More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0558 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2496  molecular chaperone DnaK  58.55 
 
 
615 aa  674    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612679  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18401  molecular chaperone DnaK  53.74 
 
 
634 aa  640    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.188042  normal  0.971493 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3460  chaperone protein DnaK  56.26 
 
 
612 aa  640    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_002936  DET1399  molecular chaperone DnaK  54.37 
 
 
637 aa  636    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0033  molecular chaperone DnaK  55.41 
 
 
636 aa  660    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3574  chaperone protein DnaK  54.8 
 
 
639 aa  638    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.662017  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0628  molecular chaperone DnaK  57.24 
 
 
646 aa  658    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0264746  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1148  molecular chaperone DnaK  57.27 
 
 
609 aa  645    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4233  chaperone protein DnaK  54.37 
 
 
623 aa  641    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.716333  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0928  molecular chaperone DnaK  53.42 
 
 
640 aa  637    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.689493  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1649  molecular chaperone DnaK  69.04 
 
 
600 aa  857    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000228474  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0449  molecular chaperone DnaK  55.9 
 
 
622 aa  665    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2079  molecular chaperone DnaK  64.58 
 
 
612 aa  761    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2829  molecular chaperone DnaK  53.78 
 
 
639 aa  645    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000221772  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0004  molecular chaperone DnaK  53.34 
 
 
631 aa  636    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0827361  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0313  chaperone protein DnaK  55.98 
 
 
626 aa  656    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000265757  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0112  molecular chaperone DnaK  56.67 
 
 
611 aa  669    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000334679 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0790  molecular chaperone DnaK  53.67 
 
 
636 aa  642    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0357423  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3389  molecular chaperone DnaK  54.61 
 
 
641 aa  644    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0196  molecular chaperone DnaK  57.43 
 
 
613 aa  678    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1313  molecular chaperone DnaK  53.15 
 
 
630 aa  635    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.634921  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0554  molecular chaperone DnaK  55.46 
 
 
634 aa  655    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3433  molecular chaperone DnaK  58.2 
 
 
620 aa  667    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0457031  normal  0.0513788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0191  molecular chaperone DnaK  55.13 
 
 
631 aa  650    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.837679  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0197  molecular chaperone DnaK  55.3 
 
 
630 aa  650    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432012  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0141  molecular chaperone DnaK  54.94 
 
 
629 aa  674    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0295  molecular chaperone DnaK  54.58 
 
 
633 aa  654    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10355  molecular chaperone DnaK  55.12 
 
 
625 aa  656    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1128  molecular chaperone DnaK  81.99 
 
 
596 aa  1024    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2057  chaperone protein DnaK  61.48 
 
 
607 aa  699    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1207  chaperone protein DnaK  59.93 
 
 
620 aa  688    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.558053  normal  0.0128499 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0107  molecular chaperone DnaK  54.28 
 
 
634 aa  642    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0126383  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0621  molecular chaperone DnaK  54.95 
 
 
637 aa  645    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2303  molecular chaperone DnaK  53.49 
 
 
639 aa  640    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1893  molecular chaperone DnaK  55.37 
 
 
637 aa  657    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.457552  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2674  molecular chaperone DnaK  53.49 
 
 
637 aa  643    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3532  molecular chaperone DnaK  55.32 
 
 
638 aa  651    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00119444  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0128  chaperone protein DnaK  53.76 
 
 
632 aa  635    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.860677  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2311  chaperone protein DnaK  55.67 
 
 
620 aa  653    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000072076  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0211  molecular chaperone DnaK  55.5 
 
 
635 aa  652    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000228003  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1797  molecular chaperone DnaK  52.82 
 
 
645 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0693908  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2468  molecular chaperone DnaK  56.14 
 
 
634 aa  671    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.501675  hitchhiker  0.000000000338371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3246  chaperone protein DnaK  57.95 
 
 
624 aa  686    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102286  hitchhiker  0.000258743 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3555  molecular chaperone DnaK  54.75 
 
 
639 aa  649    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0866908  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0585  molecular chaperone DnaK  59.52 
 
 
612 aa  694    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1209  molecular chaperone DnaK  82.94 
 
 
596 aa  989    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000215559  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1208  molecular chaperone DnaK  54.7 
 
 
636 aa  639    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0761  molecular chaperone DnaK  55.12 
 
 
639 aa  649    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4352  molecular chaperone DnaK  58.13 
 
 
616 aa  660    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0429  molecular chaperone DnaK  54.56 
 
 
633 aa  643    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0128  chaperone DnaK  60.59 
 
