149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1538 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1490  glycoside hydrolase family protein  98.79 
 
 
415 aa  828    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0495802  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1538  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
415 aa  839    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1677  glycoside hydrolase family 4  42.89 
 
 
416 aa  305  9.000000000000001e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1857  glycoside hydrolase family protein  40.89 
 
 
433 aa  300  4e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1385  glycoside hydrolase family protein  41.53 
 
 
424 aa  299  7e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.382298  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4113  glycoside hydrolase family protein  41.53 
 
 
424 aa  298  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0266  glycoside hydrolase family protein  40.89 
 
 
436 aa  293  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4591  glycoside hydrolase family protein  40.56 
 
 
435 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3951  6-phospho-beta-glucosidase  38.55 
 
 
437 aa  290  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0241  glycoside hydrolase family protein  38.55 
 
 
437 aa  290  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0903  6-phospho-beta-glucosidase  39.25 
 
 
440 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.851589  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002438  6-phospho-beta-glucosidase  39.02 
 
 
440 aa  276  4e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3871  glycoside hydrolase family 4  36.83 
 
 
436 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03622  6-phospho-beta-glucosidase  39.02 
 
 
440 aa  270  5e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3310  glycoside hydrolase family 4  37.67 
 
 
447 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3751  glycoside hydrolase family protein  37.3 
 
 
441 aa  260  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4901  6-phospho-beta-glucosidase  36.83 
 
 
441 aa  257  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3345  glycoside hydrolase family 4  37.15 
 
 
441 aa  257  3e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5631  6-phospho-beta-glucosidase  36.83 
 
 
441 aa  256  5e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000180851 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4886  6-phospho-beta-glucosidase  36.83 
 
 
441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5328  6-phospho-beta-glucosidase  36.83 
 
 
441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5056  6-phospho-beta-glucosidase  36.83 
 
 
441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5441  6-phospho-beta-glucosidase  36.83 
 
 
441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5001  6-phospho-beta-glucosidase  37.06 
 
 
441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5297  6-phospho-beta-glucosidase  36.6 
 
 
441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000744026 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5318  6-phospho-beta-glucosidase  36.6 
 
 
441 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5373  6-phospho-beta-glucosidase  36.36 
 
 
441 aa  250  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1024  putative 6-phospho-beta-glucosidase  36.36 
 
 
440 aa  247  3e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5823  hypothetical protein  33.89 
 
 
419 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0472  glycoside hydrolase family 4  35.25 
 
 
468 aa  232  8.000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.507113  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1710  6-phospho-beta-glucosidase  33.94 
 
 
451 aa  227  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2028  6-phospho-beta-glucosidase  33.33 
 
 
451 aa  226  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1413  6-phospho-beta-glucosidase  33.33 
 
 
451 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.790472  normal  0.0216334 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1855  6-phospho-beta-glucosidase  33.33 
 
 
451 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545492  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1457  6-phospho-beta-glucosidase  33.26 
 
 
450 aa  223  4e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.307049 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1430  6-phospho-beta-glucosidase  33.1 
 
 
451 aa  222  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1445  6-phospho-beta-glucosidase  33.1 
 
 
451 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.597684  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01703  cryptic phospho-beta-glucosidase, NAD(P)-binding  33.26 
 
 
450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1908  glycoside hydrolase family 4  33.03 
 
 
450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.12949  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1955  6-phospho-beta-glucosidase  33.03 
 
 
450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01691  hypothetical protein  33.26 
 
 
450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.797624  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1898  glycoside hydrolase family protein  33.26 
 
 
450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.696753  normal  0.423209 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2452  6-phospho-beta-glucosidase  33.26 
 
 
450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1816  6-phospho-beta-glucosidase  33.03 
 
 
450 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.703713  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3020  6-phospho-beta-glucosidase  30.96 
 
 
453 aa  212  9e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7349  glycoside hydrolase family 4  33.02 
 
 
422 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.197133 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3016  glycoside hydrolase family protein  31.03 
 
 
455 aa  205  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.547717  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4107  glycoside hydrolase family 4  30.2 
 
 
460 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3858  glycoside hydrolase family 4  30.66 
 
 
427 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1614  glycoside hydrolase family 4  32.47 
 
