More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1257 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1257  TPR repeat-containing diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 1203 aa  2420    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1198  TPR repeat-containing protein  88.39 
 
 		 971 aa  1672    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411911  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1199  diguanylate cyclase  98.05 
 
 		 258 aa  523  1e-146  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341711  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1528  diguanylate cyclase  27.75 
 
 		 1339 aa  372  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.646539  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0267  diguanylate cyclase  26.44 
 
 		 1320 aa  325  3e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0266  diguanylate cyclase  24.72 
 
 		 1195 aa  213  1e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1306  diguanylate cyclase  47.31 
 
 		 615 aa  142  4.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.550913  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1715  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.41 
 
 		 791 aa  140  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1483  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.57 
 
 		 335 aa  140  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.882912  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1501  diguanylate cyclase  44.05 
 
 		 360 aa  140  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.15986  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0078  GGDEF domain-containing protein  40 
 
 		 565 aa  140  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2043  GGDEF domain-containing protein  45.91 
 
 		 289 aa  139  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1156  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.11 
 
 		 469 aa  138  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0207  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.5 
 
 		 772 aa  138  8e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53871  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  45.22 
 
 		 775 aa  137  9e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1357  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  48.17 
 
 		 901 aa  137  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351362  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1895  diguanylate cyclase  40.45 
 
 		 555 aa  134  6.999999999999999e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1577  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.41 
 
 		 314 aa  134  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0842  GGDEF domain-containing protein  44.94 
 
 		 391 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000293697  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3316  diguanylate cyclase  43.75 
 
 		 307 aa  134  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0115  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.08 
 
 		 304 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.113218  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1091  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  48.39 
 
 		 424 aa  134  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0655  diguanylate cyclase  41.67 
 
 		 172 aa  133  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000725118  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1741  diguanylate cyclase  44.79 
 
 		 374 aa  133  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.564976  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2165  diguanylate cyclase  43.23 
 
 		 460 aa  133  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4405  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.14 
 
 		 332 aa  132  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.382822 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.04 
 
 		 322 aa  132  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.895619 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  46.41 
 
 		 343 aa  132  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1177  two component signal transduction response regulator  41.62 
 
 		 470 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2156  diguanylate cyclase  43.29 
 
 		 470 aa  132  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0841  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.42 
 
 		 715 aa  132  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.101081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1369  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.31 
 
 		 302 aa  132  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1319  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.3 
 
 		 610 aa  132  5.0000000000000004e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.104887  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1449  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.14 
 
 		 332 aa  132  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1158  diguanylate cyclase  41.86 
 
 		 507 aa  132  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.62 
 
 		 454 aa  131  6e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3087  diguanylate cyclase  45.73 
 
 		 361 aa  132  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0185  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.61 
 
 		 1125 aa  132  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0378  diguanylate cyclase  47.5 
 
 		 422 aa  132  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000891935  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3966  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.77 
 
 		 332 aa  131  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1851  diguanylate cyclase  40.68 
 
 		 620 aa  131  7.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0413  diguanylate cyclase  44.38 
 
 		 342 aa  131  7.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12380  diguanylate cyclase  40.22 
 
 		 499 aa  131  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00534046  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  40.11 
 
 		 686 aa  131  9.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1078  diguanylate cyclase  41.28 
 
 		 507 aa  130  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329883  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0885  membrane associated GGDEF protein  40.66 
 
 		 712 aa  130  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0162  diguanylate cyclase  42.24 
 
 		 614 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0039  diguanylate cyclase  32.4 
 
 		 521 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2111  diguanylate cyclase  43.29 
 
 		 392 aa  131  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1060  diguanylate cyclase  39.33 
 
 		 378 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0114541  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2758  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.9 
 
 		 698 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0952  GGDEF domain-containing protein  41.92 
 
 		 430 aa  130  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2097  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.1 
 
 		 800 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115037 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1719  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.82 
 
 		 563 aa  130  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3621  GGDEF  44.23 
 
 		 413 aa  129  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0388472 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0569  diguanylate cyclase  43.29 
 
 		 403 aa  129  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0836  diguanylate cyclase  42.5 
 
 		 487 aa  129  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.975884  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0413  diguanylate cyclase  40.13 
 
 		 373 aa  129  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.191775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1281  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.67 
 
 		 586 aa  129  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1758  response regulatory protein (sensory transduction system)  44.03 
 
 		 289 aa  129  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.110721  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0148  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  42.14 
 
 		 560 aa  129  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3642  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.49 
 
 		 796 aa  129  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127426  normal  0.751556 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4930  diguanylate cyclase  39.66 
 
 		 530 aa  128  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.22973 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4104  diguanylate cyclase  46.67 
 
 		 610 aa  128  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.147884 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0613  diguanylate cyclase  45.22 
 
 		 611 aa  128  6e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2652  diguanylate cyclase  42.69 
 
 		 559 aa  128  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261673 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  42.17 
 
 		 794 aa  128  7e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0802  diguanylate cyclase  35.53 
 
 		 321 aa  128  7e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2880  GGDEF  44.72 
 
 		 410 aa  128  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.16195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0767  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.13 
 
 		 675 aa  127  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000798179  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0470  GGDEF  43.4 
 
 		 412 aa  127  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.606028 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1844  diguanylate cyclase  35.84 
 
 		 456 aa  127  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.674113  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0094  diguanylate cyclase  41.21 
 
 		 451 aa  127  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0563  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.89 
 
 		 451 aa  127  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0747  diguanylate cyclase  38.86 
 
 		 508 aa  126  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1616  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.37 
 
 		 796 aa  127  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405684 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0299  hypothetical protein  38.39 
 
 		 609 aa  126  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0283  hypothetical protein  38.39 
 
 		 709 aa  126  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1171  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.07 
 
 		 916 aa  126  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1298  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.86 
 
 		 353 aa  126  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000090214  hitchhiker  0.00354722 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0743  diguanylate cyclase  42.33 
 
 		 680 aa  126  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0608  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.89 
 
 		 452 aa  126  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597995 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0085  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.31 
 
 		 301 aa  127  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4523  diguanylate cyclase with GAF sensor  39.89 
 
 		 499 aa  127  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.967133  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2943  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.76 
 
 		 438 aa  127  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.641955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0620  diguanylate cyclase  42.07 
 
 		 517 aa  126  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089586 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1293  diguanylate cyclase  41.36 
 
 		 432 aa  126  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.32079e-19 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2683  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.36 
 
 		 505 aa  125  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4141  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.51 
 
 		 312 aa  125  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.812185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1212  diguanylate cyclase  41.14 
 
 		 578 aa  125  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1157  PAS:GGDEF  40.35 
 
 		 418 aa  125  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0602  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.33 
 
 		 451 aa  125  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2425  diguanylate cyclase  40.74 
 
 		 353 aa  125  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3072  diguanylate cyclase  40.72 
 
 		 356 aa  125  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000986718 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0214  diguanylate cyclase  42.69 
 
 		 362 aa  125  5e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1382  response regulator receiver protein  41.1 
 
 		 302 aa  125  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4400  diguanylate cyclase  42.33 
 
 		 681 aa  125  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.118889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2825  PAS:GGDEF  44.59 
 
 		 548 aa  125  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.067576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0604  diguanylate cyclase  39.05 
 
 		 291 aa  125  7e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.436873  normal  0.310553 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0157  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.2 
 
 		 917 aa  124  7e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>