 
610 aa  676    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.438221  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3734  chaperone protein DnaK  57.33 
 
 
622 aa  685    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000103994 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0471  molecular chaperone DnaK  54.59 
 
 
635 aa  653    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0555822  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0350  molecular chaperone DnaK  53.77 
 
 
631 aa  645    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.759772 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0329  molecular chaperone DnaK  54.8 
 
 
632 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813132  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1312  molecular chaperone DnaK  58.25 
 
 
620 aa  676    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.975938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0391  molecular chaperone DnaK  54.3 
 
 
633 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0155  molecular chaperone DnaK  55.63 
 
 
632 aa  652    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0982  molecular chaperone DnaK  54.98 
 
 
644 aa  640    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000339197  unclonable  0.0000180058 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0233  molecular chaperone DnaK  58.48 
 
 
612 aa  693    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0417702  normal  0.306693 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0544  molecular chaperone DnaK  100 
 
 
596 aa  1200    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6270  chaperone protein DnaK  53.73 
 
 
639 aa  635    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0462  molecular chaperone DnaK  55.9 
 
 
622 aa  665    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0589911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0784  chaperone DnaK  57.5 
 
 
636 aa  673    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0679  molecular chaperone DnaK  55.35 
 
 
636 aa  645    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470568  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1672  molecular chaperone DnaK  57.51 
 
 
610 aa  644    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0554333  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2290  molecular chaperone DnaK  58.48 
 
 
619 aa  672    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2005  molecular chaperone DnaK  58.29 
 
 
619 aa  677    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1306  molecular chaperone DnaK  53.5 
 
 
638 aa  639    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.35463  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18951  molecular chaperone DnaK  52.99 
 
 
635 aa  638    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1061  chaperone protein DnaK  59.38 
 
 
609 aa  684    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00544599  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0490  chaperone protein DnaK  55.29 
 
 
623 aa  639    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000032469  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1578  chaperone DnaK  59.04 
 
 
610 aa  676    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0113  molecular chaperone DnaK  56.18 
 
 
613 aa  669    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1027  molecular chaperone DnaK  57.85 
 
 
607 aa  650    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0288585  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1183  chaperone protein DnaK  56.63 
 
 
621 aa  650    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207738 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0822  molecular chaperone DnaK  56.3 
 
 
623 aa  636    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.762106 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1638  molecular chaperone DnaK  57.51 
 
 
610 aa  644    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0100  chaperone protein DnaK  53.41 
 
 
619 aa  647    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.843776  normal  0.187258 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3808  molecular chaperone DnaK  55.8 
 
 
622 aa  651    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0731  molecular chaperone DnaK  57.61 
 
 
615 aa  679    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46166  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1036  chaperone protein DnaK  56.53 
 
 
641 aa  664    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000619516  hitchhiker  0.000149965 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4392  chaperone protein DnaK  54.26 
 
 
615 aa  645    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.253837  normal  0.258584 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2115  molecular chaperone DnaK  61.32 
 
 
618 aa  691    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0501961 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0558  molecular chaperone DnaK  100 
 
 
596 aa  1200    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000712029  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1404  molecular chaperone DnaK  54.14 
 
 
636 aa  640    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00594741  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0864  molecular chaperone DnaK  54.52 
 
 
640 aa  639    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.873902  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3142  chaperone protein DnaK  53.96 
 
 
639 aa  636    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.105889  normal  0.238129 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4363  chaperone protein DnaK  57.17 
 
 
621 aa  664    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.62994  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0473  molecular chaperone DnaK  55.9 
 
 
622 aa  665    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.518143  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0634  molecular chaperone DnaK  55.9 
 
 
622 aa  671    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0268741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2960  chaperone protein DnaK  53.96 
 
 
639 aa  636    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1747 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0889  molecular chaperone DnaK  55.03 
 
 
617 aa  647    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000150558  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19141  molecular chaperone DnaK  52.99 
 
 
635 aa  639    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18951  molecular chaperone DnaK  53.32 
 
 
634 aa  641    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21861  molecular chaperone DnaK  53.15 
 
 
630 aa  636    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.357564  normal  0.686332 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30041  molecular chaperone DnaK  53.32 
 
 
637 aa  636    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.417292 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0943  hypothetical protein  58.81 
 
 
621 aa  658    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0513981  normal  0.126736 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1322  molecular chaperone DnaK  59.6 
 
 
608 aa  708    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0260  molecular chaperone DnaK  54.91 
 
 
622 aa  667    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0242137  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>