113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0838 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0815  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 320 aa  661    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0883393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0838  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 320 aa  661    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1701  radical SAM domain-containing protein  57.34 
 
 		 295 aa  342  5e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1143  radical SAM domain-containing protein  55.83 
 
 		 287 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1289  radical SAM domain-containing protein  48.74 
 
 		 298 aa  275  7e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3427  radical SAM domain-containing protein  46.6 
 
 		 313 aa  270  2e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1949  radical SAM domain-containing protein  46.43 
 
 		 319 aa  265  8e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0368  radical SAM family protein  45.13 
 
 		 315 aa  253  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000743683  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1372  radical SAM domain-containing protein  46.15 
 
 		 298 aa  253  3e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1947  Radical SAM domain protein  47.1 
 
 		 283 aa  251  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1063  radical SAM domain-containing protein  45.65 
 
 		 303 aa  247  1e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1225  Radical SAM domain protein  45.83 
 
 		 301 aa  248  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1251  radical SAM domain-containing protein  45.65 
 
 		 303 aa  247  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269935  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0110  Radical SAM domain protein  44.09 
 
 		 296 aa  246  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.389889  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1274  radical SAM domain-containing protein  41.36 
 
 		 319 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330948  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4174  radical SAM domain-containing protein  44.36 
 
 		 305 aa  241  7.999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000899263  hitchhiker  0.0000122101 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1772  radical SAM family protein  41.92 
 
 		 300 aa  240  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138508  normal  0.113699 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4313  radical SAM domain-containing protein  44.73 
 
 		 305 aa  240  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1956  Radical SAM domain protein  45.99 
 
 		 301 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2526  radical SAM domain-containing protein  42.71 
 
 		 318 aa  239  5e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.252975  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2082  radical SAM  40.86 
 
 		 308 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1076  Radical SAM domain protein  42.14 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0616  radical SAM domain-containing protein  43.17 
 
 		 296 aa  232  8.000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2121  radical SAM domain-containing protein  40.32 
 
 		 326 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152404  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  41.16 
 
 		 293 aa  229  5e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206983 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1072  radical SAM domain-containing protein  42.01 
 
 		 306 aa  227  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1859  radical SAM domain-containing protein  40.79 
 
 		 300 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.54951  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2309  Radical SAM domain protein  42.55 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1152  Radical SAM domain protein  40.27 
 
 		 321 aa  219  5e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.429756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3220  radical SAM family protein  39.73 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0910246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1899  Radical SAM domain protein  41.13 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.735258  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1745  Radical SAM domain protein  39.3 
 
 		 303 aa  212  7e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0609211 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0526  Radical SAM domain protein  40.86 
 
 		 344 aa  211  1e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0095894  unclonable  0.0000000400012 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0003  radical SAM domain-containing protein  42.8 
 
 		 286 aa  210  2e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0003  radical SAM domain-containing protein  42.8 
 
 		 286 aa  211  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2282  radical SAM domain-containing protein  39.24 
 
 		 313 aa  209  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1179  radical SAM domain-containing protein  36.96 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0438654  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1790  Radical SAM domain protein  39.93 
 
 		 307 aa  208  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1696  radical SAM domain-containing protein  39.11 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1667  radical SAM domain-containing protein  36.86 
 
 		 312 aa  205  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1368  radical SAM domain-containing protein  38.28 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0299345  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1488  Radical SAM domain protein  41.16 
 
 		 323 aa  203  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0661  Radical SAM domain protein  39.02 
 
 		 320 aa  203  4e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1149  radical SAM domain protein  36.96 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000033704  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  35.91 
 
 		 326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0210847  normal  0.81477 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07611  pyruvate formate lyase activating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15630)  42.02 
 
 		 373 aa  192  6e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00159546  normal  0.16163 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0925  radical SAM domain-containing protein  36.5 
 
 		 355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0826  radical SAM domain-containing protein  35.4 
 
 		 373 aa  177  3e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2506  radical SAM domain-containing protein  34.97 
 
 		 331 aa  176  4e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000358558  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1947  radical SAM domain-containing protein  34.67 
 
 		 372 aa  169  7e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0987  radical SAM domain-containing protein  34.19 
 
 		 371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1370  radical SAM domain-containing protein  35.27 
 
 		 373 aa  160  2e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3602  formate acetyltransferase activating enzyme  33.33 
 
 		 345 aa  155  6e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.795374  normal  0.163348 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0881  radical SAM domain-containing protein  33.09 
 
 		 374 aa  142  6e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.607875  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  26.69 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  26.69 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  26.79 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1490  radical SAM domain-containing protein  24.89 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.343112  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  24.5 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0482  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  26.09 
 
 		 243 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0510  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  26.09 
 
 		 243 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0922  radical SAM domain-containing protein  25.71 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0491  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  26.09 
 
 		 243 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0564  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  26.09 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  26.54 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0566  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  26.09 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4810  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  26.09 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0421  formate acetyltransferase activating enzyme (pyruvate formate-lyase activating enzyme)  26.09 
 
 		 243 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4016  radical SAM domain-containing protein  24.05 
 
 		 379 aa  53.5  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.643398  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0513  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  25.54 
 
 		 243 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0463  radical SAM domain-containing protein  21.33 
 
 		 332 aa  52.8  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.838883  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0432  pyruvate formate-lyase activating enzyme  25.14 
 
 		 243 aa  52.8  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  26.62 
 
 		 362 aa  51.6  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  25.52 
 
 		 324 aa  51.2  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0540  radical SAM domain-containing protein  24.81 
 
 		 326 aa  51.2  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1460  radical SAM domain-containing protein  24.56 
 
 		 332 aa  50.8  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0425  formate acetyltransferase activating enzyme (pyruvate formate-lyase activating enzyme)  25.54 
 
 		 243 aa  50.4  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1533  radical SAM domain-containing protein  23.58 
 
 		 355 aa  50.4  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000125557  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  25.84 
 
 		 376 aa  50.1  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1582  radical SAM domain-containing protein  23.58 
 
 		 355 aa  50.4  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0102098  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23160  pyruvate formate-lyase activating enzyme  24.58 
 
 		 247 aa  49.3  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0654  pyruvate formate-lyase activating enzyme  24.17 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00347583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1470  radical SAM domain-containing protein  25.35 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.808287  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0506  pyruvate formate-lyase activating enzyme  21.67 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0339577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0427  pyruvate formate-lyase activating enzyme  24.04 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  33.93 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  25.95 
 
 		 353 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 364 aa  47  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1017  Radical SAM domain protein  23.97 
 
 		 335 aa  47  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.677632  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  25.24 
 
 		 339 aa  46.6  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  26.89 
 
 		 363 aa  46.2  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  23.67 
 
 		 282 aa  46.2  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  22.78 
 
 		 337 aa  45.8  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0217  radical SAM domain-containing protein  21.16 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0403  Radical SAM domain protein  23.31 
 
 		 351 aa  45.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00459412  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1963  Radical SAM domain protein  27.01 
 
 		 334 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0105086  decreased coverage  0.00565461 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0932  radical SAM domain-containing protein  25.14 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1453  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  28.98 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0238832  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1563  radical SAM domain-containing protein  24.91 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.356418 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  21.72 
 
 		 372 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>