175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1090 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  99.62 
 
 		 1061 aa  2138    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 1061 aa  2145    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  47.03 
 
 		 1096 aa  531  1e-149  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  40.24 
 
 		 1111 aa  464  1e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  39.46 
 
 		 1153 aa  442  9.999999999999999e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  29 
 
 		 1040 aa  212  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  29.15 
 
 		 364 aa  155  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  26.92 
 
 		 388 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  25.95 
 
 		 356 aa  130  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  24.33 
 
 		 365 aa  109  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 434 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  23.74 
 
 		 389 aa  105  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  26.06 
 
 		 382 aa  103  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  24.79 
 
 		 400 aa  102  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  24.56 
 
 		 403 aa  102  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  24.03 
 
 		 401 aa  101  6e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  21.77 
 
 		 418 aa  100  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  25.59 
 
 		 392 aa  98.2  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  24.02 
 
 		 391 aa  97.4  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  24.74 
 
 		 371 aa  95.5  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  23.24 
 
 		 395 aa  95.1  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  23.96 
 
 		 391 aa  94.7  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  23.2 
 
 		 401 aa  94  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  22.97 
 
 		 395 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  24.14 
 
 		 358 aa  94  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  24.38 
 
 		 389 aa  93.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  25.35 
 
 		 391 aa  92.4  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  23.54 
 
 		 417 aa  91.3  8e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  25.66 
 
 		 387 aa  90.1  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  22.65 
 
 		 356 aa  89  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  26.04 
 
 		 380 aa  89.4  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  21.11 
 
 		 359 aa  89  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  25.54 
 
 		 393 aa  88.2  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  25.54 
 
 		 393 aa  88.2  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  21.53 
 
 		 391 aa  85.9  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  22.43 
 
 		 374 aa  86.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  21.1 
 
 		 364 aa  86.3  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  23.69 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  22.42 
 
 		 792 aa  84.7  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  23.22 
 
 		 384 aa  84  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  22.07 
 
 		 359 aa  84  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  23.16 
 
 		 399 aa  84  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  22.78 
 
 		 362 aa  83.2  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  24.19 
 
 		 391 aa  83.6  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  23.42 
 
 		 360 aa  83.2  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  21.12 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  26.73 
 
 		 495 aa  81.3  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  23.72 
 
 		 442 aa  79.3  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  23.25 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0027  permease YjgP/YjgQ family protein  25.41 
 
 		 357 aa  79  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  21.19 
 
 		 357 aa  78.6  0.0000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  22.62 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  24.23 
 
 		 418 aa  77.4  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  22.16 
 
 		 386 aa  77.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  22.53 
 
 		 363 aa  77.8  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  22.29 
 
 		 397 aa  76.6  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  26.18 
 
 		 442 aa  76.6  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  22.97 
 
 		 360 aa  76.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  22.19 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  22.01 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  23.55 
 
 		 401 aa  73.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  24.48 
 
 		 443 aa  72.8  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  23.12 
 
 		 403 aa  72.8  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  23.26 
 
 		 360 aa  72  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  22.06 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  20.48 
 
 		 379 aa  70.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  20.17 
 
 		 361 aa  70.5  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  21.88 
 
 		 386 aa  69.7  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  23.1 
 
 		 358 aa  69.7  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  23.77 
 
 		 359 aa  69.7  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  23.31 
 
 		 359 aa  69.3  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  20.99 
 
 		 362 aa  69.3  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  23.2 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2021  permease YjgP/YjgQ family protein  20.31 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  27.46 
 
 		 481 aa  67.4  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  25.69 
 
 		 441 aa  67.4  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1043  hypothetical protein  20.06 
 
 		 377 aa  66.2  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0296445  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0684  permease YjgP/YjgQ family protein  22.37 
 
 		 346 aa  66.2  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000671821  normal  0.0817909 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  25.31 
 
 		 358 aa  66.2  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  23.04 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0106  permease YjgP/YjgQ family protein  25.6 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  24.11 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2344  permease YjgP/YjgQ family protein  23.19 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  18.48 
 
 		 358 aa  63.9  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  21.29 
 
 		 395 aa  64.3  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  22.53 
 
 		 394 aa  63.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  20.81 
 
 		 395 aa  63.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  24.75 
 
 		 444 aa  62  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06260  hypothetical protein  24.3 
 
 		 456 aa  61.6  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0371515  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  22.01 
 
 		 356 aa  61.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0685  permease YjgP/YjgQ family protein  22.48 
 
 		 337 aa  61.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000242264  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  28.8 
 
 		 388 aa  60.1  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2733  permease YjgP/YjgQ family protein  21.05 
 
 		 360 aa  60.1  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.193527  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  27.75 
 
 		 480 aa  59.7  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  25.15 
 
 		 705 aa  59.7  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  20.91 
 
 		 360 aa  59.3  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  20.56 
 
 		 364 aa  58.9  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  22.1 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  21.14 
 
 		 396 aa  57.4  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>