242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1143 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1143  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.37182  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0987  hypothetical protein  97.95 
 
 
292 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101858  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1679  hypothetical protein  49.66 
 
 
291 aa  287  1e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.699908  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0101  hypothetical protein  44.67 
 
 
290 aa  236  3e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0157028  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0098  hypothetical protein  37.76 
 
 
294 aa  209  5e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.547485  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2881  hypothetical protein  34.13 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000426445  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3480  hypothetical protein  34.69 
 
 
295 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2471  hypothetical protein  32.31 
 
 
295 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3896  hypothetical protein  34.26 
 
 
289 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000579804  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2304  hypothetical protein  33.44 
 
 
295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00318843  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0011  YicC domain protein  33.56 
 
 
292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.272506  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1774  hypothetical protein  35.53 
 
 
295 aa  151  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.593354  normal  0.167904 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1763  hypothetical protein  34.47 
 
 
290 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2607  hypothetical protein  33.22 
 
 
291 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.034124  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1599  hypothetical protein  33.78 
 
 
292 aa  149  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000017463  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2975  hypothetical protein  31.63 
 
 
295 aa  148  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0838  YicC domain protein  36.33 
 
 
293 aa  148  9e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.422723  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3822  hypothetical protein  32.43 
 
 
295 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3135  hypothetical protein  30.95 
 
 
310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0374  hypothetical protein  34.45 
 
 
300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00280201  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1684  hypothetical protein  31.56 
 
 
295 aa  145  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1239  hypothetical protein  31.74 
 
 
292 aa  145  6e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.369152  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0407  hypothetical protein  33.45 
 
 
295 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.122152  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1721  hypothetical protein  33.22 
 
 
294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0372  hypothetical protein  34.13 
 
 
291 aa  145  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.816164  normal  0.284607 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2003  hypothetical protein  32.88 
 
 
294 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0403  hypothetical protein  33.66 
 
 
295 aa  144  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0196247  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1061  hypothetical protein  33.9 
 
 
295 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1457  hypothetical protein  32.54 
 
 
295 aa  142  6e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500736  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0305  hypothetical protein  34.77 
 
 
295 aa  142  6e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000735483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1317  hypothetical protein  33.56 
 
 
294 aa  142  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.269981  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2320  hypothetical protein  31.99 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000274769  hitchhiker  0.00243432 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0758  hypothetical protein  31.63 
 
 
295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.185602 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3632  hypothetical protein  34.69 
 
 
293 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.101055 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2788  hypothetical protein  33.22 
 
 
291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3719  hypothetical protein  28.28 
 
 
304 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.381583  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1291  hypothetical protein  32.32 
 
 
294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40526  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3355  hypothetical protein  33.33 
 
 
295 aa  139  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.649105 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2693  hypothetical protein  33.22 
 
 
291 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1534  hypothetical protein  31.63 
 
 
296 aa  138  8.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0415329  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1698  hypothetical protein  33 
 
 
292 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.466508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3972  hypothetical protein  32.44 
 
 
291 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00569731  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1204  hypothetical protein  32.54 
 
 
295 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118666 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2349  hypothetical protein  31.29 
 
 
295 aa  136  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2522  hypothetical protein  31.1 
 
 
293 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1271  hypothetical protein  32.11 
 
 
291 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00975001  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1056  hypothetical protein  32.76 
 
 
291 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000165495  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2574  hypothetical protein  33.11 
 
 
291 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0989  YicC domain protein  33.33 
 
 
294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0120989 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3921  hypothetical protein  31.19 
 
 
291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.831608  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3887  hypothetical protein  31.19 
 
 
291 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000222822 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3916  hypothetical protein  31.19 
 
 
291 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3724  hypothetical protein  31.19 
 
 
291 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3614  hypothetical protein  31.19 
 
 
291 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4011  hypothetical protein  31.19 
 
 
291 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3632  hypothetical protein  31.19 
 
 
291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2782  domain of unknown function DUF1732  31.53 
 
 
291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1469  domain of unknown function DUF1732  32.78 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000162947  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1033  domain of unknown function DUF1732  31.29 
 
 
293 aa  130  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1764  hypothetical protein  31.97 
 
 
295 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.58123  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0890  hypothetical protein  30.72 
 
 
292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000147276  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3194  hypothetical protein  30.64 
 
 
291 aa  129  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0395546 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2328  hypothetical protein  32.33 
 
 
292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0372766  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0575  hypothetical protein  30.49 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0848  hypothetical protein  31.97 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0065  hypothetical protein  29.97 
 
 
297 aa  127  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2525  hypothetical protein  31.1 
 
 
291 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1327  protein of unknown function DUF1732  33.11 
 
 
291 aa  126  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0133754  normal  0.451646 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4021  hypothetical protein  28.86 
 
 
288 aa  125  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3696  hypothetical protein  30.77 
 
 
291 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1952  protein of unknown function DUF1732  28.67 
 
 
294 aa  125  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.523153  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1049  hypothetical protein  33.11 
 
 
292 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120663 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  33.67 
 
 
288 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2402  hypothetical protein  31.23 
 
 
293 aa  123  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0682346  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  32.32 
 
 
309 aa  122  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1988  hypothetical protein  30.61 
 
 
288 aa  122  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3214  hypothetical protein  32.76 
 
 
292 aa  122  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0463  hypothetical protein  31.05 
 
 
299 aa  122  7e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1284  hypothetical protein  29.69 
 
 
292 aa  122  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00734721  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2287  hypothetical protein  32 
 
 
291 aa  122  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1999  hypothetical protein  29.15 
 
 
304 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5203  hypothetical protein  28.77 
 
 
287 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3684  hypothetical protein  27.65 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0517661 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1528  hypothetical protein  29.29 
 
 
294 aa  121  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214783  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0178  hypothetical protein  29.11 
 
 
287 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.952539  hitchhiker  0.0000731437 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0468  hypothetical protein  31.05 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.306988  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2239  hypothetical protein  31.23 
 
 
292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  31.53 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1946  hypothetical protein  32.42 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2276  domain of unknown function DUF1732  28.86 
 
 
304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173041  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1488  domain of unknown function DUF1732  30.95 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.283341 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5295  hypothetical protein  28.77 
 
 
287 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10654  normal  0.478685 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1316  domain of unknown function DUF1732  32.09 
 
 
292 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1993  hypothetical protein  30.03 
 
 
288 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0095  hypothetical protein  29.9 
 
 
287 aa  119  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403752  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0046  hypothetical protein  29 
 
 
288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3582  hypothetical protein  30.23 
 
 
303 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0102309  normal  0.126925 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3163  hypothetical protein  31.76 
 
 
292 aa  118  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0449219  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0474  hypothetical protein  30.79 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2445  hypothetical protein  31.91 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.465243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>