More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1672 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  100 
 
 
239 aa  480  1e-135  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  97.49 
 
 
239 aa  470  1e-132  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  76.92 
 
 
236 aa  376  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  64.71 
 
 
244 aa  329  2e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  66.52 
 
 
234 aa  322  4e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  65.81 
 
 
235 aa  315  3e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  63.95 
 
 
234 aa  313  9.999999999999999e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  63.14 
 
 
238 aa  308  6.999999999999999e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  64.53 
 
 
237 aa  306  3e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  65.11 
 
 
237 aa  305  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  64.38 
 
 
234 aa  305  6e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  62.66 
 
 
259 aa  302  2.0000000000000002e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  62.23 
 
 
235 aa  299  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  63.52 
 
 
239 aa  299  3e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  62.39 
 
 
237 aa  298  4e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  60.94 
 
 
234 aa  298  5e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  61.97 
 
 
237 aa  298  6e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  61.97 
 
 
235 aa  295  5e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  61.8 
 
 
235 aa  295  6e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  60.68 
 
 
235 aa  293  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  61.8 
 
 
234 aa  292  3e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  59.23 
 
 
236 aa  292  3e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1069  ABC transporter related  59.17 
 
 
240 aa  291  5e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  61.44 
 
 
236 aa  288  4e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  61.02 
 
 
236 aa  288  5.0000000000000004e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.94 
 
 
234 aa  286  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  59.32 
 
 
238 aa  285  4e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  58.05 
 
 
238 aa  285  5e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  59.23 
 
 
234 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  59.66 
 
 
234 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  58.37 
 
 
233 aa  281  5.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  57.38 
 
 
238 aa  280  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  58.8 
 
 
236 aa  280  1e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  57.38 
 
 
238 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  60.94 
 
 
233 aa  280  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  57.38 
 
 
238 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  54.85 
 
 
238 aa  279  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  59.23 
 
 
235 aa  279  3e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  55.36 
 
 
233 aa  279  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  57.26 
 
 
236 aa  278  4e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  55.36 
 
 
233 aa  278  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  58.12 
 
 
236 aa  278  4e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  59.23 
 
 
237 aa  277  8e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  57.69 
 
 
245 aa  276  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  54.85 
 
 
238 aa  277  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  57.45 
 
 
235 aa  276  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3326  ABC transporter related  58.47 
 
 
244 aa  277  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.262642  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.85 
 
 
238 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  58.8 
 
 
233 aa  276  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  57.81 
 
 
240 aa  276  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.85 
 
 
238 aa  276  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  55.98 
 
 
242 aa  276  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  57.69 
 
 
256 aa  276  2e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.85 
 
 
238 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2498  ABC transporter related  59.83 
 
 
234 aa  276  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.85 
 
 
238 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.85 
 
 
238 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.85 
 
 
238 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.85 
 
 
238 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  59.83 
 
 
235 aa  275  3e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  54.43 
 
 
238 aa  275  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  54.43 
 
 
238 aa  276  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  54.43 
 
 
238 aa  275  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  57.26 
 
 
256 aa  275  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  58.72 
 
 
237 aa  275  5e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  58.8 
 
 
258 aa  275  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  54.01 
 
 
238 aa  275  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  54.01 
 
 
238 aa  275  6e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.36 
 
 
234 aa  274  7e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  54.01 
 
 
238 aa  274  8e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  56.54 
 
 
237 aa  274  8e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  54.01 
 
 
238 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  54.01 
 
 
238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.94 
 
 
233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  54.01 
 
 
238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  54.01 
 
 
234 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.36 
 
 
235 aa  272  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  55.98 
 
 
237 aa  272  3e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  54.94 
 
 
233 aa  272  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  56.12 
 
 
237 aa  272  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  58.37 
 
 
233 aa  272  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  56.12 
 
 
237 aa  272  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  56.84 
 
 
234 aa  272  4.0000000000000004e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.94 
 
 
233 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.26 
 
 
235 aa  271  6e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  56.84 
 
 
238 aa  271  6e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.01 
 
 
244 aa  271  7e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  53.59 
 
 
238 aa  271  8.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  57.94 
 
 
234 aa  270  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  54.43 
 
 
238 aa  270  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  54.43 
 
 
238 aa  270  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  60.09 
 
 
237 aa  270  1e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  54.27 
 
 
237 aa  269  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  53.59 
 
 
238 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  53.59 
 
 
238 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  54.08 
 
 
233 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  54.85 
 
 
238 aa  269  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1743  ABC transporter related  58.37 
 
 
258 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  55.13 
 
 
251 aa  269  2.9999999999999997e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5099  ABC transporter related  52.74 
 
 
254 aa  268  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.23505  normal  0.121092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>