More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1389 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1389  50S ribosomal protein L22  100 
 
 
159 aa  318  1.9999999999999998e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000788979  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1297  50S ribosomal protein L22  99.37 
 
 
159 aa  317  3.9999999999999996e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000469382  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1133  50S ribosomal protein L22  73.43 
 
 
147 aa  222  2e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462461  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0958  50S ribosomal protein L22  72.34 
 
 
149 aa  214  2.9999999999999998e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00139982  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0785  50S ribosomal protein L22  65.15 
 
 
149 aa  189  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.363431  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  59.09 
 
 
111 aa  144  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  58.18 
 
 
113 aa  139  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  58.33 
 
 
114 aa  134  7.000000000000001e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2908  50S ribosomal protein L22  53.66 
 
 
125 aa  133  8e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  57.41 
 
 
114 aa  133  9e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  57.27 
 
 
113 aa  133  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  57.27 
 
 
113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  57.27 
 
 
113 aa  131  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  59.65 
 
 
112 aa  131  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  56.48 
 
 
118 aa  130  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1740  50S ribosomal protein L22  56.88 
 
 
120 aa  130  9e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000076776  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  58.18 
 
 
110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  58.18 
 
 
110 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  58.49 
 
 
114 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  59.43 
 
 
116 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1156  ribosomal protein L22  57.27 
 
 
120 aa  128  3e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000440865  hitchhiker  0.000000562165 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  57.27 
 
 
110 aa  128  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  57.8 
 
 
117 aa  128  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  59.26 
 
 
115 aa  127  7.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0325  50S ribosomal protein L22  57.27 
 
 
110 aa  127  7.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0199306  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  56.36 
 
 
113 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0300  ribosomal protein L22  56.36 
 
 
110 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00141002  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2397  50S ribosomal protein L22  56.48 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0178523  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0986  ribosomal protein L22  53.98 
 
 
114 aa  124  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.631891  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0474  50S ribosomal protein L22  55.96 
 
 
110 aa  124  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000332367  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0218  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 
110 aa  124  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000966371  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 
113 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  53.64 
 
 
113 aa  123  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  53.64 
 
 
113 aa  123  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  53.64 
 
 
113 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  53.64 
 
 
113 aa  123  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0064  50S ribosomal protein L22  53.64 
 
 
110 aa  122  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2328  ribosomal protein L22  52.73 
 
 
113 aa  123  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000276049  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2769  ribosomal protein L22  56.07 
 
 
110 aa  122  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000988714  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  55.05 
 
 
113 aa  122  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0163  50S ribosomal protein L22  55.45 
 
 
110 aa  122  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000850597  decreased coverage  0.0000466099 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0763  50S ribosomal protein L22  46.46 
 
 
158 aa  122  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000122399  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0720  ribosomal protein L22  53.64 
 
 
110 aa  121  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0236  50S ribosomal protein L22  55.45 
 
 
110 aa  121  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00450  50S ribosomal protein L22  55.05 
 
 
110 aa  121  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00735993  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0205  50S ribosomal protein L22  55.45 
 
 
110 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000176221  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3754  50S ribosomal protein L22  55.45 
 
 
110 aa  121  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000037277  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0201  50S ribosomal protein L22  55.45 
 
 
110 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000591248  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0204  50S ribosomal protein L22  55.45 
 
 
110 aa  121  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000274538  unclonable  0.0000000000170547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0199  50S ribosomal protein L22  55.45 
 
 
110 aa  121  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0119828  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0153  50S ribosomal protein L22  55.45 
 
 
110 aa  121  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202891  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4051  50S ribosomal protein L22  55.45 
 
 
110 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000608091  unclonable  0.00000000000572517 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0204  50S ribosomal protein L22  55.45 
 
 
110 aa  121  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000013887  hitchhiker  0.0000000012298 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4165  50S ribosomal protein L22  55.45 
 
 
110 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708825  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  52.73 
 
 
113 aa  121  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  52.73 
 
 
113 aa  120  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  52.73 
 
 
113 aa  120  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  52.73 
 
 
113 aa  120  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  52.73 
 
 
113 aa  120  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  52.73 
 
 
113 aa  120  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  52.21 
 
 
117 aa  120  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0175  50S ribosomal protein L22  55.45 
 
 
110 aa  121  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221106  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  52.21 
 
 
117 aa  120  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  52.21 
 
 
117 aa  120  7e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0868  ribosomal protein L22  53.21 
 
 
110 aa  120  8e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0600  50S ribosomal protein L22  54.05 
 
 
120 aa  120  8e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0189  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 
110 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000913672  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4312  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 
110 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000184145  unclonable  0.0000000000444445 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1569  ribosomal protein L22  54.78 
 
 
115 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00016664  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3430  ribosomal protein L22  54.29 
 
 
136 aa  120  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4685  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 
110 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000490323  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0298  ribosomal protein L22  51.82 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.495087  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0852  50S ribosomal protein L22P  55.66 
 
 
113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000720413  hitchhiker  0.0000829756 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4539  50S ribosomal protein L22  52.73 
 
 
110 aa  118  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175116  hitchhiker  0.00188816 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0853  50S ribosomal protein L22  54.21 
 
 
110 aa  118  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0328  50S ribosomal protein L22  52.73 
 
 
110 aa  118  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000986458  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03166  50S ribosomal protein L22  52.73 
 
 
110 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0020187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0398  ribosomal protein L22  52.73 
 
 
110 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000320162  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0489  50S ribosomal protein L22  61 
 
 
110 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144624  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0459  50S ribosomal protein L22  61 
 
 
110 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.292472  unclonable  0.00000017309 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3704  50S ribosomal protein L22  52.73 
 
 
110 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000889443  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4638  50S ribosomal protein L22  52.73 
 
 
110 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0328992  normal  0.0807063 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3631  50S ribosomal protein L22  52.73 
 
 
110 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.026549  normal  0.464818 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3802  50S ribosomal protein L22  52.73 
 
 
110 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0244265  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5074  50S ribosomal protein L22  61 
 
 
110 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000267076  normal  0.274237 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3739  50S ribosomal protein L22  52.73 
 
 
110 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal  0.0231342 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4744  50S ribosomal protein L22  61 
 
 
110 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00307262  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3509  50S ribosomal protein L22  52.73 
 
 
110 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131038  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3798  50S ribosomal protein L22  52.73 
 
 
110 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000622145  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0398  50S ribosomal protein L22  52.73 
 
 
110 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000614919  hitchhiker  0.000253189 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3700  50S ribosomal protein L22  52.73 
 
 
110 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000326609  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2709  50S ribosomal protein L22  51.35 
 
 
111 aa  118  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2394  50S ribosomal protein L22  51.35 
 
 
111 aa  118  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0492  50S ribosomal protein L22  61 
 
 
110 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379964  normal  0.101974 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08900  50S ribosomal protein L22  61 
 
 
110 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0235931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0842  50S ribosomal protein L22  61 
 
 
110 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3904  50S ribosomal protein L22  61 
 
 
110 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.321312  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3610  50S ribosomal protein L22  52.73 
 
 
110 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000037432  hitchhiker  0.00902859 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03117  hypothetical protein  52.73 
 
 
110 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00216887  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09950  LSU ribosomal protein L22P  53.64 
 
 
113 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250914  hitchhiker  0.000000894233 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>