170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1355 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1355  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 117 aa  224  3e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00991852  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  93.16 
 
 		 117 aa  197  3e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  62.5 
 
 		 129 aa  147  4e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  51.79 
 
 		 131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  42.61 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  43.18 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  39.56 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  42.05 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73420  ribonuclease P  41.67 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0472215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  38.54 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0008  ribonuclease P  38.54 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000255186 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3088  ribonuclease P protein  42.22 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5311  ribonuclease P  38.54 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6370  ribonuclease P  40.62 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0004  ribonuclease P  36.52 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00123584  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  32.38 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0001  ribonuclease P  38.54 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  37.04 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  34.51 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  34.23 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  33.63 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3609  ribonuclease P protein component  38.04 
 
 		 118 aa  62  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  36.59 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  33.02 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  31.86 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  36 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  37.61 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1265  ribonuclease P protein component  40.45 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000149389  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  37.74 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52470  ribonuclease P  38.54 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  35.35 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2932  hypothetical protein  35.48 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  33.63 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  30.56 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3076  hypothetical protein  34.41 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2760  ribonuclease P  33.33 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000461705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  43.9 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  43.9 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  45 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000158886  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  31.73 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  30.36 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  29.81 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  26.26 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  27.19 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5136  ribonuclease P  36.46 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5745  ribonuclease P  36.46 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936025  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5614  ribonuclease P protein component  36.46 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2602  ribonuclease P protein component  29.91 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.201057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  37.93 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  39.08 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  32.73 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3317  ribonuclease P  32.76 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3615  ribonuclease P protein component  35.35 
 
 		 385 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1919  ribonuclease P protein component  39.44 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.100919  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  31.58 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  31 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2333  ribonuclease P protein component  37.65 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  36.11 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  37.93 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4622  ribonuclease P  37.5 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  35.9 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  31.19 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  31.19 
 
 		 115 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  30.28 
 
 		 115 aa  52.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4037  ribonuclease P  33.04 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  30.28 
 
 		 115 aa  52  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4266  ribonuclease P  33.04 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000515429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  30.28 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682  ribonuclease P protein component  35 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002014  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000192203  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4314  ribonuclease P protein component  34.21 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3035  ribonuclease P protein component  31.58 
 
 		 128 aa  51.2  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  37.65 
 
 		 116 aa  51.2  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  37.65 
 
 		 116 aa  51.2  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3460  ribonuclease P protein component  30.77 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  30.28 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  30.28 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  30.28 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  30.28 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  30.28 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  30.28 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2883  ribonuclease P protein component  35.63 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0117467  normal  0.419637 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  29.82 
 
 		 113 aa  50.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2237  ribonuclease P protein component  32.35 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  40.24 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  32.61 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3897  ribonuclease P protein component  30.43 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0590207  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3777  ribonuclease P  34.91 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000556747  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3155  ribonuclease P protein component  38.16 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0217012  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4486  ribonuclease P protein component  38.89 
 
 		 132 aa  49.7  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000175876  hitchhiker  0.00000000129187 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135  ribonuclease P  36.78 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000166605  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4155  ribonuclease P  31.52 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.58759e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  34.04 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2399  ribonuclease P protein component  30.28 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.71543  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  31.73 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  32.95 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3759  ribonuclease P protein component  31.07 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0030  ribonuclease P  31.52 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00687472  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  30.43 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1863  RNase P protein component  28.97 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.546361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>