More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1457 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1457  NifU family SUF system FeS assembly protein  100 
 
 
138 aa  278  1e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1411  NifU family SUF system FeS assembly protein  100 
 
 
138 aa  278  1e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0047  NifU family SUF system FeS assembly protein  53.79 
 
 
135 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0652  NifU family SUF system FeS assembly protein  49.62 
 
 
145 aa  137  7e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0989  SUF system FeS assembly protein, NifU family  42.31 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.784389  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2328  NifU family SUF system FeS assembly protein  41.98 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0398  SUF system FeS assembly protein, NifU family  40 
 
 
175 aa  110  6e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0290  NifU family SUF system FeS assembly protein  40.46 
 
 
137 aa  110  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1895  SUF system FeS assembly protein, NifU family  41.61 
 
 
154 aa  108  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4273  SUF system FeS assembly protein  38.85 
 
 
149 aa  107  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0656  hypothetical protein  38.81 
 
 
149 aa  107  6e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0640  hypothetical protein  38.81 
 
 
149 aa  107  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1511  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.34 
 
 
148 aa  106  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1444  IscU  35.34 
 
 
158 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0907  NifU family SUF system FeS assembly protein  39.55 
 
 
149 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1362  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.86 
 
 
155 aa  104  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26820  SUF system FeS assembly protein, NifU family  40.46 
 
 
145 aa  103  7e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1636  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.55 
 
 
139 aa  103  7e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0846  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.64 
 
 
154 aa  103  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.539052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0862  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.64 
 
 
154 aa  103  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.16993  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1665  SUF system FeS assembly protein  41.43 
 
 
172 aa  102  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754519  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2090  NifU family SUF system FeS assembly protein  40.58 
 
 
151 aa  101  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0165  SUF system FeS assembly protein  36.96 
 
 
140 aa  100  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0894  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.96 
 
 
153 aa  98.2  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0702679  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4473  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.83 
 
 
165 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1504  SUF system FeS assembly protein, NifU family protein  34.78 
 
 
153 aa  97.4  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1787  SUF system FeS assembly protein  36.09 
 
 
160 aa  97.4  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0971844  normal  0.163448 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12880  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.81 
 
 
151 aa  97.1  7e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2486  SUF system FeS assembly protein  37.23 
 
 
150 aa  96.3  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1110  Fe-S cluster formation protein, NifU-like  35.07 
 
 
146 aa  96.3  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0269  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.23 
 
 
148 aa  96.3  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2764  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.37 
 
 
163 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541275  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2035  Fe-S cluster formation protein, NifU-like  35.34 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5982  nitrogen fixation protein  38.13 
 
 
145 aa  94.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.8626  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1716  NifU-like domain-containing protein  32.37 
 
 
163 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0759049  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2886  NifU-like domain-containing protein  32.37 
 
 
163 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0988  NifU family protein  41.67 
 
 
126 aa  94.7  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2403  NifU-like domain-containing protein  32.37 
 
 
163 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0609  NifU-like domain-containing protein  32.37 
 
 
163 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2707  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.37 
 
 
163 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0893  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.53 
 
 
149 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0847  SUF system FeS assembly protein  34.53 
 
 
149 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2229  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.57 
 
 
151 aa  94.4  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000771916  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1002  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.59 
 
 
141 aa  94  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0651104  normal  0.492699 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1070  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.3 
 
 
142 aa  93.6  8e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2827  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.37 
 
 
163 aa  93.6  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0897  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.53 
 
 
149 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.341493  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16170  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.51 
 
 
150 aa  92.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2850  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.58 
 
 
159 aa  92  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2339  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.58 
 
 
159 aa  92  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000980785  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5149  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.82 
 
 
147 aa  91.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.726273  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0603  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.08 
 
 
151 aa  91.7  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281207  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1982  SUF system FeS assembly protein  36.81 
 
 
160 aa  90.9  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3071  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.85 
 
 
149 aa  90.9  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1793  NifU-like domain-containing protein  30.94 
 
 
163 aa  90.9  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.310093  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0711  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.4 
 
 
132 aa  90.1  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3673  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.27 
 
 
155 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.905267  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0307  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.17 
 
 
132 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0630803 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11493  nitrogen fixation-like protein  35.71 
 
 
162 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220118  normal  0.138949 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0499  NifU domain-containing protein  35.88 
 
 
154 aa  89  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2920  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.06 
 
 
145 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2737  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.27 
 
 
153 aa  89  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2505  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.81 
 
 
151 aa  88.2  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2274  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.09 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0700  SUF system FeS assembly protein  35.04 
 
 
160 aa  88.2  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1967  SUF system FeS assembly protein  35.56 
 
 
145 aa  88.2  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.245372 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3483  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.57 
 
 
146 aa  87  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.250714  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2387  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.51 
 
 
154 aa  87.4  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212849  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5117  NifU domain-containing protein  37.12 
 
 
143 aa  87  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4848  NifU domain-containing protein  37.12 
 
 
143 aa  87  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4689  NifU family protein  37.12 
 
 
143 aa  87  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4704  NifU family protein  37.12 
 
 
143 aa  87  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5214  NifU domain-containing protein  37.12 
 
 
143 aa  87  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5120  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  37.12 
 
 
143 aa  87  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5085  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  37.12 
 
 
143 aa  87  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5122  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  37.12 
 
 
143 aa  87  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0356779  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.09 
 
 
149 aa  87  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182981  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0568  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.41 
 
 
153 aa  86.7  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.654939  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4802  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.12 
 
 
143 aa  86.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3305  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.04 
 
 
158 aa  86.3  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000286575 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0118  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  37.12 
 
 
143 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1139  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.29 
 
 
157 aa  86.7  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.039211 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13390  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.57 
 
 
163 aa  85.5  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00685407  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2958  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.65 
 
 
158 aa  85.5  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2069  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.82 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.420514  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0144  NifU family protein  29.85 
 
 
147 aa  85.1  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2138  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.59 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2186  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.59 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0207  SUF system FeS assembly protein  34.13 
 
 
140 aa  85.1  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3576  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.12 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.04 
 
 
167 aa  84.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000288131  hitchhiker  0.00804986 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1970  NifU-like protein for Fe-S cluster formation  36.09 
 
 
152 aa  84.3  5e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2447  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.34 
 
 
156 aa  84.3  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0284902 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2313  SUF system FeS assembly protein  35.34 
 
 
147 aa  84.3  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.960672 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1695  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.03 
 
 
128 aa  84  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0408  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.07 
 
 
131 aa  84  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2476  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.33 
 
 
153 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435362  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2440  SUF system FeS assembly protein  33.33 
 
 
153 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2485  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.33 
 
 
153 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200135  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0957  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.03 
 
 
130 aa  83.6  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>