130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0394 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0394  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 412 aa  822    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1421  ABC-2 type transporter  35.41 
 
 		 415 aa  248  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1565  ABC-2 type transporter  31.5 
 
 		 433 aa  192  9e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000580039  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1173  ABC-2 type transporter  24.81 
 
 		 437 aa  77.4  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4844  ABC-2 type transporter  25.95 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0341  ABC-2 type transporter  25.59 
 
 		 394 aa  62.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1063  ABC-2 type transporter  25.21 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0364  ABC-2 type transporter  24.93 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1562  ABC-2 type transporter  20.62 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.986622  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0226  ABC-2 type transporter  22.5 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  23.94 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  23.94 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  23.94 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  23.94 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  23.94 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  24 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  22.17 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1131  ABC-2 type transporter  22.44 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.315475  hitchhiker  0.00237195 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3327  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like  26.12 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.63317  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  21.47 
 
 		 369 aa  56.2  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  22.53 
 
 		 370 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  24 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  24 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  24 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  24 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  24 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03077  putative ABC-type Na+ efflux pump, permease component  25.06 
 
 		 398 aa  55.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  24 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  21.66 
 
 		 368 aa  54.7  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1321  ABC-2 type transporter  21.53 
 
 		 365 aa  54.7  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.800168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  23.62 
 
 		 390 aa  55.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  22.75 
 
 		 366 aa  54.3  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  23.51 
 
 		 368 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  21.66 
 
 		 378 aa  53.9  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  23.64 
 
 		 368 aa  53.9  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  22.25 
 
 		 368 aa  53.9  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1431  hypothetical protein  22.6 
 
 		 371 aa  53.1  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2944  ABC-2 type transporter  23.89 
 
 		 391 aa  53.1  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.308426  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  24.09 
 
 		 378 aa  53.1  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  24.18 
 
 		 369 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  21.11 
 
 		 371 aa  52.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9218  ABC transporter  24.53 
 
 		 374 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.797463  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1519  ABC-2 type transporter  23.56 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  23.53 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1420  hypothetical protein  25.27 
 
 		 387 aa  52.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  22.07 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1529  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  22.16 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.508402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  21.97 
 
 		 371 aa  51.2  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  22.67 
 
 		 387 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0750  ABC-2 type transporter  24.55 
 
 		 375 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0601  putative ABC-2 type transport system permease protein  24.91 
 
 		 347 aa  50.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  20.8 
 
 		 371 aa  50.4  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  25.09 
 
 		 379 aa  50.4  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  21.99 
 
 		 381 aa  50.4  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  21.82 
 
 		 371 aa  50.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2422  ABC-2 type transporter  25.34 
 
 		 379 aa  50.1  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108502  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.9 
 
 		 384 aa  50.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  22.78 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00132  putative ABC transport protein  24.39 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3040  hypothetical protein  24.02 
 
 		 371 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1613  ABC-2 type transporter  21.02 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4173  putative ABC transporter  25.93 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00590  ABC-2 type transport system hypothetical protein  26.67 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0115211  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1327  ABC-2 type transporter  22.56 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  25.35 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3157  ABC transporter, inner membrane subunit  24.55 
 
 		 374 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00527406  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  23.29 
 
 		 356 aa  47.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  24.22 
 
 		 374 aa  47.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  25.37 
 
 		 384 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1478  ABC-2 type transporter  27.49 
 
 		 375 aa  47.4  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  22.04 
 
 		 375 aa  47.4  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0566  ABC-2 type transporter  23.85 
 
 		 399 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0501  ABC-2 type transporter  23.85 
 
 		 399 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  23.78 
 
 		 377 aa  47.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  25.22 
 
 		 775 aa  47  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1676  ABC-2 type transporter  25.45 
 
 		 413 aa  47  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1284  ABC-2 type transporter  22.44 
 
 		 377 aa  47  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5303  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  23.86 
 
 		 385 aa  47  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664808 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1790  putative sodium ABC transporter permease protein  26.54 
 
 		 395 aa  47  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  23.49 
 
 		 369 aa  46.6  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3895  ABC-2 type transporter  24.55 
 
 		 374 aa  47  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.505485  normal  0.0804287 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02800  ABC transporter sodium permease  27.16 
 
 		 397 aa  46.6  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  23.22 
 
 		 372 aa  46.6  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29670  ABC-type multidrug transport system, permease component  22.97 
 
 		 396 aa  46.6  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  24.16 
 
 		 378 aa  46.6  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  26.96 
 
 		 405 aa  45.8  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  20 
 
 		 382 aa  46.2  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  21.86 
 
 		 382 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1910  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  22.69 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170149  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  25.65 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2943  ABC-2 type transporter  20.57 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  24.18 
 
 		 366 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  25.61 
 
 		 370 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  21.21 
 
 		 367 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1500  ABC transporter sodium permease  24.4 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809114  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1445  ABC transporter sodium permease  24.4 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.757965  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  20.97 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.344098 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>