More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0957 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0957  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  100 
 
 
430 aa  866    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00162656  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0935  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  96.5 
 
 
430 aa  843    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000136513  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1155  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  54.42 
 
 
427 aa  478  1e-133  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1288  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  53.6 
 
 
431 aa  462  1e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0078  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  49.3 
 
 
435 aa  421  1e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1630  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  43.25 
 
 
436 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0566409  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0942  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  43.47 
 
 
453 aa  363  3e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000162674  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2455  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.91 
 
 
440 aa  362  9e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000298883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0678  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.65 
 
 
446 aa  354  1e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000258003  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3124  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.55 
 
 
442 aa  346  5e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000009336  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1929  putative tRNA modifying protein  41.19 
 
 
445 aa  346  5e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1647  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.19 
 
 
445 aa  345  8.999999999999999e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1262  2-methylthioadenine synthetase  42.66 
 
 
439 aa  344  2e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.467346  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0983  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.69 
 
 
440 aa  342  8e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000730864  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1467  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.95 
 
 
444 aa  342  1e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.369998  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3205  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.99 
 
 
447 aa  340  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.112948  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1464  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.86 
 
 
440 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11970  MiaB-like tRNA modifying enzyme  42.79 
 
 
442 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000060077  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3199  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.38 
 
 
449 aa  336  5e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1025  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.2 
 
 
433 aa  334  2e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.813856  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0093  hypothetical protein  41.74 
 
 
483 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0865  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  42.4 
 
 
440 aa  332  7.000000000000001e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0318613  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0094  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  42.56 
 
 
470 aa  332  9e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3605  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.15 
 
 
436 aa  331  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.757621 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0100  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.06 
 
 
469 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0256489  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0111  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.06 
 
 
469 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1926  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.82 
 
 
444 aa  329  6e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.587814  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3094  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.41 
 
 
450 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000316014  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3231  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.64 
 
 
440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.12995  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0716  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.86 
 
 
448 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000599844  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3205  hypothetical protein  39.64 
 
 
445 aa  327  3e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000023464  hitchhiker  3.0015199999999995e-20 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2498  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.58 
 
 
486 aa  327  4.0000000000000003e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620801  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1074  hypothetical protein  39.68 
 
 
432 aa  326  5e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01171  Fe-S oxidoreductase  40.32 
 
 
454 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.72418  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3110  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.58 
 
 
446 aa  323  3e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000143108  normal  0.954122 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0106  hypothetical protein  40.32 
 
 
471 aa  323  3e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1671  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.22 
 
 
487 aa  323  4e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.813765  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13538  putative Fe-S oxidoreductase  38.8 
 
 
435 aa  323  4e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.505425  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01141  Fe-S oxidoreductase  40.14 
 
 
454 aa  322  8e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01181  Fe-S oxidoreductase  39.91 
 
 
454 aa  321  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.681569  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0653  2-methylthioadenine synthetase  39.86 
 
 
437 aa  321  9.999999999999999e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.835098  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1623  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  38.31 
 
 
452 aa  320  3e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0632  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.64 
 
 
448 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.3058599999999997e-35 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5359  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.08 
 
 
437 aa  317  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0353  hypothetical protein  38.6 
 
 
466 aa  316  4e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0618  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.41 
 
 
448 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000754849  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3525  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  38.44 
 
 
444 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0377  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  38.64 
 
 
450 aa  312  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4942  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  38.76 
 
 
437 aa  311  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0588845  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0641  hypothetical protein  38.04 
 
 
440 aa  310  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.170936 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2337  hypothetical protein  38.91 
 
 
458 aa  311  2e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.587976  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2144  hypothetical protein  37.71 
 
 
504 aa  310  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02161  Fe-S oxidoreductase  38.29 
 
 
472 aa  309  5e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4495  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  36.46 
 
 
469 aa  306  4.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000507978  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0675  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.63 
 
 
430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00122823  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1942  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.88 
 
 
436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146576  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0034  2-methylthioadenine synthetase  38.72 
 
 
455 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2512  hypothetical protein  37.5 
 
 
452 aa  303  3.0000000000000004e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1606  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  35.96 
 
 
456 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.132217 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0531  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  36.46 
 
 
472 aa  301  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680198  normal  0.538373 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1284  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  35.48 
 
 
482 aa  301  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.323089 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3092  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  37.39 
 
 
435 aa  301  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.949904  normal  0.038543 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3733  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  38.02 
 
 
441 aa  301  2e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0655484 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0443  MiaB family RNA modification protein  37.81 
 
 
440 aa  301  2e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3568  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  37.14 
 
 
471 aa  300  3e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0963  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.98 
 
 
442 aa  300  5e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1585  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.42 
 
 
444 aa  300  5e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678841  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2197  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  37.41 
 
 
470 aa  298  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0839  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  37.9 
 
 
450 aa  295  1e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1513  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.56 
 
 
433 aa  295  1e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.627818  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0735  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  38.08 
 
 
463 aa  294  2e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01161  Fe-S oxidoreductase  36.82 
 
 
462 aa  292  7e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.924562 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4336  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  36.84 
 
 
449 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4276  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  37.07 
 
 
449 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10700  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG, TIGR01125  39.49 
 
 
446 aa  291  2e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00016615  unclonable  0.00000000172933 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0146  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  37.96 
 
 
438 aa  291  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00677283  normal  0.468317 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0256  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  37.18 
 
 
430 aa  290  5.0000000000000004e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2283  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  38.43 
 
 
442 aa  289  7e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.135903  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0470  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  36.14 
 
 
438 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2402  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  36.57 
 
 
467 aa  287  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1499  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  37.73 
 
 
443 aa  287  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1405  hypothetical protein  38.19 
 
 
440 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0234  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.14 
 
 
430 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00117133  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1944  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  36.45 
 
 
437 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41308  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2865  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  36.59 
 
 
453 aa  283  4.0000000000000003e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1444  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  37.36 
 
 
443 aa  283  6.000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1673  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  36.45 
 
 
442 aa  282  7.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.548183  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07500  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG, TIGR01125  36.19 
 
 
477 aa  282  8.000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0247514  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1834  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  35.83 
 
 
473 aa  282  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.044841  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0150  hypothetical protein  37.61 
 
 
434 aa  281  2e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2303  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  36.71 
 
 
467 aa  281  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.941264  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0506  hypothetical protein  39.72 
 
 
430 aa  280  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.912527  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0485  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  35.68 
 
 
493 aa  280  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1979  hypothetical protein  38.36 
 
 
448 aa  279  6e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4072  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  35.45 
 
 
481 aa  278  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0258  conserved hypothetical protein, radical SAM domain family (UPF0004 domain protein)  37.91 
 
 
438 aa  278  1e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0599  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  35.68 
 
 
472 aa  278  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1807  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  36.06 
 
 
453 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.580296 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3451  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  35.23 
 
 
476 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0499  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  35.23 
 
 
476 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.717124  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>