More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0460 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 174 aa  357  4e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  96.55 
 
 		 174 aa  349  1e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  55.29 
 
 		 176 aa  210  1e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  56.32 
 
 		 174 aa  206  2e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2831  isochorismatase hydrolase  42.29 
 
 		 176 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0248  isochorismatase hydrolase  38.76 
 
 		 185 aa  137  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  36.99 
 
 		 193 aa  120  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  37.42 
 
 		 199 aa  111  5e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  34.76 
 
 		 196 aa  105  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  36.21 
 
 		 172 aa  105  4e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  36.2 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  39.69 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  32.58 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  32.57 
 
 		 193 aa  99  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 		 186 aa  96.7  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 		 186 aa  96.7  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1085  amidase  32.42 
 
 		 181 aa  96.7  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  34.15 
 
 		 201 aa  96.3  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  35.37 
 
 		 201 aa  95.9  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  34.76 
 
 		 192 aa  95.5  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0871  isochorismatase hydrolase  33.91 
 
 		 178 aa  95.1  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.317325  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  34.44 
 
 		 198 aa  93.6  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 180 aa  92.8  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  33.53 
 
 		 188 aa  92  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  30.86 
 
 		 190 aa  91.3  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1242  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 184 aa  91.3  6e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303599 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3082  isochorismatase family protein  32.02 
 
 		 182 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000597737 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1454  isochorismatase family protein  30.34 
 
 		 184 aa  89.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0526786  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  29.14 
 
 		 192 aa  89.4  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2370  isochorismatase family protein  31.46 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108087  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2083  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 		 182 aa  89.4  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0890304  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  33.12 
 
 		 214 aa  89  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2041  pyrazinamidase  34.27 
 
 		 182 aa  88.6  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.228157  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2043  pyrazinamidase  34.27 
 
 		 182 aa  88.2  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00201028  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2285  isochorismatase family protein  34.27 
 
 		 182 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.21607e-26 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  29.71 
 
 		 192 aa  87.8  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2628  isochorismatase hydrolase  32.22 
 
 		 183 aa  87.8  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2288  isochorismatase family protein  31.46 
 
 		 182 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0832099  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5162  isochorismatase hydrolase  32.08 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1598  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  32.78 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0241286  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0156  isochorismatase hydrolase  30.17 
 
 		 182 aa  85.5  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2241  isochorismatase family protein  30.9 
 
 		 182 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025604  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1659  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 		 180 aa  84.7  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.262359  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0368  amidase  32.4 
 
 		 185 aa  85.1  5e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  28.9 
 
 		 202 aa  84  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  32.18 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1242  isochorismatase hydrolase  32.22 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1461  putative nicotinamidase/pyrazinamidase  32.94 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289367  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1537  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  34.15 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  34.76 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.02 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  32.02 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.02 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  32.02 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.02 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.02 
 
 		 213 aa  81.3  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  30.41 
 
 		 206 aa  80.9  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.46 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1404  nicotinamidase/pyrazinamidase  30.11 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.0281019 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1739  isochorismatase hydrolase  30.91 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00170664  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1963  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0190447  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1420  nicotinamidase/pyrazinamidase  30.11 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.750645  normal  0.465448 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1882  nicotinamidase/pyrazinamidase  30.11 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00013739  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2053  nicotinamidase/pyrazinamidase  30.11 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.143362 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  29.69 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  30.56 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.46 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1387  nicotinamidase/pyrazinamidase  30.11 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.073671  normal  0.495721 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.46 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  27.37 
 
 		 227 aa  77.8  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0958  isochorismatase hydrolase  32.78 
 
 		 194 aa  77.8  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  28.07 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl340  nicotinamidase/pyrazinamidase  30.67 
 
 		 163 aa  77  0.0000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.148128  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10680  nicotinamidase-like amidase  29.74 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107249  normal  0.953023 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2254  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  28.14 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0859  pyrazinamidase/nicotinamidase  30.94 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2621  Nicotinamidase  28.21 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363172  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2348  nicotinamidase/pyrazinamidase  28.98 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000299891  normal  0.0437872 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2093  nicotinamidase/pyrazinamidase  28.98 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0331374  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1984  nicotinamidase/pyrazinamidase  28.98 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169468  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3227  nicotinamidase  27.78 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1914  isochorismatase hydrolase  27.98 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.652638  normal  0.010767 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0804  isochorismatase hydrolase  29.02 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1355  isochorismatase hydrolase  31.17 
 
 		 195 aa  74.3  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46220  nicotinamidase  27.42 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.790768  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1029  nicotinamidase  28.18 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1717  isochorismatase hydrolase  28.89 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.74739 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  26.38 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  29.05 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  29.05 
 
 		 201 aa  72  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2374  isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 		 199 aa  72  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1744  nicotinamidase  28.48 
 
 		 216 aa  72  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5120  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 210 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0123  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1692  isochorismatase hydrolase  31.08 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0105025  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  26.5 
 
 		 203 aa  70.9  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>