More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1398 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  100 
 
 		 155 aa  312  9e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  100 
 
 		 155 aa  312  9e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0949  30S ribosomal protein S7  80.65 
 
 		 155 aa  266  5.9999999999999995e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000145029  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1142  30S ribosomal protein S7  73.55 
 
 		 155 aa  254  3e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000563067  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  71.43 
 
 		 156 aa  227  4e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  74.83 
 
 		 156 aa  226  8e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  77.03 
 
 		 157 aa  226  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  72.79 
 
 		 156 aa  221  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0794  30S ribosomal protein S7  63.87 
 
 		 155 aa  220  4.9999999999999996e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  72.79 
 
 		 156 aa  218  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  63.23 
 
 		 155 aa  214  5e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  68.03 
 
 		 156 aa  211  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  59.74 
 
 		 156 aa  210  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0711  ribosomal protein S7  64.38 
 
 		 157 aa  207  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  59.74 
 
 		 156 aa  207  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0295  30S ribosomal protein S7  67.33 
 
 		 159 aa  207  5e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  67.35 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  64.29 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  206  8e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 156 aa  204  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 156 aa  203  9e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0584  30S ribosomal protein S7  59.74 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  65.31 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  62.58 
 
 		 157 aa  202  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0356  30S ribosomal protein S7  58.06 
 
 		 155 aa  202  2e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0282  ribosomal protein S7  62.99 
 
 		 156 aa  201  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000161589  decreased coverage  0.00000214239 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl623  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 		 155 aa  201  4e-51  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  201  4e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  201  4e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  201  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  63.27 
 
 		 156 aa  200  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 156 aa  200  6e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  200  7e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  200  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2732  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 		 156 aa  200  8e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  63.23 
 
 		 155 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  65.31 
 
 		 156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2015  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0152  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 		 155 aa  198  1.9999999999999998e-50  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1930  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1487  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 		 156 aa  197  3e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188797  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1770  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000571074  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1949  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  197  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1315  30S ribosomal protein S7  61.9 
 
 		 156 aa  197  5e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000003043  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3029  30S ribosomal protein S7  63.16 
 
 		 157 aa  197  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00356201  hitchhiker  0.0000198077 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  61.9 
 
 		 156 aa  196  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  61.9 
 
 		 156 aa  196  7e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  61.9 
 
 		 156 aa  196  7e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  61.9 
 
 		 156 aa  196  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  61.9 
 
 		 156 aa  196  7e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  61.9 
 
 		 156 aa  196  7e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  61.9 
 
 		 156 aa  196  7e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0221  30S ribosomal protein S7  61.9 
 
 		 156 aa  196  7e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000044788  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  196  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2596  30S ribosomal protein S7  60 
 
 		 155 aa  197  7e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000119958  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  61.9 
 
 		 156 aa  196  7e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  61.9 
 
 		 156 aa  196  7e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  196  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1659  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.13751  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1357  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216177  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3452  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  61.9 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  63.27 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1064  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000327115  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0188  30S ribosomal protein S7  60.54 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  59.18 
 
 		 156 aa  194  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  59.18 
 
 		 156 aa  194  3e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0211  30S ribosomal protein S7  61.22 
 
 		 156 aa  194  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0229  30S ribosomal protein S7  63.87 
 
 		 157 aa  194  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  59.18 
 
 		 156 aa  194  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1763  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 		 156 aa  194  3e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0139777  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  59.18 
 
 		 156 aa  194  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1189  30S ribosomal protein S7  62.5 
 
 		 157 aa  194  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  60.54 
 
 		 156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000139374  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  194  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000345641  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4030  30S ribosomal protein S7  61.84 
 
 		 157 aa  194  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00016253  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  193  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2159  30S ribosomal protein S7  62.59 
 
 		 156 aa  193  6e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.134079  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0272  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  193  8.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.432697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1165  ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  193  9e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000269779  hitchhiker  0.000000590673 
 
 
-
 
NC_004310  BR1237  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  192  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1799  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  192  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0695126  normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2963  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 		 158 aa  192  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.255564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1200  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  192  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0959  ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  192  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000015006  hitchhiker  0.000000000143074 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1048  30S ribosomal protein S7  59.86 
 
 		 156 aa  191  3e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000242991  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0452  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  191  3e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0982  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  191  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695424  normal  0.0667494 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1949  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 		 158 aa  191  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0576  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  191  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.688542 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  191  5e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0558  30S ribosomal protein S7  59.86 
 
 		 156 aa  190  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1709  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  190  7e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>