More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1364 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1364  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 427 aa  855    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000237844  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0281  transcription termination factor Rho  78.04 
 
 		 422 aa  674    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.697975  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1322  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 427 aa  855    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239055  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1393  transcription termination factor Rho  77.38 
 
 		 423 aa  664    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.107129  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0034  transcription termination factor Rho  62.44 
 
 		 441 aa  544  1e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.135844  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  60.73 
 
 		 415 aa  513  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  59.76 
 
 		 415 aa  511  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  59.76 
 
 		 415 aa  512  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  59.52 
 
 		 415 aa  512  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  60.98 
 
 		 415 aa  513  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  59.51 
 
 		 415 aa  510  1e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  59.76 
 
 		 415 aa  505  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  59.52 
 
 		 415 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  59.04 
 
 		 415 aa  507  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1711  transcription termination factor Rho  57.04 
 
 		 437 aa  497  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000145962  normal  0.971448 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2875  transcription termination factor Rho  58.15 
 
 		 414 aa  493  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000596182  hitchhiker  0.0000000051711 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18010  transcription termination factor Rho  58.64 
 
 		 418 aa  492  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155456  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0059  transcription termination factor Rho  58.82 
 
 		 436 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.121136  hitchhiker  0.0035916 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3329  transcription termination factor Rho  58.51 
 
 		 424 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000488877  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  55.07 
 
 		 415 aa  489  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2782  transcription termination factor Rho  58.64 
 
 		 434 aa  489  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000423025  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3174  transcription termination factor Rho  56.28 
 
 		 450 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000371975  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3439  transcription termination factor Rho  58.27 
 
 		 424 aa  487  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1339  transcription termination factor Rho  57.35 
 
 		 642 aa  487  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0470  transcription termination factor Rho  56.04 
 
 		 414 aa  486  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000467448  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0491  transcription termination factor Rho  56.01 
 
 		 416 aa  488  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212536 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5016  transcription termination factor Rho  57.01 
 
 		 423 aa  481  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.88034e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5032  transcription termination factor Rho  57.01 
 
 		 423 aa  481  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00629962  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3853  transcription termination factor Rho  57.72 
 
 		 423 aa  482  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000371532  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5424  transcription termination factor Rho  57.01 
 
 		 423 aa  481  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.80667e-59 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3377  transcription termination factor Rho  55.9 
 
 		 416 aa  484  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000542218  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0677  transcription termination factor Rho  56.04 
 
 		 415 aa  482  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000284119  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1562  transcription termination factor Rho  55.13 
 
 		 449 aa  483  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.135636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2408  transcription termination factor Rho  57.52 
 
 		 425 aa  482  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000414081  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5455  transcription termination factor Rho  56.53 
 
 		 423 aa  479  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000522794  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5460  transcription termination factor Rho  57.35 
 
 		 423 aa  481  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000364812  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5181  transcription termination factor Rho  56.77 
 
 		 423 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21574  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5130  transcription termination factor Rho  55.26 
 
 		 420 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0923516  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5575  transcription termination factor Rho  56.77 
 
 		 423 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000155129  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3619  transcription termination factor Rho  55.64 
 
 		 418 aa  481  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1824  transcription termination factor Rho  55.02 
 
 		 422 aa  479  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.025276  normal  0.0977479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2363  transcription termination factor Rho  55.02 
 
 		 422 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016195  normal  0.176581 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5510  transcription termination factor Rho  57.35 
 
 		 423 aa  481  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000155234  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1853  transcription termination factor Rho  55.26 
 
 		 420 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.110087 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6250  transcription termination factor Rho  55.26 
 
 		 420 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156064  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1740  transcription termination factor Rho  55.02 
 
 		 420 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.318458  normal  0.139414 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5497  transcription termination factor Rho  56.53 
 
 		 423 aa  479  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000613532  unclonable  1.32525e-25 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0949  transcription termination factor Rho  55.26 
 
 		 420 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.545356 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1767  transcription termination factor Rho  55.02 
 
 		 420 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1829  transcription termination factor Rho  55.26 
 
