More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0542 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0528  glycosyl transferase, group 1  99.51 
 
 
406 aa  825    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000105595  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0542  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
406 aa  829    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000128948  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0451  glycosyl transferase group 1  54.23 
 
 
406 aa  451  1.0000000000000001e-126  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.340856  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1821  glycosyl transferase, group 1  53.07 
 
 
403 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0709671  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1592  glycosyl transferase, group 1  52.24 
 
 
414 aa  428  1e-119  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0955331  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5908  glycosyl transferase group 1  43.81 
 
 
410 aa  367  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3082  glycosyl transferase, group 1  46.06 
 
 
474 aa  362  8e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2973  glycosyl transferase, group 1  45.57 
 
 
416 aa  353  2e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1718  glycosyl transferase group 1  45.34 
 
 
433 aa  352  7e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0594  glycosyl transferase, group 1  46.29 
 
 
401 aa  343  4e-93  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1359  glycosyl transferase, group 1  45.06 
 
 
402 aa  334  2e-90  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.254886 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0797  glycosyl transferase, group 1  45.09 
 
 
408 aa  333  3e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0419  glycosyl transferase group 1  42.71 
 
 
413 aa  325  7e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.102155  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2083  glycosyl transferase, group 1  42.18 
 
 
411 aa  318  1e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1740  glycosyl transferase group 1  42.18 
 
 
411 aa  318  1e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163685 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0129  glycosyl transferase, group 1  41.27 
 
 
397 aa  313  2.9999999999999996e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.730138  hitchhiker  0.000955625 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0297  glycosyl transferase group 1  41.01 
 
 
411 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2348  glycosyl transferase, group 1  42.25 
 
 
411 aa  306  4.0000000000000004e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0363579  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3111  trehalose phosphorylase/synthase  40.25 
 
 
420 aa  301  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3832  glycosyl transferase group 1  38.89 
 
 
417 aa  296  4e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672883  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1763  glycosyl transferase, group 1  39.15 
 
 
419 aa  296  6e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.410209  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1192  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 
410 aa  280  4e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1812  glycosyl transferase, group 1  39.65 
 
 
407 aa  276  7e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0100815  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2023  glycosyl transferase, group 1  38.35 
 
 
442 aa  268  1e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0427  glycosyl transferase group 1  37.72 
 
 
460 aa  264  2e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.049978  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1550  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 
398 aa  199  5e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.267317  hitchhiker  0.0000000000000568319 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4094  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 
509 aa  172  7.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108712  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3637  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 
497 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.564588 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04480  trehalose synthase, putative  30.83 
 
 
734 aa  134  3e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05021  trehalose synthase (Ccg-9), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12100)  25.56 
 
 
705 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  29.14 
 
 
396 aa  73.2  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.09 
 
 
381 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2121  glycosyl transferase, group 1  30.39 
 
 
372 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.430294  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2910  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
418 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.168216 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.09 
 
 
381 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.35 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  32.35 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  32.35 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.35 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  32.35 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.35 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.35 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 
500 aa  70.1  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3347  glycosyl transferase, group 1  31.31 
 
 
400 aa  69.3  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
419 aa  67.4  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  28.18 
 
 
370 aa  67.4  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.71 
 
 
407 aa  66.6  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  33.98 
 
 
381 aa  66.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 
377 aa  65.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 
821 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 
370 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
387 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 
381 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
374 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  30.37 
 
 
935 aa  64.3  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
412 aa  63.9  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 
378 aa  63.5  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 
411 aa  63.5  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0193  glycosyl transferase, group 1  31.4 
 
 
398 aa  63.2  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
374 aa  63.2  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 
361 aa  62.8  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4018  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 
381 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1041  glycosyl transferase, group 1  28.91 
 
 
420 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000238759  normal  0.0144782 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0209  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 
386 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  34.95 
 
 
387 aa  61.2  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  33.13 
 
 
405 aa  59.7  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  38.89 
 
 
391 aa  60.1  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2470  glycosyl transferase, group 1  35.78 
 
 
345 aa  59.7  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 
386 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.92 
 
 
396 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0229  glycosyl transferase, group 1  27.38 
 
 
386 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0736189  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  27.6 
 
 
384 aa  58.9  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  38.3 
 
 
812 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  27.6 
 
 
745 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.29 
 
 
365 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0211  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 
393 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
412 aa  58.9  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  22.92 
 
 
375 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 
420 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 
390 aa  58.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0219  glycosyl transferase, group 1  27.38 
 
 
360 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 
378 aa  58.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  27.98 
 
 
408 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 
377 aa  57.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
423 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2865  glycosyl transferase group 1  37.04 
 
 
347 aa  57.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2341  glycosyl transferase group 1  34.86 
 
 
345 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  24.62 
 
 
416 aa  57.4  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 
380 aa  57.4  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1379  glycosyl transferase, group 1  29.92 
 
 
417 aa  57  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865158  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
377 aa  57  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1540  glycosyl transferase, group 1  25.27 
 
 
414 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18890  glycosyltransferase  26.18 
 
 
486 aa  57  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  26.24 
 
 
388 aa  56.6  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 
387 aa  56.6  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0304  putative glycosyl transferase  27.27 
 
 
426 aa  56.6  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
382 aa  56.2  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
434 aa  56.6  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
376 aa  56.2  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 
360 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>