36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0663 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0663  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  508  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.351278  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0638  hypothetical protein  94.8 
 
 		 250 aa  486  1e-136  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613219  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0642  LamG domain-containing protein  51.82 
 
 		 247 aa  261  6e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110792  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0667  LamG domain-containing protein  51.42 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0666  hypothetical protein  50.21 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0641  hypothetical protein  47.71 
 
 		 258 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000324507  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1737  hypothetical protein  38.8 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000179479  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0640  hypothetical protein  40.53 
 
 		 250 aa  161  7e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000266751  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  41.25 
 
 		 848 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0665  hypothetical protein  40.15 
 
 		 250 aa  159  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1738  hypothetical protein  41.82 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306198  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  37.67 
 
 		 1112 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  35.16 
 
 		 1121 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  35.94 
 
 		 1121 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  35.55 
 
 		 1121 aa  149  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  37.67 
 
 		 1143 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  39.22 
 
 		 804 aa  146  4.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  35.71 
 
 		 1174 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  33.02 
 
 		 703 aa  122  7e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4267  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  25.88 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  28.57 
 
 		 4761 aa  52.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  26.56 
 
 		 846 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  27.78 
 
 		 739 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  27.98 
 
 		 739 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2498  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.96 
 
 		 599 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.855406 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  24.24 
 
 		 1013 aa  46.2  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  22.78 
 
 		 1306 aa  45.8  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  24.32 
 
 		 429 aa  45.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4454  hypothetical protein  24.9 
 
 		 280 aa  45.4  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000148618  normal  0.54702 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1633  hypothetical protein  25.13 
 
 		 298 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429033  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 		 594 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2966  PKD domain containing protein  24.08 
 
 		 531 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.506413 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  24.4 
 
 		 471 aa  42.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1367 aa  43.1  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  24.68 
 
 		 6678 aa  42.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3200  hypothetical protein  28.89 
 
 		 307 aa  42  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  0.134727 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>