 		 420 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156095  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0137  transcription termination factor Rho  56.52 
 
 		 421 aa  479  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246562  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3710  transcription termination factor Rho  54.89 
 
 		 445 aa  479  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238599  hitchhiker  0.000000242256 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0042  transcription termination factor Rho  54.78 
 
 		 420 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.133554  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1503  transcription termination factor Rho  55.05 
 
 		 548 aa  476  1e-133  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000037905  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1187  transcription termination factor Rho  55.29 
 
 		 420 aa  475  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.481707 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1365  transcription termination factor Rho  54.78 
 
 		 420 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0123945  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1444  transcription termination factor Rho  55.02 
 
 		 420 aa  478  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.440911  normal  0.105069 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0264  transcription termination factor Rho  63.51 
 
 		 512 aa  477  1e-133  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2375  transcription termination factor Rho  55.02 
 
 		 420 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1031  transcription termination factor Rho  55.53 
 
 		 420 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0464905  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2217  transcription termination factor Rho  55.02 
 
 		 420 aa  477  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0809447  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2248  transcription termination factor Rho  55.02 
 
 		 420 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.336797  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2210  transcription termination factor Rho  55.02 
 
 		 420 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171913  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3222  transcription termination factor Rho  56.39 
 
 		 444 aa  478  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.584785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0605  transcription termination factor Rho  54.72 
 
 		 447 aa  476  1e-133  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000783157  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1126  transcription termination factor Rho  54.78 
 
 		 420 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722702  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1855  transcription termination factor Rho  54.78 
 
 		 420 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1226  transcription termination factor Rho  54.61 
 
 		 424 aa  476  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1123  transcription termination factor Rho  55.53 
 
 		 420 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.117933  normal  0.145069 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3627  transcription termination factor Rho  55.82 
 
 		 420 aa  477  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.2483  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5130  transcription termination factor Rho  56.87 
 
 		 423 aa  476  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000119523  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4143  transcription termination factor Rho  54.55 
 
 		 419 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1252  transcription termination factor Rho  55.4 
 
 		 457 aa  474  1e-132  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.180774  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0204  transcription termination factor Rho  54.78 
 
 		 419 aa  474  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0734  transcription termination factor Rho  55.13 
 
 		 437 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4128  transcription termination factor Rho  54.55 
 
 		 419 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4246  transcription termination factor Rho  54.55 
 
 		 419 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2341  transcription termination factor Rho  55.34 
 
 		 419 aa  473  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.735775  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4305  transcription termination factor Rho  54.55 
 
 		 419 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0807  transcription termination factor Rho  55.74 
 
 		 418 aa  473  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4011  transcription termination factor Rho  54.14 
 
 		 450 aa  471  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0690  transcription termination factor Rho  54.55 
 
 		 437 aa  471  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3081  transcription termination factor Rho  55.56 
 
 		 484 aa  473  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0157  transcription termination factor Rho  54.55 
 
 		 419 aa  472  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2135  transcription termination factor Rho  55.02 
 
 		 420 aa  473  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173843  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2699  transcription termination factor Rho  55.48 
 
 		 419 aa  472  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000370225  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1968  transcription termination factor Rho  53.69 
 
 		 435 aa  473  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4197  transcription termination factor Rho  54.55 
 
 		 419 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0658  transcription termination factor Rho  55.74 
 
 		 418 aa  473  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1260  transcription termination factor Rho  55.93 
 
 		 422 aa  473  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4194  transcription termination factor Rho  54.07 
 
 		 419 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000794569  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4293  transcription termination factor Rho  54.07 
 
 		 419 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3999  transcription termination factor Rho  54.07 
 
 		 419 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2118  transcription termination factor Rho  54.78 
 
 		 420 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299268  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2130  transcription termination factor Rho  54.83 
 
 		 503 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00148034  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1456  transcription termination factor Rho  53.96 
 
 		 431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00134709  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5215  transcription termination factor Rho  54.07 
 
 		 419 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4139  transcription termination factor Rho  54.07 
 
 		 419 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  56.17 
 
 		 419 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0471  transcription termination factor Rho  54.96 
 
 		 434 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>