85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0625 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0625  Alpha-L-fucosidase  100 
 
 		 446 aa  914    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0611  Alpha-L-fucosidase  97.09 
 
 		 446 aa  891    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.620777  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2554  Alpha-L-fucosidase  47.63 
 
 		 478 aa  396  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0869924  normal  0.838653 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2814  Alpha-L-fucosidase  47.33 
 
 		 471 aa  397  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00800  alpha-L-fucosidase  45.8 
 
 		 474 aa  287  2.9999999999999996e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  40.87 
 
 		 731 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2605  Alpha-L-fucosidase  41.23 
 
 		 463 aa  273  5.000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00783953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0315  Alpha-L-fucosidase  35.04 
 
 		 464 aa  253  3e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2972  Alpha-L-fucosidase  35.49 
 
 		 490 aa  248  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1483  Alpha-L-fucosidase  39.68 
 
 		 482 aa  245  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000503275  normal  0.454676 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0435  alpha-L-fucosidase  54.21 
 
 		 212 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0390  Alpha-L-fucosidase  32.58 
 
 		 484 aa  229  8e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0617324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39282  predicted protein  35.63 
 
 		 492 aa  226  6e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218149  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01643  alpha-L-fucosidase  30.83 
 
 		 532 aa  225  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48865  predicted protein  34.51 
 
 		 500 aa  223  8e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2312  Alpha-L-fucosidase  33.1 
 
 		 466 aa  220  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.931291  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0902  Alpha-L-fucosidase  31.29 
 
 		 505 aa  212  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29821  predicted protein  32.39 
 
 		 473 aa  210  4e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.979957  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2262  Alpha-L-fucosidase  30.21 
 
 		 606 aa  205  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2169  Alpha-L-fucosidase  29.88 
 
 		 584 aa  204  3e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600207  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3569  Alpha-L-fucosidase  30.22 
 
 		 515 aa  201  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0068011 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0802  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L-fucosidase)  34.01 
 
 		 495 aa  194  3e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0831  Alpha-L-fucosidase  28.81 
 
 		 537 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000199076  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  27.84 
 
 		 663 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0886  Alpha-L-fucosidase  34.56 
 
 		 408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105586  normal  0.109873 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  30.77 
 
 		 798 aa  183  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  33.25 
 
 		 435 aa  178  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0823  Alpha-L-fucosidase  28.34 
 
 		 534 aa  177  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000144391  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4875  Alpha-L-fucosidase  29.36 
 
 		 483 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185578  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2045  Alpha-L-fucosidase  33.71 
 
 		 464 aa  170  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2072  Alpha-L-fucosidase  28.43 
 
 		 486 aa  167  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7054  Alpha-L-fucosidase  28.27 
 
 		 485 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000348467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2841  Alpha-L-fucosidase  32.9 
 
 		 473 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  hitchhiker  0.00495105 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  31.38 
 
 		 435 aa  157  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13010  alpha-L-fucosidase  29.9 
 
 		 445 aa  157  5.0000000000000005e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0825018  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3943  Alpha-L-fucosidase  31.5 
 
 		 429 aa  156  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1903  Alpha-L-fucosidase  31.9 
 
 		 431 aa  156  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3467  Alpha-L-fucosidase  30.55 
 
 		 415 aa  156  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.565754 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6806  Alpha-L-fucosidase  29.74 
 
 		 452 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  hitchhiker  0.00000369598 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5348  Alpha-L-fucosidase  29.95 
 
 		 440 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.559613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2693  Alpha-L-fucosidase  27.17 
 
 		 479 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101343  hitchhiker  0.00474294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2703  Alpha-L-fucosidase  30.3 
 
 		 596 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1916  Alpha-L-fucosidase  28.47 
 
 		 446 aa  150  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3615  Alpha-L-fucosidase  31.08 
 
 		 429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.669923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2695  Alpha-L-fucosidase  30.63 
 
 		 627 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000601937  normal  0.037659 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4241  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L- fucosidase)  26.14 
 
 		 555 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.525329  normal  0.717793 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0010  Alpha-L-fucosidase  30.29 
 
 		 538 aa  142  8e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.886548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1541  Alpha-L-fucosidase  27.9 
 
 		 516 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.664624 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2796  Alpha-L-fucosidase  29.91 
 
 		 581 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0019  Alpha-L-fucosidase  29.78 
 
 		 441 aa  140  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2842  Alpha-L-fucosidase  27.41 
 
 		 479 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471674 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0480  alpha-L-fucosidase family protein  31.46 
 
 		 478 aa  137  4e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00391877  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1884  alpha-L-fucosidase precursor, putative  31.2 
 
 		 674 aa  137  4e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0146  Alpha-L-fucosidase  30.85 
 
 		 711 aa  135  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2595  Alpha-L-fucosidase  30.4 
 
 		 473 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3264  Alpha-L-fucosidase  28.38 
 
 		 471 aa  126  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.868809 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1127  Alpha-L-fucosidase  26.38 
 
 		 479 aa  123  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.95278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  27.2 
 
 		 644 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2040  Alpha-L-fucosidase  27.25 
 
 		 494 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.983344  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0130  Alpha-L-fucosidase  28.74 
 
 		 450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159466  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05120  alpha-L-fucosidase  26.7 
 
 		 474 aa  113  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3540  Alpha-L-fucosidase  28.08 
 
 		 340 aa  113  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2596  Alpha-L-fucosidase  27.68 
 
 		 447 aa  107  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000031745  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1302  glycoside hydrolase family alpha-L-fucosidase  31.25 
 
 		 540 aa  103  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.186001 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0308  Alpha-L-fucosidase  38 
 
 		 463 aa  80.5  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1415  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.07 
 
 		 698 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  38.52 
 
 		 690 aa  77  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3028  Alpha-L-fucosidase  28.3 
 
 		 470 aa  77  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  46.84 
 
 		 688 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6474  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.4 
 
 		 467 aa  70.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1447  Alpha-L-fucosidase  28.06 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  41.58 
 
 		 704 aa  70.5  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12980  alpha-L-fucosidase  45.68 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.59 
 
 		 687 aa  68.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01697  F5/8 type C domain protein  28.23 
 
 		 581 aa  68.2  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2596  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.16 
 
 		 487 aa  67  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2423  twin-arginine translocation pathway signal  25.95 
 
 		 638 aa  66.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.96 
 
 		 709 aa  66.2  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1750  alpha-1,3/4-fucosidase, putative  44.3 
 
 		 606 aa  65.5  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0086  alpha-L-fucosidase  29.24 
 
 		 460 aa  65.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0072  Alpha-L-fucosidase  30.22 
 
 		 460 aa  64.3  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  25.8 
 
 		 932 aa  64.3  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  26.41 
 
 		 750 aa  63.2  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.18 
 
 		 704 aa  60.5  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5083  hypothetical protein  28.57 
 
 		 715 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.365257  normal  0.435002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>