206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0520 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  100 
 
 		 296 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  99.66 
 
 		 296 aa  570  1e-161  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1602  auxin efflux carrier  47.59 
 
 		 293 aa  261  8.999999999999999e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1052  auxin efflux carrier  42.91 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.951846  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  29.69 
 
 		 301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  29.64 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  30.61 
 
 		 297 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  30.27 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  27.14 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  29.45 
 
 		 302 aa  89  8e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  25.98 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  26.19 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  24.74 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  28.53 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  25.24 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  24.74 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1589  Auxin Efflux Carrier  27.65 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436679 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1159  auxin efflux carrier  27.37 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  21.88 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  24.5 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  26.35 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  24.74 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  25.6 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0706  Auxin Efflux Carrier  24.84 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  26.28 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  22.84 
 
 		 305 aa  67  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  29.96 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  23.96 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  24.66 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  25.17 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  25.68 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  24.66 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  25 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0290  auxin efflux carrier  27.06 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392401  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  26.11 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  25.6 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  27.54 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  31.79 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  27.95 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  25.97 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  25.84 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  25.37 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  22.79 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  26.67 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  23.38 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  25.49 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  30.82 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  25.91 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  25.58 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  25.59 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_002978  WD0249  hypothetical protein  22.77 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.340267  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  30.51 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  26.98 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  25.58 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0205  auxin efflux carrier  23.75 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.773418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  39.51 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  23.17 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  20.98 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1882  Auxin Efflux Carrier  31.72 
 
 		 342 aa  57  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  23.89 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  29.17 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05181  AEC family transporter  24.66 
 
 		 307 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  26.95 
 
 		 361 aa  57  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  26.88 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  27.04 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  25.55 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  26.92 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  27.18 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  28.44 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  25.32 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  24.76 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2059  auxin efflux carrier  31.03 
 
 		 342 aa  55.8  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0611643  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  25.25 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  26.86 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  24.68 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  27.19 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  27.19 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  23.55 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  26.86 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  27.57 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  26.86 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  25.35 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  24.68 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0469  Auxin Efflux Carrier  25.17 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  29.8 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  24.92 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  27.65 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  29.46 
 
 		 312 aa  53.9  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  23.01 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  24.13 
 
 		 308 aa  53.9  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  27.56 
 
 		 318 aa  53.1  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  25.7 
 
 		 294 aa  53.1  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  26.62 
 
 		 306 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  23.88 
 
 		 316 aa  53.5  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  23.32 
 
 		 319 aa  53.1  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  24.89 
 
 		 324 aa  53.1  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  26.33 
 
 		 330 aa  52.8  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  24.03 
 
 		 318 aa  52.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>