248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0416 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 		 176 aa  353  7.999999999999999e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00178551  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0400  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 		 176 aa  353  7.999999999999999e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000263629  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0230  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.16 
 
 		 176 aa  267  4e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000355363  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.71 
 
 		 183 aa  258  5.0000000000000005e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0709  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.26 
 
 		 188 aa  248  3e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  68 
 
 		 177 aa  247  6e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.14 
 
 		 204 aa  247  6e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  68 
 
 		 182 aa  246  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.43 
 
 		 182 aa  244  3e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.43 
 
 		 187 aa  244  4.9999999999999997e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.57 
 
 		 181 aa  244  4.9999999999999997e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.09 
 
 		 178 aa  242  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  63.43 
 
 		 180 aa  241  3e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.79 
 
 		 183 aa  241  3.9999999999999997e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.57 
 
 		 181 aa  238  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.95 
 
 		 184 aa  238  4e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1226  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.29 
 
 		 176 aa  237  5e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0176208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3797  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.18 
 
 		 176 aa  237  5.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0829  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.14 
 
 		 178 aa  237  8e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000238243  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.29 
 
 		 179 aa  236  9e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0114  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.59 
 
 		 176 aa  236  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.25 
 
 		 172 aa  235  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3713  ATP-dependent protease peptidase subunit  64 
 
 		 176 aa  235  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1210  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 		 178 aa  234  6e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.05 
 
 		 176 aa  233  7e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4103  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.25 
 
 		 174 aa  233  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.25 
 
 		 174 aa  233  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.08 
 
 		 174 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.25 
 
 		 174 aa  233  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4792  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.25 
 
 		 176 aa  233  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1981  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 		 176 aa  232  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0166  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.25 
 
 		 176 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.25 
 
 		 174 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0375  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.08 
 
 		 174 aa  231  5e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3781  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.5 
 
 		 174 aa  230  9e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171501  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03817  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 		 176 aa  229  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4053  20S proteasome A and B subunits  66.67 
 
 		 176 aa  229  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4414  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 		 176 aa  229  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0890704  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03766  hypothetical protein  66.67 
 
 		 176 aa  229  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2991  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.41 
 
 		 181 aa  229  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4164  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 		 176 aa  229  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4086  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 		 176 aa  229  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4041  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.25 
 
 		 176 aa  229  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03517  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.27 
 
 		 174 aa  228  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.839153  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4468  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 		 176 aa  229  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4374  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 		 176 aa  229  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.712688 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5389  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 		 176 aa  229  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.48 
 
 		 194 aa  228  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.41 
 
 		 193 aa  228  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.84 
 
 		 181 aa  228  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0180  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 		 176 aa  228  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.28 
 
 		 175 aa  228  3e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1459  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.28 
 
 		 181 aa  228  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1642  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.99 
 
 		 177 aa  228  4e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.29 
 
 		 179 aa  228  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1323  20S proteasome A and B subunits  65.9 
 
 		 179 aa  227  7e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1029  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.28 
 
 		 174 aa  226  9e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000258699  unclonable  0.0000000048858 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4308  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.08 
 
 		 176 aa  226  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4492  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.08 
 
 		 176 aa  226  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4424  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.08 
 
 		 176 aa  226  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4422  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.08 
 
 		 176 aa  226  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4338  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.08 
 
 		 176 aa  226  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3764  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.33 
 
 		 174 aa  226  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000856229  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2248  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.5 
 
 		 185 aa  226  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.43 
 
 		 178 aa  225  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0485  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 		 185 aa  224  4e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182784 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2541  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.01 
 
 		 188 aa  224  5.0000000000000005e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.85 
 
 		 178 aa  223  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0167  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.16 
 
 		 178 aa  223  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2545  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.43 
 
 		 196 aa  223  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0531  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.74 
 
 		 174 aa  222  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00786303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.82 
 
 		 183 aa  221  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4429  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.16 
 
 		 174 aa  221  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2482  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.89 
 
 		 180 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000211786  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0149  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.63 
 
 		 186 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0131  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.58 
 
 		 178 aa  221  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0440313 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0004  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.5 
 
 		 184 aa  221  4.9999999999999996e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1997  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.32 
 
 		 180 aa  221  6e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1099  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 		 182 aa  220  8e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0303  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.47 
 
 		 190 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3384  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.58 
 
 		 178 aa  218  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0989  20S proteasome A and B subunits  61.05 
 
 		 176 aa  218  3e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5054  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.45 
 
 		 187 aa  218  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0043  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.43 
 
 		 178 aa  218  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.47 
 
 		 184 aa  218  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2720  20S proteasome A and B subunits  59.77 
 
 		 179 aa  218  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00724  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.5 
 
 		 183 aa  218  3.9999999999999997e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3653  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.32 
 
 		 180 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00119552  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0600  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.82 
 
 		 172 aa  218  3.9999999999999997e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.059342  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5464  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.77 
 
 		 176 aa  217  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3707  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.01 
 
 		 178 aa  218  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1105  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.55 
 
 		 180 aa  218  5e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000745772  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3254  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 		 178 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.13325  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0386  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 		 178 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3492  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.2 
 
 		 182 aa  216  8.999999999999998e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2916  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 		 178 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0771725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2173  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 		 178 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0191  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 		 178 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.834819  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0201  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 		 178 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3432  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 		 178 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>