111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1093 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1027  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 98 aa  188  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1093  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 98 aa  188  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.869762  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1355  protein of unknown function YGGT  51.52 
 
 		 100 aa  95.5  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1540  protein of unknown function YGGT  44.9 
 
 		 96 aa  79  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.180759  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  36.73 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0154  protein of unknown function YGGT  42.86 
 
 		 98 aa  70.9  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105127  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  33.67 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  33.67 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  37.37 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  40 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  40 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1696  protein of unknown function YGGT  34.34 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.471282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0149  protein of unknown function YGGT  32.32 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.041214 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1665  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.905288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  34.52 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  32.14 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  32.14 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0679  protein of unknown function YGGT  32.63 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345775  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  30.34 
 
 		 197 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  29.21 
 
 		 197 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  29.21 
 
 		 197 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  31.43 
 
 		 192 aa  51.2  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  35.37 
 
 		 93 aa  50.4  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  30.49 
 
 		 106 aa  50.4  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  29.21 
 
 		 196 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  27.38 
 
 		 196 aa  48.9  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  30.3 
 
 		 182 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000825612  normal  0.409234 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3886  hypothetical protein  35.94 
 
 		 177 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0843847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1135  protein of unknown function YGGT  31.31 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000824226  normal  0.525534 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  37.25 
 
 		 189 aa  48.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0580  hypothetical protein  28.99 
 
 		 194 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.471121  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  36.51 
 
 		 182 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0439  yggt family protein  34.41 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000131375  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  32.14 
 
 		 196 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  31.58 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3042  protein of unknown function YGGT  39.68 
 
 		 182 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245532  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3185  protein of unknown function YGGT  39.68 
 
 		 182 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000491839  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1336  protein of unknown function YGGT  39.68 
 
 		 182 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000680586  hitchhiker  0.0000219253 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3027  protein of unknown function YGGT  39.68 
 
 		 182 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000050243  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0933  protein of unknown function YGGT  29.89 
 
 		 85 aa  47  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  37.5 
 
 		 187 aa  47  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0106  yggt family protein  29.29 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  35.9 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  40.91 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  30.95 
 
 		 196 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2172  hypothetical protein  26.44 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0505653  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2189  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.111036 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  31.03 
 
 		 199 aa  46.2  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  30.95 
 
 		 196 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2426  protein of unknown function YGGT  32.5 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  30.95 
 
 		 196 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  34.92 
 
 		 182 aa  45.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  34.92 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  34.92 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  26.39 
 
 		 188 aa  45.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  39.19 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1262  protein of unknown function YGGT  34.92 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0091593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2921  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 		 184 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.317852  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02073  hypothetical protein  37.31 
 
 		 183 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.616502 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0947  protein of unknown function YGGT  39.22 
 
 		 192 aa  44.3  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1125  protein of unknown function YGGT  29.29 
 
 		 182 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000165213  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  30.1 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1379  yggt family protein  32.26 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  36.51 
 
 		 184 aa  43.5  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000426882  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0493  protein of unknown function YGGT  35 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.197871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  34.43 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  35.62 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  34.72 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0166  hypothetical protein  38.89 
 
 		 189 aa  42  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000107926  hitchhiker  0.0000185577 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0178  protein of unknown function YGGT  38.89 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00798567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0053  protein of unknown function YGGT  30.14 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  36.51 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  30.91 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1212  protein of unknown function YGGT  38.89 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177861 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1237  protein of unknown function YGGT  40 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.371486  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1971  protein of unknown function YGGT  55.26 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.188366 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  27.4 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  37.88 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5573  hypothetical protein  36.76 
 
 		 187 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  32.94 
 
 		 96 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  31.52 
 
 		 96 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0338  protein of unknown function YGGT  40 
 
 		 188 aa  41.6  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171919  hitchhiker  0.00000000521514 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0828  YggT family membrane protein  32.81 
 
 		 184 aa  41.6  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52765  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0829  protein of unknown function YGGT  32.81 
 
 		 184 aa  41.6  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0758  protein of unknown function YGGT  25.64 
 
 		 184 aa  41.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1362  protein of unknown function YGGT  31.67 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  30.59 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0140  YggT family membrane protein  31.46 
 
 		 184 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236591 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1330  protein of unknown function YGGT  28.28 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008416 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3706  protein of unknown function YGGT  33.78 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0063  hypothetical protein  47.92 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00721  hypothetical protein  47.92 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  33.7 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3348  YGGT family protein  23.61 
 
 		 188 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.299187  normal  0.126614 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3340  YGGT family protein  23.61 
 
 		 188 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.350216 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3275  YGGT family protein  23.61 
 
 		 188 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3444  YGGT family protein  23.61 
 
 		 188 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.119003 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  29.17 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4335  protein of unknown function YGGT  42.86 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.680603  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>