More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0853 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0830  type II secretion system protein  100 
 
 		 399 aa  793    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760113  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0853  type II secretion system protein  100 
 
 		 399 aa  793    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000781273  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1749  type II secretion system protein  47.98 
 
 		 397 aa  393  1e-108  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.28453  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1271  type II secretion system protein  44.89 
 
 		 403 aa  359  5e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  32.51 
 
 		 404 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  30.86 
 
 		 403 aa  208  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  33.09 
 
 		 405 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  31.62 
 
 		 401 aa  206  5e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  30.84 
 
 		 406 aa  206  8e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  30.34 
 
 		 405 aa  202  7e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  32.51 
 
 		 417 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  31.25 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  33.08 
 
 		 402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  31.23 
 
 		 407 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0952  type II secretion system protein  31.74 
 
 		 402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  32.02 
 
 		 417 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  32.02 
 
 		 417 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1882  type II secretion system protein  30.62 
 
 		 403 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000492404  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  31.3 
 
 		 404 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  32.27 
 
 		 417 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  29.6 
 
 		 401 aa  194  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  32.76 
 
 		 419 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  30.58 
 
 		 407 aa  193  4e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  32.33 
 
 		 401 aa  193  5e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  28.93 
 
 		 401 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  31.53 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  29.03 
 
 		 401 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0252  general secretion pathway protein F  29.73 
 
 		 404 aa  190  5e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  30.99 
 
 		 405 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  31.6 
 
 		 410 aa  189  9e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  30.54 
 
 		 406 aa  189  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  30.84 
 
 		 407 aa  188  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  32.43 
 
 		 401 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0992  type II secretion system protein  34.01 
 
 		 433 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  33.78 
 
 		 403 aa  187  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  30.98 
 
 		 403 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  32.66 
 
 		 404 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  32.66 
 
 		 404 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  31.16 
 
 		 403 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 409 aa  186  6e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  29.93 
 
 		 404 aa  186  9e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2101  type II secretion system protein  30.45 
 
 		 404 aa  185  9e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  28.97 
 
 		 405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  28.33 
 
 		 404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  30.1 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  29.8 
 
 		 406 aa  183  5.0000000000000004e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  29.82 
 
 		 408 aa  183  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  31.51 
 
 		 403 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0325  type II secretion system protein  29.56 
 
 		 406 aa  181  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  28.06 
 
 		 419 aa  181  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  30.46 
 
 		 410 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  29.61 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  32.27 
 
 		 401 aa  181  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  30.68 
 
 		 411 aa  180  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0527  type II secretion system protein  31.75 
 
 		 402 aa  178  1e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0779585  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  27.56 
 
 		 409 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  32.01 
 
 		 409 aa  178  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  28.78 
 
 		 407 aa  177  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1301  general secretion pathway protein F  27.41 
 
 		 408 aa  177  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  27.63 
 
 		 406 aa  176  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  29.4 
 
 		 404 aa  176  6e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3255  type II secretion system protein  30.98 
 
 		 403 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  28.43 
 
 		 404 aa  176  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4413  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 406 aa  176  7e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00834233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2412  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 405 aa  176  8e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4356  general secretion pathway protein F  28.5 
 
 		 407 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0153  general secretion pathway protein F  28.81 
 
 		 407 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  31.7 
 
 		 406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  27.14 
 
 		 402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  30.15 
 
 		 417 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  27.03 
 
 		 406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1164  type II secretion system protein  33 
 
 		 403 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  30.12 
 
 		 416 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  30.27 
 
 		 409 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  29.17 
 
 		 405 aa  173  5e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0158  general secretion pathway protein F  28.81 
 
 		 407 aa  173  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0153  general secretion pathway protein F  28.81 
 
 		 407 aa  173  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  29.9 
 
 		 409 aa  173  5e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0005  general secretion pathway protein F  29.06 
 
 		 407 aa  173  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.138499 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3617  general secretion pathway protein F  28.57 
 
 		 406 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0156  type II secretion system protein  28.01 
 
 		 402 aa  172  7.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  26.8 
 
 		 406 aa  172  9e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  28.92 
 
 		 405 aa  172  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  27.07 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1350  general secretion pathway protein F  29.66 
 
 		 403 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  26.54 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3267  general secretion pathway protein F  28.88 
 
 		 400 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000471586  hitchhiker  0.0000000000000079941 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  27.23 
 
 		 407 aa  170  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  26.88 
 
 		 421 aa  171  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  27.87 
 
 		 422 aa  170  3e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1006  type II secretion system protein  28.64 
 
 		 400 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  28.07 
 
 		 424 aa  170  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2922  general secretion pathway protein F  28.92 
 
 		 405 aa  170  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  27.56 
 
 		 408 aa  170  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  27.23 
 
 		 417 aa  169  8e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  27.91 
 
 		 407 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1472  general secretion pathway protein F  28.68 
 
 		 408 aa  169  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.655662  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  26.55 
 
 		 406 aa  169  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  27.91 
 
 		 407 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  27.91 
 
 		 407 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0573694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>