259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1112 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  568  1e-161  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  98.26 
 
 
288 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0944  hypothetical protein  57.62 
 
 
279 aa  288  6e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  50.36 
 
 
277 aa  269  4e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0163  hypothetical protein  46.72 
 
 
288 aa  239  5e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.532161  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0199  hypothetical protein  43.64 
 
 
276 aa  204  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113575  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0201  hypothetical protein  45.38 
 
 
276 aa  202  6e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.930951  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.82 
 
 
283 aa  154  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  35.71 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  33.67 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  34.01 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  33.67 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  33.67 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  33.67 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  32.99 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  32.99 
 
 
301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  32.65 
 
 
303 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  32.21 
 
 
301 aa  136  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  32.65 
 
 
301 aa  136  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  32.55 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  32.78 
 
 
298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.77 
 
 
308 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  30.63 
 
 
319 aa  127  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  37.15 
 
 
296 aa  127  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  32.08 
 
 
305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  32.01 
 
 
294 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  31.79 
 
 
306 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.23 
 
 
312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.1 
 
 
301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.32 
 
 
343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  32.1 
 
 
294 aa  117  3e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0350  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.82 
 
 
290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  30.88 
 
 
301 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.25 
 
 
293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  31.17 
 
 
322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  34.96 
 
 
288 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1656  permeases of the drug/metabolite transporter  31.35 
 
 
307 aa  109  6e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  28.08 
 
 
316 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  28.08 
 
 
358 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  31.34 
 
 
295 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.51 
 
 
301 aa  105  8e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  29.39 
 
 
299 aa  105  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.43 
 
 
289 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  30.99 
 
 
302 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  30.63 
 
 
295 aa  104  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.73 
 
 
294 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  26.94 
 
 
314 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  29.15 
 
 
295 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1854  hypothetical protein  28.04 
 
 
316 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.135486 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1406  hypothetical protein  30.42 
 
 
312 aa  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0365604  normal  0.0466705 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  30.31 
 
 
308 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  26.91 
 
 
300 aa  99.4  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2977  hypothetical protein  24.83 
 
 
309 aa  99.4  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.5 
 
 
308 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3470  hypothetical protein  27.72 
 
 
312 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461647  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.69 
 
 
302 aa  97.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.29 
 
 
302 aa  97.4  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.01 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  28.52 
 
 
297 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.8 
 
 
308 aa  97.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.2 
 
 
297 aa  97.4  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  30.39 
 
 
295 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.39 
 
 
295 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3251  hypothetical protein  26.16 
 
 
311 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184302  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0545  hypothetical protein  26.19 
 
 
308 aa  96.3  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1796  permeases of the drug/metabolite transporter  29.75 
 
 
292 aa  96.3  5e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.463066  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  30.94 
 
 
286 aa  96.3  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  27.13 
 
 
336 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  29.03 
 
 
307 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  27.4 
 
 
317 aa  94.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.86 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  30.39 
 
 
295 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.23 
 
 
295 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1696  hypothetical protein  31.85 
 
 
298 aa  94  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.591039 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.6 
 
 
296 aa  92.8  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97109  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  28.77 
 
 
323 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  29.03 
 
 
307 aa  92.4  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4892  hypothetical protein  28.57 
 
 
307 aa  92  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131621  hitchhiker  0.000211269 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  30.8 
 
 
292 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0138  hypothetical protein  27.78 
 
 
292 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.13 
 
 
315 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.09 
 
 
296 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  30.24 
 
 
299 aa  91.3  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.59 
 
 
312 aa  90.9  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2471  hypothetical protein  28.35 
 
 
360 aa  90.5  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0181629  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  27.89 
 
 
307 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  26.28 
 
 
310 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1728  permeases of the drug/metabolite transporter  26.87 
 
 
302 aa  90.5  3e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3091  hypothetical protein  30.18 
 
 
294 aa  90.5  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0145  hypothetical protein  28.52 
 
 
299 aa  90.5  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 
308 aa  90.5  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461902  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1518  hypothetical protein  24.57 
 
 
307 aa  90.1  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1325  integral membrane protein  30.3 
 
 
308 aa  89  7e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0457  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.62 
 
 
313 aa  89  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0073  hypothetical protein  28.74 
 
 
282 aa  89  9e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0849  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.39 
 
 
290 aa  88.6  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266368  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5197  hypothetical protein  29.33 
 
 
288 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5662  hypothetical protein  29.33 
 
 
288 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.85 
 
 
297 aa  87  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4403  hypothetical protein  23.21 
 
 
305 aa  86.3  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0375849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>