87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1404 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1282  hypothetical protein  95.81 
 
 
406 aa  776    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000228173  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1404  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  822    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.413261  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0559  hypothetical protein  50.71 
 
 
410 aa  373  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.146499  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0086  hypothetical protein  50.36 
 
 
411 aa  371  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0847  hypothetical protein  48.04 
 
 
410 aa  362  7.0000000000000005e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1789  hypothetical protein  44.1 
 
 
413 aa  340  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000891935  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3256  hypothetical protein  43.2 
 
 
413 aa  339  5e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2276  hypothetical protein  44.79 
 
 
413 aa  338  7e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1004  hypothetical protein  42.11 
 
 
413 aa  333  5e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00505199  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2084  hypothetical protein  42.09 
 
 
415 aa  330  4e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0833724  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2364  hypothetical protein  43.55 
 
 
413 aa  326  5e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2349  hypothetical protein  43.51 
 
 
415 aa  326  5e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.218384  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1138  hypothetical protein  45.21 
 
 
413 aa  325  8.000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.258981 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2967  hypothetical protein  42.89 
 
 
415 aa  324  1e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3021  hypothetical protein  42.65 
 
 
415 aa  322  5e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1990  hypothetical protein  42.41 
 
 
415 aa  322  7e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3283  hypothetical protein  42.41 
 
 
415 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3259  hypothetical protein  42.41 
 
 
415 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3292  hypothetical protein  42.41 
 
 
415 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0704  hypothetical protein  44.2 
 
 
417 aa  320  3e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2985  hypothetical protein  41.93 
 
 
415 aa  319  5e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767883  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3319  hypothetical protein  41.93 
 
 
415 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.103018  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3297  hypothetical protein  41.93 
 
 
415 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2042  hypothetical protein  42.37 
 
 
413 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000173265  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2737  hypothetical protein  41.97 
 
 
413 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.601359  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1926  hypothetical protein  40.14 
 
 
416 aa  307  3e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.570079  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0062  hypothetical protein  44.26 
 
 
418 aa  305  7e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.519667  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1280  hypothetical protein  42.75 
 
 
415 aa  304  2.0000000000000002e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0065  hypothetical protein  43.54 
 
 
418 aa  299  5e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2761  hypothetical protein  42.4 
 
 
404 aa  296  6e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0709  hypothetical protein  40.24 
 
 
410 aa  293  3e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000587987 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2995  hypothetical protein  42.01 
 
 
404 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2814  hypothetical protein  41.52 
 
 
404 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4577  hypothetical protein  41.59 
 
 
411 aa  288  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0647604  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2901  hypothetical protein  41.77 
 
 
404 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2175  hypothetical protein  40.69 
 
 
407 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1283  hypothetical protein  41.12 
 
 
412 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000225003  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1657  hypothetical protein  38.37 
 
 
411 aa  281  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.962442 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2369  hypothetical protein  37.32 
 
 
420 aa  267  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0135  hypothetical protein  36.41 
 
 
436 aa  262  8e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0009  hypothetical protein  38.1 
 
 
417 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2649  hypothetical protein  36.06 
 
 
418 aa  257  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.804113  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2554  hypothetical protein  34.31 
 
 
419 aa  246  4e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3628  hypothetical protein  39.71 
 
 
404 aa  243  6e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.73345 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1859  hypothetical protein  33.41 
 
 
414 aa  221  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958241  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3076  hypothetical protein  41.91 
 
 
277 aa  219  5e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09523  hypothetical protein  30.99 
 
 
411 aa  181  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.640574  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0597  hypothetical protein  26.65 
 
 
442 aa  125  9e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2153  hypothetical protein  26.91 
 
 
449 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2124  hypothetical protein  28.77 
 
 
424 aa  124  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000234804  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_537  hypothetical protein  26.89 
 
 
442 aa  122  9e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.781044  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0572  hypothetical protein  26.89 
 
 
442 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1327  hypothetical protein  27.17 
 
 
412 aa  119  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.964057  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0652  putative phosphatase  26.83 
 
 
433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.49036  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1638  hypothetical protein  26.44 
 
 
427 aa  114  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0718  hypothetical protein  23.7 
 
 
458 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.201396  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1920  hypothetical protein  26.07 
 
 
430 aa  109  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.249749  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0133  hypothetical protein  24.26 
 
 
423 aa  107  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0099  hypothetical protein  24.89 
 
 
424 aa  104  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00564358  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0121  hypothetical protein  24.37 
 
 
424 aa  104  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00158567  normal  0.0307809 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1414  hypothetical protein  24.72 
 
 
447 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.792447  normal  0.210387 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0110  hypothetical protein  25.39 
 
 
448 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2453  hypothetical protein  24.72 
 
 
449 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2851  hypothetical protein  25.23 
 
 
445 aa  99  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0586103  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1988  hypothetical protein  23.53 
 
 
450 aa  98.6  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1502  hypothetical protein  24.49 
 
 
449 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00218363  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2667  hypothetical protein  24.77 
 
 
424 aa  96.3  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0707942  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1422  hypothetical protein  24.36 
 
 
422 aa  95.1  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1406  hypothetical protein  24.04 
 
 
449 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5441  hypothetical protein  23.81 
 
 
437 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.819313 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3462  hypothetical protein  22.68 
 
 
435 aa  91.3  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0089  hypothetical protein  24.14 
 
 
424 aa  88.6  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.200818  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0657  hypothetical protein  22.03 
 
 
436 aa  87.4  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4921  hypothetical protein  23.57 
 
 
450 aa  86.7  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2018  hypothetical protein  22.33 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.896322  normal  0.166706 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0094  hypothetical protein  23.41 
 
 
424 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2164  hypothetical protein  23.79 
 
 
454 aa  84.3  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00681502  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3890  hypothetical protein  29.24 
 
 
399 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3515  hypothetical protein  29.91 
 
 
401 aa  79.7  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3031  hypothetical protein  24.37 
 
 
425 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6064  hypothetical protein  21.14 
 
 
439 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.634375  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1235  hypothetical protein  23.17 
 
 
406 aa  75.1  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3077  hypothetical protein  44.44 
 
 
101 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3165  hypothetical protein  25.57 
 
 
443 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0143624  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5444  hypothetical protein  26.42 
 
 
395 aa  67.4  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1252  hypothetical protein  23.37 
 
 
426 aa  65.9  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.16322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1747  hypothetical protein  20.38 
 
 
443 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.506846  hitchhiker  0.000552489 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>