More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1426 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  100 
 
 
256 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  99.22 
 
 
256 aa  501  1e-141  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  57.03 
 
 
253 aa  287  1e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  55.08 
 
 
253 aa  285  5.999999999999999e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  56.64 
 
 
253 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  55.47 
 
 
253 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  51.17 
 
 
255 aa  258  9e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  41.57 
 
 
264 aa  182  7e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  36.61 
 
 
256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  43.98 
 
 
249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  38.59 
 
 
250 aa  161  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  42.04 
 
 
264 aa  161  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  41.59 
 
 
249 aa  159  5e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  40.83 
 
 
255 aa  157  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  36.62 
 
 
284 aa  153  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  41.51 
 
 
249 aa  151  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  41.15 
 
 
249 aa  150  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  44.34 
 
 
249 aa  149  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  37.9 
 
 
253 aa  149  6e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  35.22 
 
 
288 aa  148  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  32.4 
 
 
251 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  34.15 
 
 
254 aa  141  9e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  38.1 
 
 
249 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  31.76 
 
 
260 aa  137  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  34.82 
 
 
254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2893  ABC-2 type transporter  35.68 
 
 
270 aa  136  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  34.47 
 
 
270 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  34.8 
 
 
260 aa  132  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  31.88 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  36.32 
 
 
273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 
289 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  31.51 
 
 
280 aa  121  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  29.79 
 
 
278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0215  ABC-2 type transporter  34.05 
 
 
275 aa  115  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716105  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  31.54 
 
 
290 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  28.27 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  30.32 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  32.85 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  32.19 
 
 
278 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  32.13 
 
 
256 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  29.43 
 
 
289 aa  112  8.000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  30.24 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  30.8 
 
 
277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  29.84 
 
 
241 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  26.05 
 
 
251 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 
241 aa  104  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  34.47 
 
 
276 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  29.72 
 
 
242 aa  102  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  30.77 
 
 
261 aa  102  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  28.79 
 
 
286 aa  101  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1861  ABC-2 type transporter  27.48 
 
 
258 aa  101  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 
293 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  30.59 
 
 
252 aa  100  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04481  putative multidrug efflux ABC transporter  31.25 
 
 
284 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.86864  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  26.05 
 
 
276 aa  97.4  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05051  putative multidrug efflux ABC transporter  31.58 
 
 
274 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507008  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 
257 aa  96.3  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  31.34 
 
 
255 aa  96.3  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  30.22 
 
 
304 aa  96.3  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3518  ABC-2 type transporter  30.45 
 
 
298 aa  95.5  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2261  ABC-2 type transporter  26.58 
 
 
260 aa  95.9  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121091  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  33.74 
 
 
296 aa  95.5  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04741  putative multidrug efflux ABC transporter  31.1 
 
 
274 aa  95.9  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 
256 aa  95.5  7e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  28.27 
 
 
295 aa  95.5  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2588  ABC-2 type transporter  30.45 
 
 
298 aa  95.5  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0449  putative multidrug efflux ABC transporter  30.29 
 
 
274 aa  95.1  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603097  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 
291 aa  95.1  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0287  hypothetical protein  27.94 
 
 
241 aa  94.4  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.301015  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1750  putative multidrug efflux ABC transporter  27.4 
 
 
277 aa  94.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0190039  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  27.7 
 
 
298 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0612  putative multidrug efflux ABC transporter  29.22 
 
 
284 aa  92.4  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5948  ABC transporter permease  26.51 
 
 
284 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0673459  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0945  ABC transporter related  29.68 
 
 
665 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1894  putative daunorubicin resistance ABC transporter, permease protein  25.23 
 
 
260 aa  90.1  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0091  ABC transporter  28.95 
 
 
253 aa  90.1  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 
254 aa  90.1  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05121  putative multidrug efflux ABC transporter  28.64 
 
 
274 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  29.73 
 
 
256 aa  89.7  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  28.04 
 
 
280 aa  89.7  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0899  ABC transporter, inner membrane subunit  32.09 
 
 
287 aa  89.4  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.208954  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1358  ABC-2 type transporter  28.91 
 
 
294 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.624692  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  27.93 
 
 
277 aa  88.2  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1796  ABC-2 type transporter  24.57 
 
 
280 aa  87.4  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000116393 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3931  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 
263 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284935  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  25.24 
 
 
243 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06471  putative multidrug efflux ABC transporter  28.57 
 
 
284 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.620136 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  27.27 
 
 
252 aa  87.8  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0948  ABC-2 type transporter  32.09 
 
 
287 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0389515  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0950  ABC-2 type transporter  32.56 
 
 
288 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 
272 aa  87.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0030  ABC-2 type transporter  26.48 
 
 
272 aa  87  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1936  ABC-2 type transporter  27.19 
 
 
286 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0249  hypothetical protein  27.56 
 
 
281 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4170  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 
270 aa  86.3  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2013  ABC-2 type transporter  28.77 
 
 
256 aa  86.3  5e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000119274  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2149  ABC-2 type transport system permease protein  30.09 
 
 
286 aa  85.5  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1245  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 
292 aa  85.1  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0464218  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1034  ABC-2 type transporter  28.3 
 
 
256 aa  85.1  9e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.150436 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>