More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0531 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0517  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
113 aa  228  3e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000164694  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0531  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
113 aa  228  3e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00497558  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1164  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  65.49 
 
 
113 aa  153  9e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000155222  normal  0.138498 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1137  nitrogen regulatory protein P-II  69.03 
 
 
113 aa  152  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.201523 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1342  nitrogen regulatory protein P-II  65.49 
 
 
113 aa  150  5.9999999999999996e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000301067  unclonable  0.00000108063 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0972  nitrogen regulatory protein P-II  66.37 
 
 
113 aa  149  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123389  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0112  nitrogen regulatory protein P-II  59.29 
 
 
113 aa  135  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3050  nitrogen regulatory protein P-II  58.41 
 
 
113 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.59817  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3493  nitrogen regulatory protein P-II  57.55 
 
 
108 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  115  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0380  nitrogen regulatory protein P-II  53.98 
 
 
114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  114  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  55.36 
 
 
112 aa  114  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03437  hypothetical protein  55.36 
 
 
112 aa  114  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  51.79 
 
 
112 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2346  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  55.36 
 
 
112 aa  113  7.999999999999999e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.235899 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2043  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.242523  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0995  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.882952  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2733  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  111  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.122931 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
121 aa  111  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  111  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2530  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
119 aa  110  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.18925  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002572  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  110  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  110  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0193  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  110  9e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  110  9e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  53.57 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  51.79 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1499  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  50.89 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1130  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0163  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.814781 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0181  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153981  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0933  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0233  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  50 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1116  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  108  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  108  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  108  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0833  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2905  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0491  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0623  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000846933  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0650  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.367034  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  107  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  107  5e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3362  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0591  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3532  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  107  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3241  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  107  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
113 aa  107  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  107  7.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  50 
 
 
112 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308979  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  107  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0761  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 
112 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  106  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  107  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3772  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  107  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0979  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.594986 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3650  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.107893  hitchhiker  0.000239042 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0797  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.131267  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3708  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00803334  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  106  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3832  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00851971  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  51.79 
 
 
112 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  44.64 
 
 
112 aa  106  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0846  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  106  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  51.79 
 
 
112 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1861  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 
112 aa  106  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.751643 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0371  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  47.32 
 
 
112 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  48.21 
 
 
112 aa  106  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  50 
 
 
112 aa  106  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  105  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0451  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 
112 aa  105  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164177  normal  0.269933 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0086  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  48.21 
 
 
112 aa  105  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0840353  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  51.79 
 
 
112 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0156  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  106  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>