More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0582 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  99.7 
 
 
335 aa  660    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0582  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
335 aa  662    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0815  RND family efflux transporter MFP subunit  41.8 
 
 
359 aa  233  3e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.60919  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.78 
 
 
663 aa  92.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3271  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.86 
 
 
380 aa  87.4  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.525557  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1675  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.45 
 
 
608 aa  86.7  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  26.09 
 
 
351 aa  82.4  0.000000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  26.09 
 
 
351 aa  82.4  0.000000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2611  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.58 
 
 
549 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2557  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.92 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000027885  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  23.81 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.96 
 
 
432 aa  79.7  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  27.13 
 
 
607 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  25.54 
 
 
417 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002593  membrane-fusion protein  25.86 
 
 
372 aa  77  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00429247  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2284  RND family efflux transporter MFP subunit  27.4 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.489118  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0198  RND family efflux transporter MFP subunit  25.54 
 
 
521 aa  76.6  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  28.65 
 
 
380 aa  76.3  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  30.86 
 
 
364 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.84 
 
 
383 aa  75.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3430  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.12 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.516107  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8877  Membrane-fusion protein-like protein  31.72 
 
 
598 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0841399  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  30.96 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03415  hypothetical protein  25 
 
 
371 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  25.86 
 
 
376 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0769  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.24 
 
 
322 aa  73.9  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.100875  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2977  RND family efflux transporter MFP subunit  25.13 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540318  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.04 
 
 
448 aa  73.9  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  25.17 
 
 
380 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0883  RND family efflux transporter MFP subunit  22.51 
 
 
363 aa  73.6  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8876  Membrane-fusion protein-like protein  26.55 
 
 
393 aa  73.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.53 
 
 
404 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.89 
 
 
377 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0157  hypothetical protein  23.19 
 
 
366 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2586  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.85 
 
 
388 aa  72  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4702  RND family efflux transporter MFP subunit  27.14 
 
 
431 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1945  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.3 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.3 
 
 
375 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.37122  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.05 
 
 
448 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1216  RND family efflux transporter MFP subunit  22.94 
 
 
379 aa  70.9  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.152303  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.81 
 
 
416 aa  70.5  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.22 
 
 
445 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1542  secretion protein HlyD family protein  26.88 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0336  secretion protein HlyD  28 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0816826  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1144  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.08 
 
 
368 aa  69.7  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000422764  normal  0.160912 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  25.59 
 
 
381 aa  69.7  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0621  RND family efflux transporter MFP subunit  29.01 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000387759  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4149  hypothetical protein  26.79 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.247441  hitchhiker  0.00000117092 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3939  RND family efflux transporter MFP subunit  30.11 
 
 
367 aa  69.3  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.407918  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1991  secretion protein HlyD  26.77 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0781323  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1154  RND family efflux transporter MFP subunit  23.28 
 
 
375 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  27.23 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2118  RND family efflux transporter MFP subunit  26.26 
 
 
418 aa  68.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6178  RND family efflux transporter MFP subunit  24.5 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.05 
 
 
416 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0322  RND family efflux transporter MFP subunit  24.91 
 
 
353 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0619651 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1057  RND family efflux transporter MFP subunit  25.87 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.91 
 
 
380 aa  68.2  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0916  efflux transporter  22.92 
 
 
396 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987196  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  28.96 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5690  HlyD family secretion protein  26.12 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0642134  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0345  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 
360 aa  67.8  0.0000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0426386  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  22.62 
 
 
343 aa  67.8  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66716  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  26.99 
 
 
390 aa  67.4  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2570  hypothetical protein  27.95 
 
 
370 aa  67.8  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295981  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  26.32 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1985  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.1 
 
 
429 aa  67.8  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0801  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.39 
 
 
403 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  26.09 
 
 
390 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1762  RND family efflux transporter MFP subunit  29.52 
 
 
421 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0464275  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0680  RND family efflux transporter MFP subunit  23.94 
 
 
417 aa  67  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0364598 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.34 
 
 
350 aa  67  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000250075  normal  0.807389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3718  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.22 
 
 
353 aa  67  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.0568343 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1602  RND family efflux transporter MFP subunit  30.89 
 
 
641 aa  67  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1450  RND family efflux transporter MFP subunit  27.32 
 
 
622 aa  66.2  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.125039  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0758  macrolide-specific efflux protein MacA  28.15 
 
 
394 aa  66.2  0.0000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0225012  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1576  hypothetical protein  26.01 
 
 
538 aa  66.2  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000469738  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.16 
 
 
380 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.74 
 
 
353 aa  65.9  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.104068  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2160  secretion protein HlyD  25.95 
 
 
391 aa  65.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.879337  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01077  HlyD family secretion protein  24.46 
 
 
376 aa  65.1  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3832  RND family efflux transporter MFP subunit  23.46 
 
 
374 aa  65.1  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2347  RND family efflux transporter MFP subunit  23.46 
 
 
374 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.161325  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  21.14 
 
 
285 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4857  cation efflux system protein CusB  29.67 
 
 
529 aa  64.3  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0237  RND family efflux transporter MFP subunit  23.66 
 
 
397 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0618  RND family efflux transporter MFP subunit  23.79 
 
 
387 aa  64.7  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0321  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.83 
 
 
386 aa  65.1  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  21.14 
 
 
285 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  21.14 
 
 
285 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1001  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.18 
 
 
347 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.612781  normal  0.0455845 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1936  transporter, putative  30.99 
 
 
349 aa  63.9  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0709  macrolide-specific efflux protein macA  26.65 
 
 
390 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0107  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 
415 aa  63.9  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0950  secretion protein HlyD  25.62 
 
 
384 aa  64.3  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.57805  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  23.58 
 
 
285 aa  63.9  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  27.14 
 
 
431 aa  63.9  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1539  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  21.95 
 
 
286 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.338335  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  27.89 
 
 
384 aa  63.9  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1836  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  21.14 
 
 
285 aa  63.9  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>