More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0344 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  100 
 
 		 242 aa  490  9.999999999999999e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  97.11 
 
 		 242 aa  476  1e-133  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  69.33 
 
 		 252 aa  331  5e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  69.46 
 
 		 240 aa  321  6e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  59.67 
 
 		 244 aa  316  2e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  63.9 
 
 		 244 aa  313  9.999999999999999e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  63.22 
 
 		 242 aa  310  1e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  58.75 
 
 		 245 aa  309  2.9999999999999997e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  59.58 
 
 		 245 aa  308  6.999999999999999e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.08 
 
 		 240 aa  307  9e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  58.09 
 
 		 246 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  61.16 
 
 		 244 aa  306  1.0000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  61.86 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  64.41 
 
 		 243 aa  305  3e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  62.08 
 
 		 240 aa  305  5.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  60.67 
 
 		 253 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  60.42 
 
 		 249 aa  303  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  63.98 
 
 		 243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  58.68 
 
 		 251 aa  303  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  58.75 
 
 		 246 aa  302  3.0000000000000004e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  63.98 
 
 		 243 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  63.07 
 
 		 242 aa  301  6.000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  62.5 
 
 		 240 aa  301  6.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  60.83 
 
 		 241 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  60.42 
 
 		 241 aa  300  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  58.51 
 
 		 253 aa  300  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  60.42 
 
 		 241 aa  300  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  60.5 
 
 		 256 aa  300  2e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  59.92 
 
 		 273 aa  299  3e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  58.09 
 
 		 252 aa  298  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  61 
 
 		 244 aa  298  7e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  60 
 
 		 240 aa  298  7e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  61.02 
 
 		 242 aa  298  8e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  59.17 
 
 		 240 aa  296  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  59.58 
 
 		 253 aa  297  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2506  ABC transporter  59.11 
 
 		 261 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0247071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  59.58 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  60.08 
 
 		 246 aa  296  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  60 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  60 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.58 
 
 		 253 aa  295  3e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3089  ABC transporter-like  58.94 
 
 		 265 aa  295  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  60.34 
 
 		 241 aa  296  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  60 
 
 		 240 aa  295  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  57.68 
 
 		 265 aa  295  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  59.58 
 
 		 241 aa  295  4e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  59.58 
 
 		 241 aa  295  4e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  58.26 
 
 		 242 aa  295  4e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.58 
 
 		 241 aa  295  5e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  56.38 
 
 		 256 aa  295  5e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  60.08 
 
 		 256 aa  295  5e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  61.92 
 
 		 257 aa  295  5e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.58 
 
 		 240 aa  295  6e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.75 
 
 		 240 aa  295  6e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.58 
 
 		 240 aa  295  6e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.58 
 
 		 240 aa  295  6e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  58.75 
 
 		 244 aa  295  6e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.58 
 
 		 240 aa  295  6e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2778  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.7 
 
 		 263 aa  294  7e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.217633  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.58 
 
 		 240 aa  294  7e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.58 
 
 		 240 aa  294  7e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  58.9 
 
 		 259 aa  294  8e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  59.58 
 
 		 240 aa  294  8e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  58.75 
 
 		 253 aa  294  9e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  59.58 
 
 		 240 aa  294  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  59.58 
 
 		 240 aa  294  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.92 
 
 		 252 aa  294  1e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.58 
 
 		 240 aa  294  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  59.17 
 
 		 241 aa  293  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  59.58 
 
 		 241 aa  293  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  58.92 
 
 		 252 aa  294  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  60 
 
 		 244 aa  293  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 		 240 aa  294  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  60 
 
 		 257 aa  293  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.5 
 
 		 269 aa  293  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  59.17 
 
 		 253 aa  293  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  57.79 
 
 		 248 aa  293  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.16 
 
 		 284 aa  293  2e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  58.33 
 
 		 253 aa  292  3e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  58.13 
 
 		 260 aa  292  3e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  60.25 
 
 		 239 aa  291  4e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  57.5 
 
 		 249 aa  291  5e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.5 
 
 		 251 aa  291  5e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  57.5 
 
 		 249 aa  291  5e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  60.34 
 
 		 240 aa  291  5e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  59.09 
 
 		 242 aa  291  6e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  55.37 
 
 		 255 aa  291  7e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  60.42 
 
 		 241 aa  291  7e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  59.36 
 
 		 263 aa  291  7e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  59.83 
 
 		 249 aa  291  7e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  57.92 
 
 		 240 aa  291  7e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.33 
 
 		 240 aa  291  8e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 		 240 aa  291  8e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.33 
 
 		 240 aa  291  8e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 		 240 aa  291  8e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  56.67 
 
 		 247 aa  290  9e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  56.61 
 
 		 242 aa  291  9e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  58.09 
 
 		 252 aa  290  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 		 240 aa  290  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 		 240 aa  290  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>