More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0689 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0689  D-alanyl-alanine synthetase A  100 
 
 		 303 aa  604  9.999999999999999e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000234965  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0665  D-alanyl-alanine synthetase A  94.39 
 
 		 303 aa  577  1e-164  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619225  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1588  D-alanyl-alanine synthetase A  49.68 
 
 		 316 aa  310  2.9999999999999997e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000341303  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0420  D-alanine/D-alanine ligase  45.03 
 
 		 299 aa  238  6.999999999999999e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379989  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1643  D-alanine--D-alanine ligase  40.4 
 
 		 298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  41.72 
 
 		 305 aa  232  5e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0452  D-alanine/D-alanine ligase  43 
 
 		 324 aa  222  6e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0742321  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0100  D-alanine--D-alanine ligase  40.13 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0814155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0085  D-alanine--D-alanine ligase  39.81 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.34447  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2329  D-alanine--D-alanine ligase  40.95 
 
 		 318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.304126  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3508  D-alanine/D-alanine ligase  39.81 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00134071  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0098  D-alanine--D-alanine ligase  39.81 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3565  D-alanine--D-alanine ligase  39.81 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00231129  hitchhiker  0.00551648 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0094  D-alanine--D-alanine ligase  39.81 
 
 		 306 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000101829  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00093  D-alanylalanine synthetase  39.48 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.149308  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00092  hypothetical protein  39.48 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.144888  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2088  D-alanine--D-alanine ligase  39.33 
 
 		 304 aa  209  4e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0097  D-alanine--D-alanine ligase  39.16 
 
 		 306 aa  208  8e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00164222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  40 
 
 		 308 aa  208  8e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  39.6 
 
 		 306 aa  207  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0850  D-alanine--D-alanine ligase  40.07 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.868675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0667  D-alanine/D-alanine ligase  40.07 
 
 		 313 aa  206  5e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.621467  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1208  D-alanine/D-alanine ligase  39.6 
 
 		 322 aa  205  6e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3114  D-alanine/D-alanine ligase  39.41 
 
 		 307 aa  205  6e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188134  hitchhiker  0.0000000168198 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0816  D-alanine--D-alanine ligase  38.31 
 
 		 302 aa  205  9e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2450  D-alanine--D-alanine ligase  43.32 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0817571  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1140  D-alanine--D-alanine ligase  38.78 
 
 		 309 aa  203  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000909084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0638  D-alanine--D-alanine ligase  38.44 
 
 		 306 aa  202  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0142  D-alanine--D-alanine ligase  39.16 
 
 		 306 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0090881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0526  D-alanine--D-alanine ligase  38.69 
 
 		 332 aa  202  8e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000337974  hitchhiker  0.0000125004 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  39.16 
 
 		 309 aa  202  8e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0142  D-alanine--D-alanine ligase  39.16 
 
 		 306 aa  201  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  hitchhiker  0.00000371528 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0147  D-alanine--D-alanine ligase  39.16 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000287396  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0947  D-alanine--D-alanine ligase  39.74 
 
 		 302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0325942  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2148  D-alanine--D-alanine ligase  38.1 
 
 		 314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.628633  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0146  D-alanine--D-alanine ligase  38.83 
 
 		 306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.302602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  38.46 
 
 		 312 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  37.79 
 
 		 306 aa  200  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2266  D-alanine--D-alanine ligase  41.06 
 
 		 302 aa  200  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.297566  hitchhiker  0.00504643 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1878  D-alanine--D-alanine ligase  39.54 
 
 		 308 aa  199  5e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.063714 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3914  D-alanine--D-alanine ligase  38.64 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3830  D-alanine--D-alanine ligase  38.64 
 
 		 308 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3887  D-alanine--D-alanine ligase  38.76 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0809283  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3778  D-alanine--D-alanine ligase  38.11 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4671  D-alanine--D-alanine ligase  37.58 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129578  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1136  D-alanine--D-alanine ligase  38.26 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1522  D-alanine--D-alanine ligase  38.69 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0539481  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  37.66 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3496  D-alanine--D-alanine ligase  39.02 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.303259  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1312  D-alanine--D-alanine ligase  38.69 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0281442  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2858  D-alanine--D-alanine ligase  39.27 
 
