More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0794 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0794  prephenate dehydratase  100 
 
 		 552 aa  1108    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0771  prephenate dehydratase  98.55 
 
 		 552 aa  1095    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  36.26 
 
 		 355 aa  201  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  34.35 
 
 		 355 aa  187  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1394  chorismate mutase  31.81 
 
 		 371 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138573  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  32.7 
 
 		 371 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  31.81 
 
 		 371 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.09 
 
 		 355 aa  184  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  31.87 
 
 		 360 aa  184  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  32.14 
 
 		 360 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  32.97 
 
 		 374 aa  182  2e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3121  chorismate mutase  33.88 
 
 		 365 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  30.33 
 
 		 358 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  32.15 
 
 		 371 aa  180  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  34.92 
 
 		 358 aa  179  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  36.58 
 
 		 311 aa  179  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  33.52 
 
 		 360 aa  179  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  33.97 
 
 		 365 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  32.51 
 
 		 366 aa  177  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  32.43 
 
 		 374 aa  178  3e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  33.7 
 
 		 365 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  32.26 
 
 		 374 aa  177  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  34.17 
 
 		 364 aa  177  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  32.48 
 
 		 371 aa  177  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  40.51 
 
 		 278 aa  177  6e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  32.68 
 
 		 381 aa  176  7e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  30.11 
 
 		 385 aa  176  8e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  31.1 
 
 		 382 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  31.77 
 
 		 359 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  31.56 
 
 		 387 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  32.19 
 
 		 371 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  31.46 
 
 		 418 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  41.92 
 
 		 284 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  34.17 
 
 		 362 aa  173  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  31.22 
 
 		 359 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  32.7 
 
 		 365 aa  172  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3282  chorismate mutase  31.15 
 
 		 366 aa  172  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0668525  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  30.66 
 
 		 358 aa  172  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  32.78 
 
 		 361 aa  172  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0046  Prephenate dehydratase  37.96 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.6 
 
 		 362 aa  171  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  29.58 
 
 		 359 aa  171  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.46 
 
 		 358 aa  170  5e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  33.05 
 
 		 364 aa  170  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  32.59 
 
 		 364 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  32.13 
 
 		 373 aa  170  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  38.29 
 
 		 272 aa  170  7e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  32.31 
 
 		 367 aa  170  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  32.31 
 
 		 364 aa  170  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.81 
 
 		 371 aa  169  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  30.22 
 
 		 360 aa  169  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  38.01 
 
 		 277 aa  168  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  33.43 
 
 		 364 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1617  chorismate mutase  30.93 
 
 		 373 aa  167  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.03 
 
 		 364 aa  167  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.84 
 
 		 360 aa  167  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  32.01 
 
 		 356 aa  167  6.9999999999999995e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.84 
 
 		 360 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.84 
 
 		 360 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.84 
 
 		 360 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.84 
 
 		 360 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.84 
 
 		 360 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0336  chorismate mutase  31.48 
 
 		 419 aa  166  8e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.84 
 
 		 360 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.84 
 
 		 360 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  30.28 
 
 		 402 aa  166  9e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  37.13 
 
 		 274 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  31.84 
 
 		 360 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  31.3 
 
 		 367 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  30.06 
 
 		 359 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  33.43 
 
 		 364 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0116  chorismate mutase  31.64 
 
 		 377 aa  164  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2913  chorismate mutase  28.57 
 
 		 648 aa  162  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1193  chorismate mutase  31.02 
 
 		 366 aa  161  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1644  Prephenate dehydratase  31.27 
 
 		 355 aa  161  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.241055  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1341  prephenate dehydratase  32.01 
 
 		 384 aa  162  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409344  normal  0.126516 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  35.09 
 
 		 303 aa  161  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  31.03 
 
 		 382 aa  161  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2475  chorismate mutase  32.08 
 
 		 391 aa  161  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1647  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.24 
 
 		 357 aa  160  4e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1666  P-protein  33.24 
 
 		 359 aa  160  5e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  30.81 
 
 		 360 aa  160  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2241  prephenate dehydratase / chorismate mutase  30.68 
 
 		 370 aa  160  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0365  chorismate mutase / prephenate dehydratase  29.66 
 
 		 385 aa  160  7e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0036667  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  30.73 
 
 		 365 aa  160  8e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0361  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.94 
 
 		 357 aa  159  9e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  30.81 
 
 		 360 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  36.4 
 
 		 372 aa  158  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  32.35 
 
 		 359 aa  158  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0568  chorismate mutase  31.77 
 
 		 362 aa  158  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0338  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.65 
 
 		 357 aa  158  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1360  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.14 
 
 		 357 aa  157  4e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  30.3 
 
 		 706 aa  157  6e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  33.43 
 
 		 366 aa  156  7e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0269  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.53 
 
 		 358 aa  156  7e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  37.02 
 
 		 311 aa  156  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  30.9 
 
 		 360 aa  156  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.87 
 
 		 358 aa  155  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3487  prephenate dehydratase  32.24 
 
 		 379 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1133  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  29.3 
 
 		 386 aa  155  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>