A  41.87 
 
 		 881 aa  660    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00841835  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4186  DNA gyrase subunit A  42.5 
 
 		 885 aa  645    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.327784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1919  DNA gyrase subunit A  43.99 
 
 		 946 aa  671    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000233211  hitchhiker  0.00000000296006 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2059  DNA gyrase subunit A  43.99 
 
 		 944 aa  671    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00127013  unclonable  0.0000452472 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0923  DNA gyrase subunit A  44.46 
 
 		 862 aa  699    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.222877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2130  DNA gyrase, A subunit  43.48 
 
 		 909 aa  649    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.717755  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0006  DNA gyrase, A subunit  45.88 
 
 		 812 aa  679    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0916  DNA gyrase subunit A  42.14 
 
 		 867 aa  654    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23260  DNA gyrase subunit A  40.85 
 
 		 921 aa  668    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503917 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1216  DNA gyrase subunit A  45.98 
 
 		 836 aa  690    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.504333  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0006  DNA gyrase subunit A  45.45 
 
 		 866 aa  693    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  45.2 
 
 		 829 aa  696    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  46.52 
 
 		 848 aa  706    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1256  DNA gyrase subunit A  46.42 
 
 		 817 aa  693    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1040  DNA gyrase subunit A  42.02 
 
 		 867 aa  659    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  47.5 
 
 		 796 aa  725    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2690  DNA gyrase, A subunit  46.61 
 
 		 813 aa  697    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163226  decreased coverage  0.000223283 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1072  DNA gyrase subunit A  41.44 
 
 		 915 aa  650    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554737 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1972  DNA gyrase subunit A  43.63 
 
 		 918 aa  667    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000455042  hitchhiker  0.000000817353 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2790  DNA gyrase subunit A  41.58 
 
 		 889 aa  648    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0140578  hitchhiker  0.00260367 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1462  DNA gyrase subunit A  43.1 
 
 		 862 aa  641    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0005  DNA gyrase, A subunit  43.83 
 
 		 843 aa  686    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000262861  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2663  DNA gyrase subunit A  46.12 
 
 		 827 aa  710    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0795874  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1731  DNA gyrase subunit A  44.34 
 
 		 901 aa  682    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0884555  hitchhiker  0.00443229 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1114  DNA gyrase, A subunit  43.77 
 
 		 898 aa  659    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.37334 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1021  DNA gyrase, A subunit  41.68 
 
 		 856 aa  658    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0962038  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0004  DNA gyrase, A subunit  46.15 
 
 		 856 aa  684    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>