More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1071 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1071  butyrate kinase  100 
 
 
357 aa  720    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1041  butyrate kinase  98.04 
 
 
357 aa  708    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.496289  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0109  butyrate kinase  61.32 
 
 
356 aa  422  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0106  butyrate kinase  57.67 
 
 
357 aa  416  9.999999999999999e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0591  butyrate kinase  53.24 
 
 
362 aa  371  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1470  butyrate kinase  53.09 
 
 
362 aa  371  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0107  butyrate kinase  49.17 
 
 
363 aa  343  2e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.215976  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1069  butyrate kinase  48.73 
 
 
375 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21870  butyrate kinase  47.58 
 
 
359 aa  332  5e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0939  butyrate kinase  48.59 
 
 
355 aa  332  6e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2700  butyrate kinase  50.43 
 
 
352 aa  330  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2348  butyrate kinase  47.29 
 
 
352 aa  327  3e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311163  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2307  butyrate kinase  47.61 
 
 
370 aa  323  3e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0936  butyrate kinase  47.86 
 
 
353 aa  318  6e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1680  butyrate kinase  48.16 
 
 
358 aa  318  1e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00170652  normal  0.0185756 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0108  butyrate kinase  46.18 
 
 
361 aa  317  3e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.835306  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2858  butyrate kinase  46.59 
 
 
367 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0590  butyrate kinase  46.91 
 
 
361 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4005  butyrate kinase  46.02 
 
 
367 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.140021  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4236  butyrate kinase  45.48 
 
 
367 aa  301  1e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0960  butyrate kinase  45.45 
 
 
367 aa  301  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0659702 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0263  butyrate kinase  47.03 
 
 
370 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4069  butyrate kinase  45.74 
 
 
367 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3907  butyrate kinase  45.74 
 
 
367 aa  300  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3916  butyrate kinase  45.74 
 
 
367 aa  300  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0615579  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4386  butyrate kinase  45.74 
 
 
367 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4184  butyrate kinase  45.74 
 
 
367 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000389222 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4274  butyrate kinase  45.45 
 
 
367 aa  300  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4294  butyrate kinase  45.17 
 
 
367 aa  298  8e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1472  butyrate kinase  46.76 
 
 
355 aa  296  5e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2852  butyrate kinase  42.46 
 
 
361 aa  287  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3544  butyrate kinase  42.05 
 
 
362 aa  285  8e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.505108  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2656  butyrate kinase  43.5 
 
 
356 aa  284  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1109  butyrate kinase  42.33 
 
 
361 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2342  butyrate kinase  43.22 
 
 
356 aa  282  5.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06760  butyrate kinase  42.9 
 
 
356 aa  281  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3152  butyrate kinase  42.33 
 
 
357 aa  278  7e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2128  butyrate kinase  42.66 
 
 
362 aa  276  4e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2844  butyrate kinase  43.47 
 
 
358 aa  275  7e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2358  butyrate kinase  42.09 
 
 
362 aa  273  3e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0714814  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0042  butyrate kinase  41.71 
 
 
368 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0058  butyrate kinase  40.86 
 
 
376 aa  269  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.870551  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0046  butyrate kinase  41.71 
 
 
376 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.248068  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2106  butyrate kinase  41.88 
 
 
359 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0045  butyrate kinase  38.57 
 
 
366 aa  239  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.90675 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3128  butyrate kinase  37.57 
 
 
372 aa  237  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01633  butyrate kinase  39.04 
 
 
360 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2330  butyrate kinase  40.39 
 
 
372 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108416 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2626  butyrate kinase  34.15 
 
 
453 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1366  butyrate kinase  36.17 
 
 
370 aa  214  9.999999999999999e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0454  butyrate kinase  36.81 
 
 
359 aa  206  7e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1383  butyrate kinase  31.84 
 
 
356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000142085  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0258  Butyrate kinase  34.93 
 
 
333 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  27.93 
 
 
380 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3242  propionate/acetate kinase  24.86 
 
 
402 aa  86.7  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0583  propionate/acetate kinase  24.79 
 
 
402 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0104  acetate kinase  25.68 
 
 
397 aa  86.3  7e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.66342  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3411  propionate/acetate kinase  24.65 
 
 
402 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02982  propionate kinase/acetate kinase C, anaerobic  24.65 
 
 
406 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0588  acetate kinase  24.65 
 
 
402 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02933  hypothetical protein  24.65 
 
 
406 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3303  propionate/acetate kinase  24.65 
 
 
402 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.307488  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3562  propionate/acetate kinase  24.71 
 
 
402 aa  85.1  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4428  propionate/acetate kinase  24.65 
 
 
402 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0208256 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3589  propionate/acetate kinase  24.36 
 
 
402 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.916752  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0803  acetate kinase  29.13 
 
 
398 aa  83.6  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102321  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  26.61 
 
 
405 aa  82.4  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1915  acetate kinase  30.81 
 
 
399 aa  81.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.305645  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  26.36 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  27.32 
 
 
401 aa  80.9  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  26.96 
 
 
394 aa  80.1  0.00000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3600  propionate/acetate kinase  26.35 
 
 
402 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.941292  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3504  propionate/acetate kinase  25.71 
 
 
402 aa  79.7  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3537  propionate/acetate kinase  26.35 
 
 
402 aa  79.7  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.831906  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3430  propionate/acetate kinase  26.35 
 
 
402 aa  79.7  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3433  propionate/acetate kinase  26.35 
 
 
402 aa  79.7  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4526  acetate kinase  27.33 
 
 
593 aa  79.7  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  25.65 
 
 
404 aa  79  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0994  acetate kinase  26.53 
 
 
397 aa  79  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  9.48202e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0788  acetate kinase  25.44 
 
 
396 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.119296  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  26.02 
 
 
396 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  26.02 
 
 
396 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0642  acetate kinase  25.57 
 
 
399 aa  77.4  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.376841  normal  0.374072 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0056  acetate kinase  25.36 
 
 
389 aa  77  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.614754  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  29.76 
 
 
404 aa  76.6  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  26.3 
 
 
399 aa  76.6  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2559  acetate kinase  24.85 
 
 
400 aa  76.3  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.139439  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  27.11 
 
 
398 aa  76.3  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  27.46 
 
 
402 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2566  acetate kinase  24.52 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3470  acetate kinase  28.99 
 
 
392 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.787409 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2478  acetate kinase  24.52 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.679526  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2578  acetate kinase  24.52 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2523  acetate kinase  24.52 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.340235 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0469  acetate kinase  26.18 
 
 
419 aa  75.1  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0464018  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2686  acetate kinase  24.52 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.888015 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1133  acetate kinase  24.22 
 
 
401 aa  74.7  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1523  acetate kinase  26.91 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1180  acetate kinase  24.85 
 
 
414 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2674  acetate kinase  26.65 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.440008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>