More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1322 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  64.31 
 
 
502 aa  680    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  64.31 
 
 
502 aa  680    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2862  glycerol kinase  62.75 
 
 
499 aa  639    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  63.23 
 
 
496 aa  664    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  62.88 
 
 
499 aa  669    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1916  glycerol kinase  67.75 
 
 
496 aa  684    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0267705  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  63.66 
 
 
499 aa  670    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2675  glycerol kinase  63.84 
 
 
498 aa  685    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.732872  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1125  glycerol kinase  68.52 
 
 
510 aa  698    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000150114  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0273  glycerol kinase  61.81 
 
 
502 aa  643    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  63.06 
 
 
495 aa  668    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  62.99 
 
 
494 aa  660    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4168  glycerol kinase  61.05 
 
 
501 aa  657    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  68.17 
 
 
496 aa  728    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  68.38 
 
 
496 aa  730    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  68.38 
 
 
496 aa  729    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  63.21 
 
 
503 aa  676    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  68.36 
 
 
501 aa  727    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3466  glycerol kinase  62.09 
 
 
498 aa  653    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0225971  normal  0.260214 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3905  glycerol kinase  61.87 
 
 
501 aa  662    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  64.92 
 
 
502 aa  686    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  59.76 
 
 
502 aa  645    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  62.58 
 
 
494 aa  658    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2213  glycerol kinase  59.63 
 
 
516 aa  649    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256504  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  65.12 
 
 
507 aa  690    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0041  glycerol kinase  63.82 
 
 
499 aa  666    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.684813  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  63.21 
 
 
503 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2698  glycerol kinase  61.29 
 
 
501 aa  655    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  63.29 
 
 
500 aa  668    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  65.12 
 
 
502 aa  694    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000311367 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  63.01 
 
 
505 aa  672    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  62.78 
 
 
494 aa  659    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  62.88 
 
 
496 aa  675    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0410  glycerol kinase  64.23 
 
 
497 aa  682    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  68.17 
 
 
496 aa  728    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  62.6 
 
 
500 aa  667    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  63.86 
 
 
498 aa  681    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  63.82 
 
 
500 aa  678    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  70.53 
 
 
498 aa  740    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0682  glycerol kinase  63.29 
 
 
505 aa  662    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  96.17 
 
 
496 aa  994    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  62.47 
 
 
499 aa  664    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1389  glycerol kinase  60.45 
 
 
499 aa  659    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  64.31 
 
 
502 aa  680    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  64.23 
 
 
499 aa  674    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  64.23 
 
 
499 aa  676    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  64.92 
 
 
502 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  64.31 
 
 
502 aa  680    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  100 
 
 
496 aa  1017    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  64.31 
 
 
502 aa  680    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  64.31 
 
 
502 aa  680    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  60.32 
 
 
510 aa  647    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  61.69 
 
 
498 aa  645    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  63.97 
 
 
505 aa  677    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  67.56 
 
 
496 aa  724    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  61.79 
 
 
500 aa  660    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  63.86 
 
 
498 aa  681    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1063  glycerol kinase  63.31 
 
 
503 aa  667    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902987  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1461  glycerol kinase  59.72 
 
 
499 aa  655    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  75 
 
 
497 aa  800    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  68.95 
 
 
500 aa  715    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  68.55 
 
 
500 aa  711    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1065  glycerol kinase  58.61 
 
 
500 aa  635    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000150653  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  63.39 
 
 
494 aa  662    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  63.39 
 
 
494 aa  664    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  65.12 
 
 
507 aa  690    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  62.91 
 
 
498 aa  662    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  62.2 
 
 
499 aa  662    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  62.4 
 
 
500 aa  664    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17960  glycerol kinase  63.56 
 
 
505 aa  674    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155837  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1104  glycerol kinase  62.88 
 
 
501 aa  666    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  64.92 
 
 
502 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1803  glycerol kinase  61.29 
 
 
509 aa  664    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1561  glycerol kinase  63.36 
 
 
505 aa  672    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  61.79 
 
 
500 aa  660    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  63.39 
 
 
494 aa  666    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  62.58 
 
 
494 aa  659    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  64.92 
 
 
502 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03313  glycerol kinase  60.81 
 
 
505 aa  646    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  61.82 
 
 
496 aa  656    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  67.7 
 
 
496 aa  724    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  62.65 
 
 
495 aa  653    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  73.94 
 
 
489 aa  758    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3168  glycerol kinase  60.32 
 
 
507 aa  637    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119094  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  62.6 
 
 
500 aa  665    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3525  glycerol kinase  62.15 
 
 
499 aa  660    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413119  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0252  glycerol kinase  64.02 
 
 
497 aa  677    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0912912  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  65.12 
 
 
507 aa  690    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  64.31 
 
 
502 aa  678    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  62.96 
 
 
496 aa  667    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  63.21 
 
 
518 aa  676    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  61.79 
 
 
500 aa  660    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  64.24 
 
 
507 aa  689    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  62.68 
 
 
499 aa  666    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  63.21 
 
 
518 aa  676    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0399  glycerol kinase  61.63 
 
 
495 aa  652    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  62.37 
 
 
494 aa  657    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  63.21 
 
 
518 aa  676    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  63.21 
 
 
518 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  62.17 
 
 
493 aa  656    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>