More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1376 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1376  50S ribosomal protein L30  100 
 
 		 67 aa  133  8e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0327114  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1310  50S ribosomal protein L30  100 
 
 		 67 aa  133  8e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988415  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  83.33 
 
 		 61 aa  102  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  71.67 
 
 		 61 aa  93.2  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  62.5 
 
 		 75 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1167  50S ribosomal protein L30  60.66 
 
 		 78 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00970814  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  63.16 
 
 		 60 aa  73.9  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  62.9 
 
 		 62 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  61.4 
 
 		 60 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  61.4 
 
 		 60 aa  72.8  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000219229  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0440  50S ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 60 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  59.68 
 
 		 62 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2693  ribosomal protein L30  54.84 
 
 		 62 aa  70.1  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4932  ribosomal protein L30  60.71 
 
 		 62 aa  70.1  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0130019  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0580  50S ribosomal protein L30  49.21 
 
 		 65 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 61 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  61.02 
 
 		 66 aa  68.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0324  50S ribosomal protein L30P  55.74 
 
 		 60 aa  68.2  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0949  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 60 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 60 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 60 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 60 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 60 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 60 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 60 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 60 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 60 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 60 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 60 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 60 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 60 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  58.93 
 
 		 59 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5029  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 61 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000128267  normal  0.550586 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 60 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6596  ribosomal protein L30  50 
 
 		 61 aa  65.1  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2641  ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 60 aa  64.3  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1203  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  63.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3006  50S ribosomal protein L30  57.69 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.319275  hitchhiker  0.00803225 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2315  ribosomal protein L30  51.67 
 
 		 60 aa  63.5  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0059609  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1340  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 59 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  53.23 
 
 		 62 aa  62.4  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1166  ribosomal protein L30  60.38 
 
 		 60 aa  62  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0608924  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29560  LSU ribosomal protein L30P  50 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.349049  normal  0.73381 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0605  ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.243208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  51.67 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6031  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 61 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2601  50S ribosomal protein L30  60 
 
 		 58 aa  62  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10736  50S ribosomal protein L30  45.9 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000107725  normal  0.417501 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  54.1 
 
 		 61 aa  60.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0076  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.663543  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1889  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3887  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04160  LSU ribosomal protein L30P  46.55 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0698  ribosomal protein L30  50 
 
 		 58 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.298561  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23290  LSU ribosomal protein L30P  59.65 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0884067  hitchhiker  0.00000565029 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 59 aa  60.1  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1143  ribosomal protein L30  56.67 
 
 		 61 aa  59.7  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000025708  normal  0.0109898 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4303  ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2137  50S ribosomal protein L30P  52.54 
 
 		 61 aa  60.1  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274633  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0337  50S ribosomal protein L30  57.14 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000664675  unclonable  0.000000038279 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1854  ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000293494  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2160  ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0544492  normal  0.73473 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1358  ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 61 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0212  LSU ribosomal protein L30P  54.24 
 
 		 63 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161029  normal  0.28126 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0645  ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0776  50S ribosomal protein L30  59.65 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000050093  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0644  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000104871  hitchhiker  0.000000231079 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23620  LSU ribosomal protein L30P  44.83 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844957  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 62 aa  57.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0785  50S ribosomal protein L30  46.67 
 
 		 61 aa  57.8  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00447996  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2921  50S ribosomal protein L30  54.39 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000749762  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5052  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 61 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0761193  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  57.14 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0391  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  57  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000847959  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0243  ribosomal protein L30  52 
 
 		 51 aa  57  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3320  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00901204  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1725  50S ribosomal protein L30  45.9 
 
 		 61 aa  56.6  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000657277  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0399  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2889  ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0737  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 62 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000491198  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1040  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2307  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.227659  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3399  ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 59 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34793  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0619  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.268532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3931  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1920  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 58 aa  54.7  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2405  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137776  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2839  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 59 aa  53.9  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1364  ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 58 aa  54.3  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000295854  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3299  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2278  50S ribosomal protein L30  54.39 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000000449635  hitchhiker  0.00309208 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3425  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.187681 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  50 
 
 		 59 aa  53.9  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3310  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 59 aa  53.5  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129618 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0951  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 59 aa  53.5  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0200139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>