More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0469 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  511  1e-144  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  98.42 
 
 
253 aa  504  9.999999999999999e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0985  hypothetical protein  76.68 
 
 
252 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1106  hypothetical protein  69.96 
 
 
252 aa  371  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0807  hypothetical protein  64.14 
 
 
251 aa  334  9e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1615  hypothetical protein  59.52 
 
 
249 aa  298  7e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  54.22 
 
 
247 aa  294  8e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  54.62 
 
 
247 aa  291  8e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  54.96 
 
 
246 aa  285  5e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  54.44 
 
 
250 aa  285  5.999999999999999e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  55.12 
 
 
249 aa  283  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  53.6 
 
 
248 aa  280  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  52.61 
 
 
247 aa  280  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  51.41 
 
 
247 aa  276  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  49.8 
 
 
247 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  51.41 
 
 
247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  53.2 
 
 
253 aa  272  3e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  50.62 
 
 
243 aa  272  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  49.4 
 
 
247 aa  273  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2399  protein of unknown function DUF28  56.05 
 
 
248 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42546  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1634  protein of unknown function DUF28  53.57 
 
 
252 aa  270  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  53.75 
 
 
248 aa  268  5e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  50.41 
 
 
246 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  52.42 
 
 
249 aa  267  1e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  53.91 
 
 
251 aa  267  2e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1219  protein of unknown function DUF28  52.19 
 
 
250 aa  258  5.0000000000000005e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  51.21 
 
 
246 aa  257  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  51.38 
 
 
250 aa  257  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  51.38 
 
 
250 aa  257  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2125  hypothetical protein  49.6 
 
 
248 aa  256  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  48.19 
 
 
250 aa  256  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0542  hypothetical protein  50.79 
 
 
250 aa  256  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  51.21 
 
 
246 aa  255  4e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  52.89 
 
 
240 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  52.5 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  51.01 
 
 
247 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  49.8 
 
 
248 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  49.61 
 
 
248 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  48.19 
 
 
250 aa  251  6e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  50.59 
 
 
248 aa  250  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2183  hypothetical protein  49 
 
 
250 aa  250  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0661  hypothetical protein  49.8 
 
 
248 aa  249  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135239  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2117  protein of unknown function DUF28  51.25 
 
 
247 aa  249  3e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.892674  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  51.23 
 
 
248 aa  248  6e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  48.33 
 
 
242 aa  248  7e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2075  hypothetical protein  51.03 
 
 
242 aa  247  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  47.2 
 
 
249 aa  247  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  48.19 
 
 
250 aa  248  1e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  47.39 
 
 
248 aa  246  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1151  hypothetical protein  47.79 
 
 
250 aa  246  3e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  49.6 
 
 
247 aa  246  3e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  47.79 
 
 
248 aa  245  4e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  49.79 
 
 
248 aa  245  4.9999999999999997e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3179  protein of unknown function DUF28  46.59 
 
 
250 aa  245  6e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  49.2 
 
 
250 aa  244  9e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  49.79 
 
 
250 aa  244  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3178  protein of unknown function DUF28  49.4 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.777297  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15040  conserved hypothetical protein TIGR01033  47.79 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.105495  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1435  hypothetical protein  48.57 
 
 
251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748903  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1210  protein of unknown function DUF28  49.37 
 
 
243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  48 
 
 
250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0816  hypothetical protein  47.93 
 
 
243 aa  242  5e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.177048  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0657  hypothetical protein  45.78 
 
 
250 aa  239  2e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0958  protein of unknown function DUF28  48.15 
 
 
252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1013  hypothetical protein  46.99 
 
 
248 aa  239  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166545  hitchhiker  0.000108366 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  50.6 
 
 
248 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0925  protein of unknown function DUF28  51.81 
 
 
250 aa  239  4e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.488101  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  47.39 
 
 
250 aa  238  5e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0025  hypothetical protein  50.21 
 
 
243 aa  238  5e-62  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  47.79 
 
 
248 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  50.2 
 
 
248 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  49.8 
 
 
243 aa  238  6.999999999999999e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3521  hypothetical protein  48.13 
 
 
239 aa  237  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0483995  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  47.79 
 
 
248 aa  237  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  45.97 
 
 
246 aa  237  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0444  hypothetical protein  51.79 
 
 
251 aa  236  2e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  47.79 
 
 
248 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  48.15 
 
 
246 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  48.15 
 
 
246 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  48.15 
 
 
246 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  48.15 
 
 
246 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  47.39 
 
 
248 aa  236  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  47.39 
 
 
248 aa  236  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  47.39 
 
 
248 aa  236  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0421  hypothetical protein  50.6 
 
 
251 aa  235  4e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2194  hypothetical protein  50 
 
 
244 aa  235  4e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00428385  normal  0.442442 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3201  hypothetical protein  49.41 
 
 
247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.044565 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  48.97 
 
 
247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2629  hypothetical protein  46.18 
 
 
251 aa  235  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  46.99 
 
 
248 aa  235  6e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0508  hypothetical protein  49.18 
 
 
246 aa  235  6e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1249  hypothetical protein  48.79 
 
 
247 aa  234  7e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1318  hypothetical protein  50.6 
 
 
250 aa  234  7e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0714247  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  48.56 
 
 
243 aa  234  7e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2108  protein of unknown function DUF28  45.78 
 
 
249 aa  234  8e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00811013  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1989  hypothetical protein  44.09 
 
 
252 aa  234  8e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0129309 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  47.54 
 
 
247 aa  234  8e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  46.59 
 
 
248 aa  234  8e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_386  hypothetical protein  51.39 
 
 
251 aa  234  8e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3853  protein of unknown function DUF28  48.15 
 
 
241 aa  234  9e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>