 
459 aa  195  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2007  glycoside hydrolase family protein  29.41 
 
 
461 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3066  Maltose-6'-phosphate glucosidase  32.58 
 
 
442 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.495439  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000411  maltose-6'-phosphate glucosidase  29.06 
 
 
442 aa  182  9.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2132  glycoside hydrolase family 4  28.71 
 
 
432 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3322  Maltose-6'-phosphate glucosidase  30.43 
 
 
442 aa  176  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5443  glycoside hydrolase family 4  27.48 
 
 
447 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3661  glycoside hydrolase family 4  31.75 
 
 
446 aa  172  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1458  glycoside hydrolase family 4  29.85 
 
 
410 aa  169  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.453391  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2768  6-phospho-beta-glucosidase  27.71 
 
 
460 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4045  maltose-6'-phosphate glucosidase  28.74 
 
 
440 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5112  maltose-6'-phosphate glucosidase  29.2 
 
 
440 aa  167  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.694911 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03565  predicted 6-phospho-beta-glucosidase  29.2 
 
 
440 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03508  hypothetical protein  29.2 
 
 
440 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0021  glycoside hydrolase family protein  29.33 
 
 
440 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0454  glycoside hydrolase family 4  28.77 
 
 
442 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000262925  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3893  maltose-6'-phosphate glucosidase  28.97 
 
 
440 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0265  glycoside hydrolase family 4  26.86 
 
 
453 aa  162  7e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0018  glycoside hydrolase family protein  28.41 
 
 
440 aa  160  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2588  glycoside hydrolase family 4  28.51 
 
 
457 aa  155  9e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2898  glycoside hydrolase family protein  26.2 
 
 
466 aa  144  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2608  glycoside hydrolase family 4  26.65 
 
 
465 aa  140  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222625 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00830  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  23.66 
 
 
485 aa  133  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4393  glycoside hydrolase family protein  32.26 
 
 
461 aa  133  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0310386  normal  0.707093 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2617  glycoside hydrolase family 4  26.29 
 
 
447 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0255431  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0384  glycoside hydrolase family 4  26.37 
 
 
441 aa  108  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4885  glycoside hydrolase family 4  27.82 
 
 
430 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0216  glycoside hydrolase family 4  25.11 
 
 
441 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1002  glycoside hydrolase family 4  24.44 
 
 
489 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23300  glycoside hydrolase family 4  24.04 
 
 
432 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1104  glycoside hydrolase family 4  24.32 
 
 
438 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5121  alpha-galactosidase  25.94 
 
 
490 aa  97.1  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4649  glycoside hydrolase family 4  24.37 
 
 
435 aa  96.7  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01850  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  23.79 
 
 
435 aa  95.1  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0695  glycoside hydrolase family 4  23.2 
 
 
452 aa  92.4  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5368  glycoside hydrolase family 4  26 
 
 
438 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.265798 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6878  glycoside hydrolase family 4  23.83 
 
 
488 aa  89.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.036749  normal  0.397906 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0137  glycoside hydrolase family 4  24.62 
 
 
439 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5908  glycoside hydrolase family 4  23.83 
 
 
488 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3180  glycoside hydrolase family 4  24.55 
 
 
449 aa  86.7  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.744727  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0797  glycoside hydrolase family 4  25.24 
 
 
432 aa  86.7  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482234  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4693  glycoside hydrolase family 4  24.51 
 
 
443 aa  86.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0209787  normal  0.517895 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0769  glycoside hydrolase family protein  22.35 
 
 
440 aa  86.7  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3103  glycoside hydrolase family protein  22.75 
 
 
435 aa  84  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4139  glycoside hydrolase family protein  23.39 
 
 
490 aa  82.8  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0440  glycoside hydrolase family 4  22.27 
 
 
460 aa  82  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.41841  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3895  glycoside hydrolase family 4  24.16 
 
 
475 aa  80.5  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.206792  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0445  glycoside hydrolase family protein  23.2 
 
 
426 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482345  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3958  glycoside hydrolase family 4  22.94 
 
 
439 aa  79.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5795  glycoside hydrolase family 4  24.67 
 
 
430 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4484  glycoside hydrolase family 4  23.84 
 
 
439 aa  78.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0542529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>