More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1228 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  99.31 
 
 
433 aa  862    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  100 
 
 
433 aa  863    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  71.98 
 
 
435 aa  597  1e-169  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0645  signal recognition particle protein  67.63 
 
 
434 aa  580  1e-164  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.196271  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  63.7 
 
 
439 aa  558  1e-158  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  59.05 
 
 
446 aa  522  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  58.56 
 
 
443 aa  510  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  57.86 
 
 
445 aa  486  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  56.81 
 
 
451 aa  484  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  55.12 
 
 
443 aa  481  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  56.54 
 
 
446 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  55.63 
 
 
448 aa  480  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  57.49 
 
 
446 aa  474  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  57.6 
 
 
444 aa  475  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.83 
 
 
447 aa  474  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  55.29 
 
 
453 aa  473  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  58.57 
 
 
447 aa  473  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  55.08 
 
 
446 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  53.72 
 
 
479 aa  468  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  55.53 
 
 
492 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  56.9 
 
 
454 aa  468  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  56.9 
 
 
454 aa  468  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  54.57 
 
 
455 aa  465  9.999999999999999e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  54.98 
 
 
469 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  56.02 
 
 
452 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1538  signal recognition particle protein  57.7 
 
 
436 aa  463  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000016303  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  53.94 
 
 
450 aa  462  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.32 
 
 
454 aa  464  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  54.26 
 
 
449 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1427  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.66 
 
 
458 aa  462  1e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0277163  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  55.14 
 
 
449 aa  464  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  55.09 
 
 
452 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  54.67 
 
 
449 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  54.67 
 
 
449 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  54.44 
 
 
449 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  54.67 
 
 
449 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  54.67 
 
 
449 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  54.44 
 
 
449 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  54.44 
 
 
449 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  54.44 
 
 
449 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  54.55 
 
 
449 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  54.67 
 
 
449 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  54.1 
 
 
455 aa  460  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  53.3 
 
 
493 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  54.44 
 
 
449 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  54.1 
 
 
455 aa  460  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1062  signal recognition particle protein  55.25 
 
 
457 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0147174  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  54.99 
 
 
457 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  53.33 
 
 
458 aa  456  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  53.33 
 
 
458 aa  456  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  55.24 
 
 
444 aa  457  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1014  signal recognition particle protein  54.55 
 
 
449 aa  456  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000130193  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  52.78 
 
 
518 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.42 
 
 
462 aa  455  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  55.01 
 
 
444 aa  456  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02499  Signal Recognition Particle (SRP) component with 4.5S RNA (ffs)  54.95 
 
 
453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0363313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1064  signal recognition particle protein  54.95 
 
 
453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203805  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3849  signal recognition particle protein  54.95 
 
 
453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000605639  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  53.94 
 
 
448 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1356  signal recognition particle protein  54.99 
 
 
457 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2894  signal recognition particle protein  54.95 
 
 
453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000003333  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  53.94 
 
 
463 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2769  signal recognition particle protein  54.95 
 
 
453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000211534  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2762  signal recognition particle protein  54.95 
 
 
453 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00925068  normal  0.0680462 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02463  hypothetical protein  54.95 
 
 
453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259356  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  53.88 
 
 
512 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  55.58 
 
 
453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2999  signal recognition particle protein  54.95 
 
 
453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000534435  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  53.72 
 
 
449 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  55.84 
 
 
452 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1073  signal recognition particle protein  54.95 
 
 
453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  normal  0.0192406 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  53.41 
 
 
443 aa  451  1.0000000000000001e-126  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2311  signal recognition particle protein  53.44 
 
 
485 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2891  signal recognition particle protein  54.72 
 
 
453 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0766211  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4073  signal recognition particle protein  53.49 
 
 
463 aa  451  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66452  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2873  signal recognition particle protein  54.72 
 
 
453 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110714  normal  0.0858138 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2823  signal recognition particle protein  54.72 
 
 
453 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00851471  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2861  signal recognition particle protein  53.12 
 
 
453 aa  451  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1253  signal recognition particle protein  55.02 
 
 
457 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000049947  hitchhiker  0.0000752283 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  55.58 
 
 
453 aa  451  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  54.65 
 
 
449 aa  451  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  53.35 
 
 
444 aa  449  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2893  signal recognition particle protein  54.72 
 
 
453 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0469323  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1670  signal recognition particle protein  52.52 
 
 
458 aa  448  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2839  signal recognition particle protein  54.52 
 
 
457 aa  451  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000124707  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2921  signal recognition particle protein  54.52 
 
 
457 aa  451  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000450795  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2921  signal recognition particle protein  54.79 
 
 
457 aa  450  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00726192  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3018  signal recognition particle protein  54.52 
 
 
457 aa  451  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000039159  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.49 
 
 
449 aa  451  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3005  signal recognition particle protein  54.72 
 
 
453 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3365  signal recognition particle protein  53.35 
 
 
453 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.089536  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0467  hypothetical protein  53.7 
 
 
458 aa  445  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3091  signal recognition particle protein  54.48 
 
 
453 aa  447  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113189  normal  0.0737969 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1048  signal recognition particle protein  55.25 
 
 
457 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000196553  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.7 
 
 
512 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3230  signal recognition particle protein  53.35 
 
 
453 aa  448  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0218227  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  52.71 
 
 
439 aa  448  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0884  signal recognition particle protein  53.35 
 
 
453 aa  448  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138728  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  54.4 
 
 
453 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  50.57 
 
 
508 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>