More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1390 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1296  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
95 aa  192  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1390  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
95 aa  192  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000262881  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0957  30S ribosomal protein S19  82.11 
 
 
95 aa  170  7.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000875114  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1134  30S ribosomal protein S19  82.11 
 
 
95 aa  166  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000887938  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0786  30S ribosomal protein S19  81.05 
 
 
97 aa  160  4.0000000000000004e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.314347  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0985  30S ribosomal protein S19  77.66 
 
 
94 aa  149  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01210  ribosomal protein S19  70.21 
 
 
94 aa  142  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.441353  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  75 
 
 
94 aa  140  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 
92 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000709655  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1520  30S ribosomal protein S19  68.09 
 
 
94 aa  138  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.914288  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 
92 aa  137  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 
92 aa  137  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0871  30S ribosomal protein S19  74.12 
 
 
93 aa  137  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000215821  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 
92 aa  137  7e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1741  30S ribosomal protein S19  68.09 
 
 
94 aa  136  7.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745132  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0219  ribosomal protein S19  65.96 
 
 
94 aa  136  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075195  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3707  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 
92 aa  136  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1180  ribosomal protein S19  67.82 
 
 
93 aa  135  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119264  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1181  30S ribosomal protein S19  66.32 
 
 
95 aa  136  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.538373 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0290  ribosomal protein S19  62.77 
 
 
94 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00533936  normal  0.0406093 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0719  ribosomal protein S19  61.7 
 
 
94 aa  134  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2456  30S ribosomal protein S19  67.02 
 
 
94 aa  133  7.000000000000001e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0781906 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2174  ribosomal protein S19  65.56 
 
 
91 aa  133  8e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4022  30S ribosomal protein S19  65.26 
 
 
95 aa  132  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717988  hitchhiker  0.00000485262 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3020  30S ribosomal protein S19  65.26 
 
 
95 aa  132  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00609436  hitchhiker  0.00770845 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2907  30S ribosomal protein S19  65.96 
 
 
94 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.761008  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  67.42 
 
 
91 aa  131  3.9999999999999996e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0108  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 
92 aa  130  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000257453  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23430  SSU ribosomal protein S19P  69.05 
 
 
85 aa  130  6e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000187491  hitchhiker  0.0000000975507 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2329  ribosomal protein S19  66.29 
 
 
94 aa  130  7.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000239943  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0114  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 
92 aa  129  9e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0114  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 
92 aa  129  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000383993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0110  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 
92 aa  129  9e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.16547e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0108  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 
92 aa  129  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000559577  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0145  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 
92 aa  129  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000029175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0114  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 
92 aa  129  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000118397  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0126  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 
92 aa  129  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09960  SSU ribosomal protein S19P  67.44 
 
 
86 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.328032  hitchhiker  0.00000140006 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2292  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
98 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00274383  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1296  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 
92 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00413729  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2151  SSU ribosomal protein S19P  64.13 
 
 
93 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152821  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0426  30S ribosomal protein S19  62.64 
 
 
93 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0022508  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0198  SSU ribosomal protein S19P  59.57 
 
 
94 aa  129  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0174859  normal  0.0509464 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2419  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
98 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000264449  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0695  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  128  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208226  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2225  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
98 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000482989  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04020  SSU ribosomal protein S19P  64.13 
 
 
93 aa  127  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.904114 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  62.64 
 
 
93 aa  127  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0762  30S ribosomal protein S19  67.86 
 
 
93 aa  127  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000324039  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0229  30S ribosomal protein S19  59.57 
 
 
94 aa  126  8.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0310  30S ribosomal protein S19  63.44 
 
 
93 aa  126  8.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187056 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1619  ribosomal protein S19  67.82 
 
 
88 aa  126  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1934  30S ribosomal protein S19  65.17 
 
 
89 aa  126  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0185  30S ribosomal protein S19  62.64 
 
 
98 aa  125  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000106246  normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6610  ribosomal protein S19  63.04 
 
 
93 aa  125  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1847  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 
98 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.23074  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0402  ribosomal protein S19  65.48 
 
 
93 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1570  ribosomal protein S19  65.12 
 
 
95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000162931  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2563  30S ribosomal protein S19  62.64 
 
 
92 aa  125  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.61073  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2903  ribosomal protein S19  62.11 
 
 
94 aa  125  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  62.64 
 
 
91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2683  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 
93 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2971  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 
93 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.241839  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1157  ribosomal protein S19  63.95 
 
 
86 aa  125  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000321544  hitchhiker  0.000000515171 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0606  ribosomal protein S19  64.37 
 
 
88 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5783  ribosomal protein S19  64.04 
 
 
92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  62.11 
 
 
95 aa  125  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00734  ribosomal protein S19  65.93 
 
 
92 aa  125  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3158  30S ribosomal protein S19  65.12 
 
 
89 aa  124  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2615  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 
92 aa  124  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00302204  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0324  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 
92 aa  124  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0470216  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0869  30S ribosomal protein S19  67.03 
 
 
91 aa  124  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0063  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 
91 aa  124  5e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000291736  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001738  SSU ribosomal protein S19p (S15e)  65.93 
 
 
92 aa  124  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17120  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 
93 aa  123  6e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0814884  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
92 aa  124  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000102796  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0193  hypothetical protein  62.22 
 
 
91 aa  123  7e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.305188 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3754  ribosomal protein S19  61.96 
 
 
93 aa  123  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396407  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1959  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
91 aa  123  8.000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1559  ribosomal protein S19  70.24 
 
 
95 aa  123  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.917547  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2642  SSU ribosomal protein S19P  60.87 
 
 
92 aa  123  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.570508  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0200  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
92 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000160903  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2368  ribosomal protein S19  63.33 
 
 
90 aa  122  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540425  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0235  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
92 aa  122  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4166  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
92 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556834  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0162  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
92 aa  123  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000728304  decreased coverage  0.0000475067 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4313  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
92 aa  122  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000152177  unclonable  0.0000000000439739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4317  ribosomal protein S19  60.22 
 
 
93 aa  123  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3755  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
92 aa  122  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000285402  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2060  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 
98 aa  123  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000251364  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0372  30S ribosomal protein S19  64.04 
 
 
91 aa  122  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.252396  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4052  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
92 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000500624  unclonable  0.00000000000533461 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1646  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
92 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0204  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
92 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000147318  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0174  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
92 aa  122  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186112  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0203  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
92 aa  122  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000219443  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0198  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
92 aa  122  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00349045  hitchhiker  0.00163948 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0152  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
92 aa  122  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012398  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4686  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
92 aa  122  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000144856  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0203  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
92 aa  122  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000108032  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>