More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0356 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.14 
 
 
630 aa  697    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
610 aa  1233    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  52.93 
 
 
614 aa  652    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.26 
 
 
611 aa  667    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.49 
 
 
612 aa  641    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.66 
 
 
612 aa  642    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.29 
 
 
630 aa  653    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.56 
 
 
639 aa  691    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  70.1 
 
 
617 aa  881    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.62 
 
 
608 aa  638    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  56.45 
 
 
616 aa  674    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.99 
 
 
614 aa  861    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  52.02 
 
 
608 aa  641    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  54.55 
 
 
665 aa  642    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.69 
 
 
635 aa  635    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  54.77 
 
 
645 aa  638    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.42 
 
 
615 aa  675    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.45 
 
 
607 aa  668    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0873  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.89 
 
 
645 aa  704    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0168176  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.26 
 
 
620 aa  655    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  54.23 
 
 
627 aa  650    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.22 
 
 
602 aa  645    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.26 
 
 
676 aa  636    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  99.18 
 
 
610 aa  1227    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.11 
 
 
671 aa  644    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0453  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.75 
 
 
653 aa  670    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  55.32 
 
 
654 aa  639    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.77 
 
 
656 aa  636    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.55 
 
 
630 aa  671    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000142168  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  54.49 
 
 
682 aa  633  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.51 
 
 
672 aa  631  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.97 
 
 
639 aa  633  1e-180  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.3 
 
 
632 aa  634  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.76 
 
 
637 aa  633  1e-180  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.33 
 
 
621 aa  634  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.15 
 
 
643 aa  630  1e-179  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  56.38 
 
 
656 aa  630  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52 
 
 
653 aa  628  1e-179  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.37 
 
 
599 aa  630  1e-179  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.01 
 
 
673 aa  628  1e-179  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  51.49 
 
 
681 aa  627  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.5 
 
 
645 aa  627  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.02 
 
 
652 aa  626  1e-178  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  52.72 
 
 
633 aa  622  1e-177  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  52.72 
 
 
633 aa  622  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  52.72 
 
 
633 aa  622  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  52.72 
 
 
633 aa  622  1e-177  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  52.72 
 
 
633 aa  622  1e-177  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  52.72 
 
 
633 aa  622  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  52.72 
 
 
633 aa  622  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.81 
 
 
633 aa  622  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.23 
 
 
636 aa  621  1e-177  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  52.72 
 
 
633 aa  622  1e-177  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.61 
 
 
648 aa  619  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  52.64 
 
 
633 aa  620  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.62 
 
 
640 aa  620  1e-176  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.64 
 
 
601 aa  620  1e-176  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.48 
 
 
601 aa  620  1e-176  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.66 
 
 
647 aa  620  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0642  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.27 
 
 
616 aa  617  1e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.5 
 
 
634 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.79 
 
 
679 aa  617  1e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.91 
 
 
617 aa  617  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.17 
 
 
657 aa  616  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.74 
 
 
685 aa  615  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.259213 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  51.16 
 
 
700 aa  613  9.999999999999999e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  52.17 
 
 
638 aa  615  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.93 
 
 
635 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  51.83 
 
 
635 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  55.48 
 
 
753 aa  612  9.999999999999999e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.61 
 
 
697 aa  612  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  50.75 
 
 
764 aa  612  9.999999999999999e-175  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.24 
 
 
651 aa  613  9.999999999999999e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.07 
 
 
645 aa  613  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.83 
 
 
635 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51 
 
 
637 aa  612  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.92 
 
 
643 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.61 
 
 
697 aa  612  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52 
 
 
640 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.52 
 
 
672 aa  609  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2460  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.67 
 
 
635 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  52.27 
 
 
649 aa  608  1e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1506  ATP-dependent metallopeptidase HflB  52.48 
 
 
647 aa  611  1e-173  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  51.24 
 
 
637 aa  610  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1207  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.28 
 
 
643 aa  610  1e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390556  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1440  cell division protein  52.31 
 
 
650 aa  608  1e-173  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42890  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.58 
 
 
637 aa  608  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.9 
 
 
651 aa  606  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0714  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.41 
 
 
634 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.87442  normal  0.0617842 
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  52.1 
 
 
644 aa  606  9.999999999999999e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.42 
 
 
630 aa  608  9.999999999999999e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  53.79 
 
 
640 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.99 
 
 
642 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.53 
 
 
638 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3615  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.25 
 
 
640 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0280177  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.73 
 
 
638 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1770  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.25 
 
 
651 aa  606  9.999999999999999e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.292571  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  50.08 
 
 
612 aa  607  9.999999999999999e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.39 
 
 
753 aa  607  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0426  FtsH peptidase  51.58 
 
 
652 aa  605  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.405966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>