203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0623 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  50.46 
 
 
772 aa  824    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  46.7 
 
 
780 aa  717    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  54.08 
 
 
775 aa  849    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  50.39 
 
 
772 aa  822    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  50.52 
 
 
772 aa  822    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  51.28 
 
 
772 aa  816    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  53.92 
 
 
766 aa  848    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  100 
 
 
764 aa  1574    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  48.18 
 
 
760 aa  756    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  51.28 
 
 
772 aa  815    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  58.9 
 
 
779 aa  848    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  51.52 
 
 
760 aa  817    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  53.01 
 
 
777 aa  859    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  50.39 
 
 
772 aa  822    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  50.52 
 
 
772 aa  822    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  55.07 
 
 
681 aa  761    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  49.16 
 
 
712 aa  689    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  55.11 
 
 
771 aa  847    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  66.28 
 
 
772 aa  1106    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  51.15 
 
 
772 aa  811    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  50.59 
 
 
772 aa  827    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  50.06 
 
 
823 aa  750    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  49.94 
 
 
772 aa  818    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4107  alpha-xylosidase YicI  49.93 
 
 
763 aa  808    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  63.3 
 
 
775 aa  1020    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  57.07 
 
 
770 aa  897    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  50.07 
 
 
772 aa  815    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  98.69 
 
 
764 aa  1558    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  56.4 
 
 
749 aa  874    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  50.96 
 
 
763 aa  741    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  50.39 
 
 
772 aa  822    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  50.52 
 
 
772 aa  823    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  51.95 
 
 
804 aa  800    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  57.87 
 
 
774 aa  904    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  51.15 
 
 
772 aa  816    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  52.19 
 
 
780 aa  843    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  50.78 
 
 
775 aa  822    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0073  alpha-glucosidase  41.72 
 
 
608 aa  530  1e-149  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  38.15 
 
 
760 aa  484  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  39.94 
 
 
765 aa  462  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  37.25 
 
 
765 aa  457  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  39.52 
 
 
757 aa  413  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  36.55 
 
 
799 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  37.09 
 
 
794 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  36.41 
 
 
795 aa  376  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  38 
 
 
778 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  33.23 
 
 
752 aa  337  5.999999999999999e-91  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  31.63 
 
 
770 aa  326  1e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  32.37 
 
 
695 aa  324  3e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1660  glycoside hydrolase family protein  29.02 
 
 
784 aa  298  2e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.624656  hitchhiker  0.00115127 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0156  isoglycosyl hydrolase family protein  32.79 
 
 
755 aa  293  6e-78  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.138592  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  32 
 
 
768 aa  282  1e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  30.37 
 
 
801 aa  281  3e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  27.6 
 
 
828 aa  280  8e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  30.35 
 
 
836 aa  280  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  30.3 
 
 
803 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  29.35 
 
 
779 aa  269  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  30.88 
 
 
792 aa  269  2e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  27.97 
 
 
779 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  29.97 
 
 
746 aa  266  8.999999999999999e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  28.77 
 
 
799 aa  266  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  27.73 
 
 
821 aa  265  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  28.75 
 
 
797 aa  263  6.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  28.57 
 
 
777 aa  253  9.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  28.15 
 
 
794 aa  250  8e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  28.55 
 
 
776 aa  248  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  28.77 
 
 
752 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  29.7 
 
 
779 aa  245  3e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  28.93 
 
 
743 aa  241  2.9999999999999997e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  26.9 
 
 
839 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  28.5 
 
 
785 aa  232  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  30.67 
 
 
813 aa  226  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  27.69 
 
 
845 aa  226  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  30.73 
 
 
840 aa  223  9e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  26.89 
 
 
1024 aa  221  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  27.47 
 
 
798 aa  221  3e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  24.85 
 
 
825 aa  221  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  28.48 
 
 
806 aa  221  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  25.93 
 
 
836 aa  219  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  28.62 
 
 
816 aa  219  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03712  hypothetical protein  27.85 
 
 
654 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  28.32 
 
 
700 aa  216  9.999999999999999e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  30.2 
 
 
679 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03763  alpha-glucosidase  27.85 
 
 
667 aa  216  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4108  glycoside hydrolase family 31  27.85 
 
 
678 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4401  alpha-glucosidase  27.85 
 
 
678 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  28.62 
 
 
783 aa  214  4.9999999999999996e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4263  alpha-glucosidase  27.85 
 
 
678 aa  213  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5324  alpha-glucosidase  27.85 
 
 
678 aa  213  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.539055 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1628  Alpha-glucosidase  29.03 
 
 
656 aa  211  3e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.301391 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  26.33 
 
 
828 aa  211  6e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0046  glycoside hydrolase, family 31  30.43 
 
 
679 aa  210  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118014  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0045  glycoside hydrolase, family 31  30.43 
 
 
679 aa  210  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  29.65 
 
 
821 aa  209  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  30.07 
 
 
679 aa  208  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  29.79 
 
 
806 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.175314 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  30.07 
 
 
679 aa  208  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1570  Alpha-glucosidase  27.09 
 
 
715 aa  207  4e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0044  glycoside hydrolase, family 31  30.07 
 
 
679 aa  207  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.228548  decreased coverage  0.00512205 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4250  alpha-glucosidase  28.01 
 
 
678 aa  207  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>