More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0568 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0568  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 441 aa  909    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.489897  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0554  alpha amylase, catalytic region  93.42 
 
 		 441 aa  864    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0002426  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  43.33 
 
 		 455 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1727  alpha amylase catalytic region  40.26 
 
 		 454 aa  380  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000518329  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  36.45 
 
 		 499 aa  270  5e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  37.28 
 
 		 654 aa  270  5e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  35.65 
 
 		 515 aa  268  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  35.27 
 
 		 493 aa  258  2e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  34.05 
 
 		 509 aa  236  7e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  34.5 
 
 		 522 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  32.53 
 
 		 588 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  29.87 
 
 		 541 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  30.02 
 
 		 545 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  29.87 
 
 		 541 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  32.05 
 
 		 555 aa  205  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  32.2 
 
 		 555 aa  204  3e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  30.19 
 
 		 815 aa  203  4e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  30.19 
 
 		 595 aa  199  7e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  33.91 
 
 		 593 aa  193  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  30.8 
 
 		 1121 aa  187  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  32 
 
 		 583 aa  186  9e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  32.44 
 
 		 551 aa  184  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4038  alpha amylase catalytic region  30.64 
 
 		 544 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0583407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  30.32 
 
 		 1114 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1908  alpha amylase catalytic region  31.85 
 
 		 553 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.834785  normal  0.122197 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  29.71 
 
 		 1139 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  33.41 
 
 		 558 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1176  alpha amylase catalytic region  32.21 
 
 		 647 aa  177  4e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  31.1 
 
 		 1121 aa  177  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  27.78 
 
 		 575 aa  176  6e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0052  alpha amylase catalytic region  28.6 
 
 		 577 aa  176  7e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  29.29 
 
 		 1137 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  29.29 
 
 		 1137 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  29.29 
 
 		 1137 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  30.33 
 
 		 1101 aa  176  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  29.29 
 
 		 1138 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  29.51 
 
 		 548 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  29.67 
 
 		 540 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  29.51 
 
 		 1154 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  28.05 
 
 		 545 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  29.3 
 
 		 1154 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8020  trehalose synthase  31.21 
 
 		 553 aa  173  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  29.41 
 
 		 1102 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  28.8 
 
 		 1112 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  30.58 
 
 		 1085 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  29.47 
 
 		 549 aa  172  7.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  44.27 
 
 		 258 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  29.7 
 
 		 1116 aa  172  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  29.7 
 
 		 1116 aa  172  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  28.25 
 
 		 1102 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  29.03 
 
 		 1113 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2115  alpha amylase catalytic region  30.89 
 
 		 553 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  0.0296214 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  28.25 
 
 		 1102 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  28.28 
 
 		 1136 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  29.18 
 
 		 1109 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8808  alpha amylase, catalytic region  27.73 
 
 		 552 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  28.71 
 
 		 1137 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  28.83 
 
 		 1137 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  29.01 
 
 		 1111 aa  170  6e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  27.79 
 
 		 1152 aa  169  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  28.74 
 
 		 538 aa  169  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0191  glycosy hydrolase family protein  26.87 
 
 		 534 aa  169  9e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  30.04 
 
 		 572 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  30.04 
 
 		 553 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  28.37 
 
 		 551 aa  169  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  28.83 
 
 		 1104 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  29.34 
 
 		 1112 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  28.78 
 
 		 1115 aa  167  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  28.63 
 
 		 1142 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  29.18 
 
 		 1093 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  27.48 
 
 		 1092 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3686  alpha amylase, catalytic region  27.94 
 
 		 540 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12163  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  29.98 
 
 		 572 aa  166  9e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  28.05 
 
 		 1121 aa  166  9e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1172  alpha amylase domain-containing protein  27.83 
 
 		 1095 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  27.17 
 
 		 554 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1849  alpha-amylase  26.65 
 
 		 524 aa  166  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  29.87 
 
 		 1093 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  26.42 
 
 		 562 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  30.09 
 
 		 554 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  29.03 
 
 		 1110 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0107  alpha-amylase family protein  28.46 
 
 		 541 aa  164  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0384017  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  29.08 
 
 		 1131 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  28.42 
 
 		 531 aa  165  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  26.8 
 
 		 554 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3114  alpha amylase catalytic region  27.24 
 
 		 579 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  29.08 
 
 		 1131 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  29.08 
 
 		 1131 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  29.08 
 
 		 1131 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  29.08 
 
 		 1131 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  29.08 
 
 		 1131 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  27.77 
 
 		 1100 aa  164  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0035  trehalose synthase  28.72 
 
 		 1109 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  27.81 
 
 		 556 aa  164  4.0000000000000004e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5237  alpha amylase catalytic region  28.17 
 
 		 554 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0387802 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  26.75 
 
 		 1088 aa  162  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  28.6 
 
 		 522 aa  163  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4604  alpha amylase catalytic region  29.63 
 
 		 554 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0894643  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  26.16 
 
 		 554 aa  162  9e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  28.45 
 
 		 1113 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>