More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0357 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0339  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  95.83 
 
 
419 aa  791  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0357  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  100 
 
 
414 aa  830  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.173835  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0158  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.81 
 
 
457 aa  248  1e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0865096  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0207  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.19 
 
 
423 aa  242  8e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.716943  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0086  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.49 
 
 
470 aa  198  1e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0093  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.07 
 
 
457 aa  194  3e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  1.67197e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0640  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.33 
 
 
456 aa  190  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.180708  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00560  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.16 
 
 
468 aa  188  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0427403  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0996  cell cycle protein  31.26 
 
 
458 aa  183  5e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.44135e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0125  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.37 
 
 
472 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0094  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.05 
 
 
454 aa  177  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.59 
 
 
476 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2474  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.36 
 
 
469 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2788  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.13 
 
 
469 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0228  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.89 
 
 
473 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0104  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  30.37 
 
 
455 aa  166  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0872  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.61 
 
 
311 aa  166  8e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.203605  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.65 
 
 
471 aa  164  2e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0862311  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0062  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.54 
 
 
462 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0340332  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2248  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.37 
 
 
485 aa  160  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  7.93902e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2640  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.21 
 
 
457 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0791  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.9 
 
 
458 aa  159  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  3.25177e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0068  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.21 
 
 
480 aa  156  7e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.552857  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0083  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.95 
 
 
481 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.24629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0071  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.8 
 
 
476 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.84 
 
 
476 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0058  cell cycle protein  28.8 
 
 
476 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0062  hypothetical protein  28.8 
 
 
476 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223025  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0074  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.8 
 
 
476 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0125987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0062  hypothetical protein  28.8 
 
 
476 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0061  hypothetical protein  28.57 
 
 
476 aa  154  3e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.625972  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1556  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.37 
 
 
306 aa  154  3e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.03 
 
 
464 aa  154  3e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0058  cell cycle protein  28.57 
 
 
476 aa  153  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0622  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.95 
 
 
456 aa  153  5e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.336141  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1229  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.59 
 
 
476 aa  153  6e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1421  PP-loop family protein  26.67 
 
 
470 aa  152  7e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5217  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.47 
 
 
444 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1594  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.67 
 
 
457 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0869  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.47 
 
 
455 aa  152  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2735  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.07 
 
 
459 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  9.20326e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2255  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.86 
 
 
470 aa  149  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.64425e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2046  hypothetical protein  37.44 
 
 
454 aa  149  7e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.39704e-06 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1810  cell cycle protein MesJ, putative  36.17 
 
 
471 aa  149  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0106411  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1891  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  28.3 
 
 
468 aa  149  1e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.60009e-09  hitchhiker  6.38883e-11 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0144  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.63 
 
 
472 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.75887e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1746  MesJ protein  37.93 
 
 
354 aa  147  4e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3018  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.33 
 
 
450 aa  147  5e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0494  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.95 
 
 
465 aa  143  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0626  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.46 
 
 
325 aa  143  6e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0544  hypothetical protein  25.92 
 
 
431 aa  141  2e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000216418  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0531  hypothetical protein  25.92 
 
 
431 aa  141  2e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00156827  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0850  hypothetical protein  27.6 
 
 
431 aa  140  4e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0704  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.93 
 
 
328 aa  139  7e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2138  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.38 
 
 
436 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.87877  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3762  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.54 
 
 
445 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0801202  hitchhiker  0.00083153 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0079  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.45 
 
 
509 aa  138  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1551  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.84 
 
 
241 aa  137  3e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  7.25449e-11 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0139  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.38 
 
 
492 aa  137  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00237598  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0825  hypothetical protein  27.36 
 
 
431 aa  137  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0062  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  36.07 
 
 
464 aa  136  6e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1004  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.74 
 
 
521 aa  134  2e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.925519  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0598  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.71 
 
 
334 aa  134  2e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.070597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.21 
 
 
446 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.615384  normal  0.623923 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0865  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  26.35 
 
 
676 aa  134  4e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000888188 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0846  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.26 
 
 
469 aa  133  5e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00012547  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0198  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.61 
 
 
475 aa  132  9e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.723741  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1752  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.07 
 
 
334 aa  132  1e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.927815  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1198  hypothetical protein  24.82 
 
 
454 aa  132  2e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0013516 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1203  PP-loop  24.83 
 
 
476 aa  131  3e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5246  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.41 
 
 
476 aa  131  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.320432  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0579  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.89 
 
 
325 aa  130  4e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.391449  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1051  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  24.52 
 
 
442 aa  130  5e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0964  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.64 
 
 
461 aa  130  5e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0070  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.41 
 
 
476 aa  130  5e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1609  MesJ protein  35.9 
 
 
332 aa  129  1e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0321  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  25.22 
 
 
682 aa  127  4e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2027  ketose-bisphosphate aldolase, class-II  34.95 
 
 
357 aa  127  4e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.481135  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2624  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.9 
 
 
442 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1618  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.25 
 
 
524 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0950801 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0294  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.89 
 
 
433 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.212762 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1341  hypothetical protein  36.84 
 
 
460 aa  124  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.181704  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1467  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.53 
 
 
338 aa  124  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0235653 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0631  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.93 
 
 
397 aa  124  4e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1834  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.94 
 
 
440 aa  124  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1249  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  26.04 
 
 
425 aa  122  1e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2410  tRNA(Ile)-lysidine synthase  26.54 
 
 
443 aa  122  1e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0016  tRNA(Ile)-lysidine synthetase, MesJ  25.37 
 
 
422 aa  122  1e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0402  tRNA(Ile)-lysidine synthetase, MesJ  35.23 
 
 
430 aa  122  2e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0260657  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0012  putative cell-cycle protein, MesJ/Ycf62 family  26.67 
 
 
421 aa  121  2e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1289  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.97 
 
 
436 aa  121  2e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.7067 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0266  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.67 
 
 
464 aa  121  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0957  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.99 
 
 
377 aa  121  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0148  MesJ/Ycf62 family protein  26.97 
 
 
432 aa  120  6e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3027  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.72 
 
 
486 aa  119  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00722625  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1572  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.49 
 
 
462 aa  119  1e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0541  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.84 
 
 
336 aa  119  1e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.41194  normal  0.862893 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2521  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26 
 
 
476 aa  118  2e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  3.32242e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0475  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  24.88 
 
 
449 aa  117  3e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1692  tRNA(Ile)-lysidine synthase  24.88 
 
 
449 aa  117  3e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>