64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1471 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1471  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  330  5e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.863306  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1425  hypothetical protein  90.18 
 
 		 164 aa  300  4.0000000000000003e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0341  protein of unknown function DUF82  34.18 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00210637  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2158  hypothetical protein  31.52 
 
 		 264 aa  81.6  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.73728  normal  0.123639 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3352  protein of unknown function DUF82  35 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.729294  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0403  hypothetical protein  33.78 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.393997  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1988  protein of unknown function DUF82  32.91 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.865468  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1548  hypothetical protein  28.66 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0147  hypothetical protein  36.49 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0149  hypothetical protein  36.49 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2621  hypothetical protein  35.46 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0072  hypothetical protein  37.59 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587358  normal  0.0153972 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_368  hypothetical protein  33.11 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0577491  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0281  protein of unknown function DUF82  31.51 
 
 		 267 aa  74.3  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3276  protein of unknown function DUF82  36.43 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.31629  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0418  hypothetical protein  33.33 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10590  hypothetical protein  36.03 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.18585e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3958  protein of unknown function DUF82  29.45 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0217  hypothetical protein  31.03 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1285  hypothetical protein  32.43 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3405  hypothetical protein  31.51 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000396149  normal  0.418275 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0100  protein of unknown function DUF82  33.01 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.566034  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1519  hypothetical protein  28.38 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00627759  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0174  hypothetical protein  33.33 
 
 		 266 aa  62  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2878  hypothetical protein  30.46 
 
 		 251 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000157183  hitchhiker  0.00000000000184345 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0327  hypothetical protein  30 
 
 		 255 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.359144  normal  0.0143228 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0146  hypothetical protein  30.46 
 
 		 251 aa  61.6  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.865977  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0859  hypothetical protein  27.56 
 
 		 267 aa  61.6  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113509  normal  0.015676 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2400  protein of unknown function DUF82  28.67 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0155  hypothetical protein  25.73 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.292503  normal  0.0192044 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3080  protein of unknown function DUF82  27.7 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.367373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0306  hypothetical protein  30.14 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00785467  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2800  hypothetical protein  30.14 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349371  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0270  hypothetical protein  30.14 
 
 		 251 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.318554  hitchhiker  0.00000949427 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3040  protein of unknown function DUF82  27.7 
 
 		 261 aa  58.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1634  hypothetical protein  31.16 
 
 		 251 aa  58.2  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1033  hypothetical protein  28.68 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7452  protein of unknown function DUF82  29.46 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16850  hypothetical protein  24.22 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0460319  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0747  hypothetical protein  31.16 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3686  protein of unknown function DUF82  29.45 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000683757  hitchhiker  0.000000000000406532 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0209  hypothetical protein  27.22 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121486  unclonable  0.00000000000711775 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3123  hypothetical protein  29.45 
 
 		 251 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0157534  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0233  hypothetical protein  28.86 
 
 		 255 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0265996  hitchhiker  0.00000000670922 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0031  hypothetical protein  29.45 
 
 		 251 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885016  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3863  hypothetical protein  29.45 
 
 		 251 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0225  hypothetical protein  28.86 
 
 		 268 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3802  hypothetical protein  29.45 
 
 		 251 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142796  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02617  hypothetical protein  24.56 
 
 		 257 aa  52.4  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.77875 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1175  protein of unknown function DUF82  23.84 
 
 		 176 aa  52.4  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2002  protein of unknown function DUF82  29.09 
 
 		 241 aa  50.8  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1962  protein of unknown function DUF82  28.08 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00000351454  decreased coverage  0.00501017 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0872  protein of unknown function DUF82  28.77 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.340382  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4339  protein of unknown function DUF82  23.95 
 
 		 258 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.172322 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4229  protein of unknown function DUF82  23.95 
 
 		 258 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3160  hypothetical protein  25.95 
 
 		 176 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  normal  0.20944 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0758  hypothetical protein  24.68 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1053  hypothetical protein  24.82 
 
 		 145 aa  45.1  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.171553 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0508  hypothetical protein  28.77 
 
 		 136 aa  44.3  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0988512 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1812  protein of unknown function DUF82  26.42 
 
 		 261 aa  43.9  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1167  hypothetical protein  29.55 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1591  hypothetical protein  27.81 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1020  hypothetical protein  25.33 
 
 		 180 aa  40.8  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.134843 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2987  protein of unknown function DUF82  29.08 
 
 		 153 aa  40.4  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>