 		 316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000136858  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  37.66 
 
 		 318 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  37.66 
 
 		 318 aa  195  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0772  D-alanine--D-alanine ligase  39.4 
 
 		 309 aa  196  6e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.170719  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  39.09 
 
 		 313 aa  195  7e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  38.94 
 
 		 310 aa  195  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0763  D-alanine--D-alanine ligase  38.19 
 
 		 306 aa  195  9e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0585  D-alanine--D-alanine ligase  37.88 
 
 		 313 aa  195  9e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.034882  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  41.18 
 
 		 316 aa  195  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4406  D-alanine--D-alanine ligase  38.36 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206514  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0382  D-alanine/D-alanine ligase  37.33 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0398495  normal  0.161369 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0203  D-alanine--D-alanine ligase  37.33 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57320  D-alanine--D-alanine ligase  38.87 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1149  D-alanine--D-alanine ligase  39.22 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.927057  normal  0.917542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3301  D-alanine--D-alanine ligase  38.56 
 
 		 308 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  37.34 
 
 		 318 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2741  D-alanine--D-alanine ligase  36.72 
 
 		 304 aa  193  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199895  hitchhiker  0.00000666317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3943  D-alanine--D-alanine ligase  37.38 
 
 		 312 aa  193  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2627  D-alanine--D-alanine ligase  36.39 
 
 		 304 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105454 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3423  D-alanine--D-alanine ligase  38.16 
 
 		 346 aa  192  6e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.206359  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2030  D-alanine--D-alanine ligase  36.45 
 
 		 379 aa  192  6e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.24983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0183  D-alanine--D-alanine ligase  38.39 
 
 		 337 aa  192  6e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000736036  normal  0.566039 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  39.93 
 
 		 305 aa  192  7e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2435  D-alanine--D-alanine ligase  36.39 
 
 		 304 aa  191  9e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2610  D-alanine--D-alanine ligase  36.39 
 
 		 304 aa  191  9e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.5132  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2628  D-alanine--D-alanine ligase  36.72 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.292335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2582  D-alanine--D-alanine ligase  36.72 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2077  D-alanine--D-alanine ligase  38.69 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  hitchhiker  0.00112188 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2666  D-alanine--D-alanine ligase  36.72 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3385  D-alanine--D-alanine ligase  40.13 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0172099  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2916  D-alanine--D-alanine ligase  40.13 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.253667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3516  D-alanine--D-alanine ligase  40.13 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2390  D-alanine--D-alanine ligase  36.39 
 
 		 304 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.593473  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3126  D-alanine--D-alanine ligase  37.83 
 
 		 327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4982  D-alanine--D-alanine ligase  37.83 
 
 		 319 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2356  D-alanine--D-alanine ligase  36.39 
 
 		 304 aa  189  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2848  D-alanine--D-alanine ligase  38.89 
 
 		 308 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67822  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04365  D-alanine--D-alanine ligase  37.46 
 
 		 318 aa  189  5.999999999999999e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.628824  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2190  D-alanine--D-alanine ligase  40.72 
 
 		 311 aa  189  5.999999999999999e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.10394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2589  D-alanine--D-alanine ligase  38.56 
 
 		 308 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2198  D-alanine/D-alanine ligase  39.35 
 
 		 313 aa  189  7e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0703567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  39.27 
 
 		 305 aa  188  7e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0095  D-alanine--D-alanine ligase  37.13 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.798262  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0464  D-alanine--D-alanine ligase  38.44 
 
 		 319 aa  188  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.132669 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4100  D-alanine--D-alanine ligase  37.58 
 
 		 319 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.555114 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1749  D-alanine--D-alanine ligase  36.72 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3774  D-alanine--D-alanine ligase  37.66 
 
 		 308 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0661  D-alanine/D-alanine ligase  39.4 
 
 		 311 aa  188  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28460  D-alanine--D-alanine ligase  36.98 
 
 		 317 aa  188  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289482  hitchhiker  0.00300353 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4463  D-alanine--D-alanine ligase  39.07 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.816615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>