More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1393 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1393  50S ribosomal protein L4  100 
 
 
235 aa  478  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000162338  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1293  50S ribosomal protein L4  100 
 
 
235 aa  478  1e-134  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  8.03665e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  66.81 
 
 
221 aa  312  2e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  1.11144e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  65.33 
 
 
223 aa  312  3e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  8.24266e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  63.72 
 
 
221 aa  308  4e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  51.34 
 
 
206 aa  211  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  6.85593e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  49.56 
 
 
206 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  3.20704e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  46.46 
 
 
207 aa  206  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  8.47375e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  51.11 
 
 
206 aa  205  5e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  50.44 
 
 
207 aa  205  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  49.56 
 
 
207 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.23482e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  46.43 
 
 
206 aa  202  4e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  3.05367e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  45.58 
 
 
207 aa  201  9e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  47.32 
 
 
209 aa  201  9e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  46.9 
 
 
207 aa  201  1e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  9.811e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  50 
 
 
209 aa  200  1e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  46.9 
 
 
207 aa  201  1e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  1.34967e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  47.77 
 
 
208 aa  199  2e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.18286e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  47.56 
 
 
207 aa  199  2e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  46.29 
 
 
223 aa  199  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  46.02 
 
 
208 aa  199  3e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  5.99505e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  46.02 
 
 
207 aa  197  2e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  47.35 
 
 
207 aa  196  4e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  46.02 
 
 
207 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  6.90155e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  46.02 
 
 
207 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  5.72324e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  46.02 
 
 
207 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.36863e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  46.02 
 
 
207 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  8.34057e-10  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  46.02 
 
 
207 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  2.56275e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  46.02 
 
 
207 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  46.02 
 
 
207 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  9.00585e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  46.02 
 
 
207 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  46.02 
 
 
207 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  5.44936e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  46.02 
 
 
207 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.63463e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  46.02 
 
 
207 aa  193  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.04823e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  47.77 
 
 
207 aa  193  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  5.66858e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  43.81 
 
 
207 aa  192  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  43.75 
 
 
208 aa  191  7e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  8.79055e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3023  ribosomal protein L4/L1e  42.73 
 
 
222 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443321  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  45.58 
 
 
207 aa  189  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.03712e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  46.02 
 
 
206 aa  188  8e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  2.54915e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  46.67 
 
 
209 aa  187  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  44.93 
 
 
207 aa  186  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  44.25 
 
 
205 aa  183  2e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  4.72593e-05  unclonable  1.97161e-28 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  46.48 
 
 
223 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4025  ribosomal protein L4/L1e  44.91 
 
 
221 aa  179  3e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  7.17748e-06 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  42.92 
 
 
207 aa  179  4e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  4.75036e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  44.54 
 
 
207 aa  177  8e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2856  50S ribosomal protein L4  42.22 
 
 
207 aa  174  1e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400345  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0627  50S ribosomal protein L4  41.78 
 
 
220 aa  174  1e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  5.30014e-06  hitchhiker  3.1805e-13 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 
212 aa  173  2e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  42.67 
 
 
207 aa  173  3e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  7.91532e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  41.89 
 
 
214 aa  172  3e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  40.27 
 
 
207 aa  170  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  40.71 
 
 
207 aa  169  4e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  3.35339e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  41.78 
 
 
207 aa  169  5e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  1.46284e-08 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  40.71 
 
 
206 aa  168  6e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.69503e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  40.27 
 
 
207 aa  166  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  3.92239e-05  decreased coverage  1.22182e-05 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  40.27 
 
 
208 aa  167  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  3.6372e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  42.04 
 
 
206 aa  166  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  3.84651e-12  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  40.36 
 
 
208 aa  165  7e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0290  ribosomal protein L4/L1e  38.84 
 
 
208 aa  164  8e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00437959  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  38.94 
 
 
207 aa  164  8e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  9.84788e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1068  50S ribosomal protein L4  38.67 
 
 
207 aa  162  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.51414e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  39.21 
 
 
208 aa  161  9e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  6.04234e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  38.94 
 
 
207 aa  160  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  4.03747e-05  hitchhiker  2.67396e-11 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0934  50S ribosomal protein L4  39.11 
 
 
207 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  5.21211e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3327  50S ribosomal protein L4  39.11 
 
 
207 aa  160  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78315e-16 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  41.33 
 
 
207 aa  160  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  4.5126e-06  hitchhiker  1.48432e-09 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1837  ribosomal protein L4/L1e  45.7 
 
 
215 aa  160  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00300997  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  41.07 
 
 
204 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  41.07 
 
 
204 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1160  ribosomal protein L4/L1e  45.56 
 
 
208 aa  159  4e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  7.38717e-07  hitchhiker  5.90673e-07 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  42.73 
 
 
210 aa  159  5e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1293  50S ribosomal protein L4  44.34 
 
 
210 aa  158  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  2.05733e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0681  50S ribosomal protein L4  36.44 
 
 
207 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.486374  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  42.27 
 
 
210 aa  157  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3994  ribosomal protein L4/L1e  40.97 
 
 
212 aa  157  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_418  ribosomal protein L4  39.47 
 
 
210 aa  156  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00538527  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0452  50S ribosomal protein L4  39.91 
 
 
210 aa  156  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000515236  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2019  50S ribosomal protein L4  39.56 
 
 
206 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0603  ribosomal protein L4/L1e  39.56 
 
 
209 aa  155  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4344  50S ribosomal protein L4  39.29 
 
 
209 aa  155  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000409516  normal  0.126717 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  42.73 
 
 
210 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3434  ribosomal protein L4/L1e  39.3 
 
 
217 aa  155  7e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1148  50S ribosomal protein L4  38.39 
 
 
209 aa  154  9e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  6.71055e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  41.23 
 
 
211 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  41.23 
 
 
211 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1306  50S ribosomal protein L4  40.09 
 
 
219 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265076  normal  0.163333 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  37.33 
 
 
208 aa  153  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  39.56 
 
 
208 aa  153  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.69782e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0475  50S ribosomal protein L4  38.77 
 
 
210 aa  152  4e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00700158  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5048  50S ribosomal protein L4  40.09 
 
 
218 aa  152  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5122  normal  0.277146 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0857  50S ribosomal protein L4  38.91 
 
 
205 aa  151  9e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1945  50S ribosomal protein L4  39.56 
 
 
206 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3922  ribosomal protein L4/L1e  41.23 
 
 
216 aa  150  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1087  50S ribosomal protein L4  40.99 
 
 
215 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.10489 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  37.33 
 
 
206 aa  151  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1417  ribosomal protein L4/L1e  35.24 
 
 
211 aa  150  2e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.977567  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1616  ribosomal protein L4/L1e  40.09 
 
 
212 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0266  50S ribosomal protein L4  42.92 
 
 
200 aa  150  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  6.51042e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>