112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0662 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  93.21 
 
 		 471 aa  923    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0639  glycoside hydrolase family protein  67.78 
 
 		 475 aa  673    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000370471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0662  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 471 aa  974    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0664  glycoside hydrolase family protein  69.89 
 
 		 476 aa  665    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  56.58 
 
 		 707 aa  521  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  47.05 
 
 		 810 aa  426  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  45.65 
 
 		 789 aa  424  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  44.07 
 
 		 1121 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  44.09 
 
 		 1121 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  44.3 
 
 		 1121 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3292  glycoside hydrolase family 43  44.08 
 
 		 488 aa  394  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.223704  hitchhiker  0.00299224 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  43.76 
 
 		 804 aa  393  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  44.18 
 
 		 1112 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29390  beta-xylosidase  44.08 
 
 		 494 aa  389  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.838648  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  41.4 
 
 		 1143 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  43.97 
 
 		 703 aa  370  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  38.46 
 
 		 848 aa  364  2e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  37.48 
 
 		 1174 aa  334  2e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1543  beta-xylosidase  33.18 
 
 		 531 aa  212  9e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000200892  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  29.76 
 
 		 472 aa  209  6e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1542  beta-xylosidase  32.88 
 
 		 581 aa  172  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0510  glycoside hydrolase family 43  27.47 
 
 		 456 aa  120  4.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0180422  hitchhiker  0.00320544 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  28.87 
 
 		 315 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.19 
 
 		 355 aa  108  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  31.64 
 
 		 331 aa  108  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.46 
 
 		 355 aa  106  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.06 
 
 		 357 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.19 
 
 		 356 aa  104  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.48 
 
 		 327 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.81 
 
 		 352 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.21 
 
 		 346 aa  99.8  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  32.55 
 
 		 343 aa  98.6  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.99 
 
 		 341 aa  95.5  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0989  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  32.95 
 
 		 334 aa  94.4  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  30.12 
 
 		 598 aa  94  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04520  beta-xylosidase  29.07 
 
 		 491 aa  89.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal  0.0670778 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  31.94 
 
 		 472 aa  86.7  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  24.27 
 
 		 341 aa  86.7  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.85 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0516  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.68 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000112186  decreased coverage  0.000226611 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03044  Endo-arabinanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU2]  28.52 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  25.85 
 
 		 503 aa  73.2  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  24.21 
 
 		 537 aa  71.2  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  25.45 
 
 		 357 aa  70.1  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  25.48 
 
 		 345 aa  69.7  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0078  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.31 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144884  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  29.39 
 
 		 501 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6081  glycoside hydrolase family 43  31.73 
 
 		 480 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06352  Endo-alpha-1,5-L-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZC8]  25 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.605603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  24.68 
 
 		 323 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  24.91 
 
 		 505 aa  61.6  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  23.29 
 
 		 553 aa  60.5  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  22.22 
 
 		 509 aa  60.5  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  25.6 
 
 		 324 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  26.17 
 
 		 532 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  28.46 
 
 		 512 aa  58.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  24.81 
 
 		 497 aa  58.5  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  28.52 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  32.68 
 
 		 495 aa  57  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  27.33 
 
 		 306 aa  57  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02534  endoarabinanase (Eurofung)  36.11 
 
 		 380 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  23.63 
 
 		 304 aa  56.6  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  24.1 
 
 		 829 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  25.5 
 
 		 540 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  25.16 
 
 		 524 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  21.14 
 
 		 497 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  26.78 
 
 		 401 aa  54.7  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  25.87 
 
 		 536 aa  54.3  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  24.36 
 
 		 514 aa  53.9  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  27.63 
 
 		 644 aa  53.5  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  23.94 
 
 		 319 aa  53.5  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  23.99 
 
 		 498 aa  53.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0753  glycoside hydrolase family protein  27.89 
 
 		 465 aa  52  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.29 
 
 		 547 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  22.22 
 
 		 522 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  22.61 
 
 		 552 aa  51.2  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08007  Endo-alpha-1,5-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AUM3]  27.96 
 
 		 320 aa  50.8  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.766445 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 699 aa  50.1  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.21 
 
 		 559 aa  48.9  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  24.83 
 
 		 572 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  23.72 
 
 		 524 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  24.57 
 
 		 519 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.74 
 
 		 537 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  25.55 
 
 		 337 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  27 
 
 		 468 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.11 
 
 		 546 aa  48.5  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  25.83 
 
 		 492 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  22.41 
 
 		 330 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  22.93 
 
 		 484 aa  47.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  24.73 
 
 		 384 aa  47.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.1 
 
 		 536 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  24.12 
 
 		 541 aa  47  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  29.41 
 
 		 527 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  22.18 
 
 		 539 aa  46.6  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2698  glycoside hydrolase family 43  29.81 
 
 		 369 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  0.338928 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  22.22 
 
 		 535 aa  46.6  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  33.94 
 
 		 456 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  23.66 
 
 		 550 aa  45.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  22.94 
 
 		 523 aa  45.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  24.9 
 
 		 325 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>